| New junction evidence | |||||||||||
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TGCCTGACCGACTTGCCGTCGCAGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > NC_002947/2473918‑2474174 | ggccggggaacggctgtggaatggtgccgggctgggacaggtgttttttgatgaacaggggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttaca > 1:2458544‑M1/150‑150 (MQ=255) ccggggaacggctgtggaatggtgccgggctgggactggtgttttttgatgaacaggggcggccggcgcgggtgtaccagctggatgctggcgggggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGc > 2:1054890‑M1/148‑150 (MQ=255) ccTGACCGACTTGCCGTCGCAGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGC < 2:1841369‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGACCGACTTGCCGTCGCAGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCC < 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cAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCaa < 1:5015136/116‑1 (MQ=255) cAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcggg > 1:5226064‑M2/1‑139 (MQ=255) aaCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATTCGCTGTAGCGTAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGTCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACacctgattgggggtggacacacattggtgtttgggcgcaggccgtcgtaggagcgggt < 1:4156171‑M1/150‑59 (MQ=255) ggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCggg > 2:1946891‑M1/53‑148 (MQ=255) ggtgaggctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCggg < 1:1946891‑M1/96‑1 (MQ=255) aCCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtt > 2:4149274‑M2/1‑137 (MQ=255) ccGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggttt > 1:3676703‑M2/1‑136 (MQ=255) ccGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggttt > 1:3676614‑M2/1‑136 (MQ=255) ctacagagtttaaaaaccgggcgtagtgagattcagagtttttacAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 1:3508016‑M1/46‑150 (MQ=255) aGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgc > 2:817458‑M2/1‑130 (MQ=255) cTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:3723690‑M2/1‑127 (MQ=255) tGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCa < 1:5203723/80‑1 (MQ=255) tGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCa > 2:5203723/1‑80 (MQ=255) | TGCCTGACCGACTTGCCGTCGCAGGACCAGAATGAAGATGTGGTGCGCTCCAAGGTGCTGGAGGCGCACAAGATCCTCATGGGCCTGAATGACTCCAACCGCGAAGCCTTCCATGATCTGGTCAATGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > NC_002947/2473918‑2474174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |