| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4161047 | 103 (0.630) | 29 (0.200) | 11/242 | NT | 22.8% | intergenic (+29/‑180) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 4161109 | 103 (0.690) | intergenic (+91/‑118) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
CCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAA > NC_002947/4160898‑4161196 | gacggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCGC‑GGGt > 1:5393834‑M1/138‑150 (MQ=255)gacggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCGC‑GGGt > 2:3887630‑M1/138‑150 (MQ=255)ccGCTTCAGCCAGATTCACCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGT > 1:4043238‑M1/1‑150 (MQ=255) cggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCGC‑Gggttc > 2:2297406‑M1/136‑148 (MQ=255) cTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTaaa < 1:4485738/150‑1 (MQ=255) ttCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAAc < 2:5208325/150‑1 (MQ=255) gCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGc < 2:1463105/150‑1 (MQ=255) ccAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGc > 1:5228437/1‑149 (MQ=255) ccAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGc < 2:5228437/149‑1 (MQ=255) aGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGTGGTTGGG‑GGGTttaaccgctcc > 2:3748392‑M1/1‑139 (MQ=255) aTTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTa < 1:2956681/150‑1 (MQ=255) aTTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTa < 2:1029979/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGGGTCGCGGGGTAAAccccgcccac > 1:1745915/1‑143 (MQ=255) gCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAgg > 2:193620/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAAACCGCGCCTACAgg > 2:3125809/1‑150 (MQ=255) aGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggtgg < 1:60559/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggtggg < 1:740948/150‑1 (MQ=255) tGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGtgc < 1:1618591/150‑1 (MQ=255) ccACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGcc < 1:4251492/150‑1 (MQ=255) ccACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGcc < 1:122075/150‑1 (MQ=255) cACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGccc < 2:2839733/150‑1 (MQ=255) cACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGccc < 1:2247651/150‑1 (MQ=255) cACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGccc < 2:4043238/150‑1 (MQ=255) aCGGGCGCTTGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTTTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGTTTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTATACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCt < 2:1552180/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTaaacccgctcctacaggggccttgccgtctt < 2:4189960‑M1/150‑32 (MQ=255) cGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTg < 1:698137/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGATGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGa < 1:2964549/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGATGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGaa < 2:370871/150‑1 (MQ=255) ggTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTaaacccgatcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccac < 2:2099922‑M1/150‑47 (MQ=255) ggTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGccc < 1:3205712/150‑1 (MQ=255) ggTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGccc < 2:438960/150‑1 (MQ=255) gTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGAGTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGcccc < 1:4640194/150‑1 (MQ=255) tGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCt < 1:1892065/150‑1 (MQ=255) cGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCGGCGGCGC‑GGGTGAAACCCCACCAACAGGTGGGTGGTGGCCGGAATACGGCAAGGCCCCGGt > 2:145219/1‑150 (MQ=255) ggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa > 2:1364475‑M1/87‑150 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTaaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgta < 2:3410386‑M1/150‑52 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa < 1:3134245/150‑1 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa > 2:5369119/1‑150 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa < 1:2836320/150‑1 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGCCTGCTTCGC‑GGGTgaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgta < 1:1067169‑M1/150‑52 (MQ=255) aTCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAg < 1:5369119/150‑1 (MQ=255) ccTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggtgg < 2:2353181/116‑1 (MQ=255) aaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGa > 2:815010‑M1/84‑150 (MQ=255) catccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg > 1:4575473‑M1/80‑150 (MQ=255) caCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg < 2:4998516/149‑1 (MQ=255) aaCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTgaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgg < 1:2857278‑M1/150‑59 (MQ=255) aaCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAAccc < 2:2540108/98‑1 (MQ=255) aaCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGtgctg < 2:1132966/118‑1 (MQ=255) aaCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg < 1:1333541/150‑1 (MQ=255) aaCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg < 1:2080072/150‑1 (MQ=255) aaCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg < 2:4068543/150‑1 (MQ=255) aCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGGGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGTCTGGAGACCGTGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCggg < 1:2475191/150‑1 (MQ=255) aCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTaaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcggg < 1:4288238‑M1/150‑60 (MQ=255) ccTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTg < 1:4807224/121‑1 (MQ=255) ccTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTg > 2:4807224/1‑121 (MQ=255) cTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGtt < 2:1809324/150‑1 (MQ=255) ttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg < 1:4438132‑M1/71‑1 (MQ=255) ttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg > 2:4438132‑M1/75‑145 (MQ=255) gtgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGTTGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCa > 1:3053587‑M2/1‑149 (MQ=255) gtgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCa > 1:323867‑M2/1‑149 (MQ=255) tgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGTGCGGGGC‑GGGTGAAACCCCACCAACAGCGGGGTGGGGGCCCGGAGACCGCAAGGCCCCCGGGGGGGCggggtgac > 2:560596/1‑145 (MQ=255) tgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa > 1:509533/1‑137 (MQ=255) tgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTa < 2:509533/137‑1 (MQ=255) ggCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGCCTGCTTCGC‑GGGTgaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacc < 1:1503225‑M1/150‑66 (MQ=255) tttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctggCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAc > 2:704609‑M1/72‑148 (MQ=255) gCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTgaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttaccc < 1:4243197‑M1/150‑67 (MQ=255) gCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTgaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttaccc < 1:118517‑M1/150‑67 (MQ=255) tGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTaaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtagg < 1:3620719‑M1/135‑54 (MQ=255) tGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTaaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtagg > 2:3620719‑M1/1‑82 (MQ=255) tGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCacccgc > 2:1609690‑M2/1‑144 (MQ=255) ttGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaa > 2:1189408‑M2/1‑141 (MQ=255) ccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCCGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgc > 1:2537883‑M1/65‑150 (MQ=255) gCGATTACCCTGTGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGTTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGt < 2:3663220/150‑1 (MQ=255) gATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTAGC‑GGGTAAACCCCCTCCAACAGGTGGGTGCTGCCCAGAAGACGGCAAGGCCCCAGTAGGTGCGGGTTCAACCGCCAAGCAGGCAGCGCGGtgt > 2:379287/1‑148 (MQ=255) ttACCCTGGGGGTGCAGACGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCAC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCa < 1:2361747/150‑1 (MQ=255) gtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagtcggCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTCCAGGTGGGTGCTGCCCTGCAGACGGCACGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCaa > 1:867300‑M1/48‑150 (MQ=255) ggggTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGttttt < 2:4560141/150‑1 (MQ=255) atgCTGTTGGGCTGACTGGCGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGCCGGCACGGCCCCTTTTGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGG‑TTTTCACAGccccc < 1:55398/148‑1 (MQ=38) aaGGTGTTGGGCTGCCTGGAGCCCGAGTCGGCTGCTTCGG‑GGTTAAACCCGCTCCTACCGGTGGGTGCGGCCCTGAAGACGGCCAGGCCCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGcccc < 1:1086384/150‑1 (MQ=255) tGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGtt < 2:669713/150‑1 (MQ=255) cTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGTTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCg < 1:3677821/150‑1 (MQ=255) tGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGt < 2:4183850/150‑1 (MQ=255) gACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTc < 2:4346380/150‑1 (MQ=255) cTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCca < 1:3554371/150‑1 (MQ=255) aCCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCaa > 2:2912224/1‑64 (MQ=255) gTCGGCTGCTTCGC‑GGTTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGt < 1:1595593/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtg > 2:574491/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtg > 2:4931903/1‑150 (MQ=255) gctgctTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACCGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtgg < 1:379287/150‑1 (MQ=255) ctgctTCGC‑GGGTgaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccg > 2:5059966‑M1/1‑13 (MQ=255) CTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtggt > 1:2683234‑M1/1‑150 (MQ=255) CTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACCGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATggtggt > 1:3959286‑M1/1‑150 (MQ=255) ggagc‑gggttcacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccaccggtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaa > 2:2868123‑M1/4‑9 (MQ=255) cgc‑gGGTgaacccgctcctacaggggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaacc > 2:1888815‑M1/1‑7 (MQ=255) C‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCaa > 2:1745915‑M1/1‑150 (MQ=255) GTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAaaga < 2:1308863‑M1/150‑1 (MQ=255) GTAAACACGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCTAGAAGAAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAaaga < 2:644251‑M1/150‑1 (MQ=255) tgaacccgctcctacaggggccttgccgtcaacagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaaccagccac > 1:3053587‑M1/1‑1 (MQ=255) TAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAaagaa < 1:4690278‑M1/150‑1 (MQ=255) TAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAaagaa < 1:4150787‑M1/150‑1 (MQ=255) | CCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAA > NC_002947/4160898‑4161196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |