New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5121556 = | 104 (0.630) | 6 (0.040) | 5/238 | NT | 7.2% | intergenic (+19/+112) | PP_4505/PP_4506 | sensor histidine kinase/nitroreductase family protein |
? | NC_002947 | 5121633 = | 62 (0.420) | intergenic (+96/+35) | PP_4505/PP_4506 | sensor histidine kinase/nitroreductase family protein |
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
ATGGCCTGGGGCTGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGTTACTCACCCCAGCTACTAACGAAATCAGCCGTTTCC > NC_002947/5121407‑5121704 | aTGGCCTGGGGCTGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTAGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAg < 1:2495048/150‑1 (MQ=255) tggccgagaacgaggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccgg < 2:3771538‑M1/2‑1 (MQ=255) tggccgagaacgaggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccgg < 2:678813‑M1/2‑1 (MQ=255) ggccgagaacgaggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGc > 1:4455623‑M1/148‑150 (MQ=255) ggccgagaacgaggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGc > 1:4455680‑M1/148‑150 (MQ=255) ggccgagaacgaggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGc > 1:1712725‑M1/148‑150 (MQ=255) ggccgagaacgaggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGc < 1:1514908‑M1/3‑1 (MQ=255) ggCCTGGGGCTGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGc < 1:4010820/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGGGCTGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGc < 1:3621566/150‑1 (MQ=255) ccTGGGGCTGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCct < 2:1219432/150‑1 (MQ=255) cTGGGGCTGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCctc < 2:1570889/150‑1 (MQ=255) tGGGGCTGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCctct > 2:5318329/1‑150 (MQ=255) tGGGGCTGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCctct > 1:2724202/1‑150 (MQ=255) gggCTGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTc < 1:2236227/150‑1 (MQ=255) tGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCgg < 1:1210958/150‑1 (MQ=255) tGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCgg < 1:4409608/150‑1 (MQ=255) gaggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGCCTCTTCGCgg > 2:4307215‑M1/138‑150 (MQ=255) gaggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGCCTCTTCGCgg < 1:3869375‑M1/13‑1 (MQ=255) gaggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGCCTCTTCGCgg > 2:3876186‑M1/138‑150 (MQ=255) aggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGCCTCTTCGCggg > 1:1073821‑M1/137‑150 (MQ=255) aggagctgatcggctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGCCTCTTCGCggg > 1:1073733‑M1/137‑150 (MQ=255) gATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTaa > 2:833619/1‑150 (MQ=255) gATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCGGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTaa > 2:5363479/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:2204271/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAAccc < 2:2425/150‑1 (MQ=255) gctacctgtatgtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGCCTCTTCGCGGGTTCACccgcgaa > 1:2294562‑M1/125‑147 (MQ=255) cAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTTTACCCGcgaa < 2:2397065/150‑4 (MQ=255) aGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 2:607930/150‑1 (MQ=255) cGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggg > 1:5294896/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGAt > 2:2868211/1‑150 (MQ=255) gtcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatccGGCCTCTTCGCgg > 2:4841233‑M1/114‑126 (MQ=255) tcggtacgccgctgaccgaaccgcggacggcgccggtgctggaaacggctgatttcgttagtagctggggtgagtaacctggccttgggctgattcatgcatcaaggcatcaGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGAtgt > 1:2196581‑M1/113‑150 (MQ=255) ccATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGa > 1:5130601/1‑150 (MQ=255) ccATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGa > 2:4438618/1‑150 (MQ=255) cATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCGAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGAt > 1:835382/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATg < 1:5434590/150‑1 (MQ=255) gCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCtg < 1:5363479/150‑1 (MQ=255) gCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCtg < 1:1434143/150‑1 (MQ=255) cGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCtgt < 2:5182467/150‑1 (MQ=255) ggTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCtgtt < 1:345111/150‑1 (MQ=255) gTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCgg > 2:346699/1‑114 (MQ=255) gTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCgg < 1:346699/114‑1 (MQ=255) tAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCtgttgt < 1:2193008/150‑1 (MQ=255) tAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCtgttgt < 1:3317826/150‑1 (MQ=255) aGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTa < 2:1738830/150‑1 (MQ=255) aGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTa < 2:2751930/150‑1 (MQ=255) gATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGc < 1:4491405/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAGCATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCgg < 2:4949432/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCgg > 2:1514908/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCggg < 1:4606260/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCggg < 1:332855/150‑1 (MQ=255) tGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc > 1:1743821/1‑109 (MQ=255) tGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc < 2:1743821/109‑1 (MQ=255) tGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGc < 2:3787805/145‑1 (MQ=255) tGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGc > 1:3787805/1‑145 (MQ=255) 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aaTCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGAGTTCAccc < 1:4353531/150‑1 (MQ=255) catcCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCcgcg < 2:2078978/150‑1 (MQ=255) catcCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCcgcg < 2:4930956/150‑1 (MQ=255) caccGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTGGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga < 1:4804084/150‑1 (MQ=255) cacaGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAATGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAagt > 2:3282114/1‑149 (MQ=255) cacaGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAATCCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga > 2:3282126/1‑150 (MQ=255) cacaGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCAc < 2:95446/141‑1 (MQ=255) cacaGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCAc > 1:95446/1‑141 (MQ=255) cacaGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga > 1:863442/1‑150 (MQ=255) cacaGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga > 1:862695/1‑150 (MQ=255) 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cccTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCTAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCaa < 1:1118106/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAg > 2:3869375/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAg > 1:3771538/1‑150 (MQ=255) tGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGt < 2:3662338/150‑1 (MQ=255) tGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGt > 1:1319004/1‑150 (MQ=255) ggAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAACGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGtt < 1:2668359/150‑1 (MQ=255) aGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGTTAc < 2:862695/150‑1 (MQ=255) aGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGTTAc < 2:863442/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGTGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGTTACTCACCCCAGCTACTaa < 1:841583/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGTTACTCACCCCAGCTACTaa < 1:841637/150‑1 (MQ=255) aaaGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGTTACTCACCCCAGCTACTAACGAAATCa < 2:2724202/150‑1 (MQ=255) aaaGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCGACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTTGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAAGCCATGATGCAAGAATCAGCCCAACGCCAGGTTACAAAACCCACCAACTAAAAAAAtaa > 1:4184292/1‑148 (MQ=25) cAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGGGGTTGTGGATGCTGTTGTAGTCGGGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGTTACTCACCCCAGCTACTAACGAAATCAGCCGTTTc < 1:2433493/150‑1 (MQ=39) | ATGGCCTGGGGCTGGCGATTGCGCGCAAGGCAGCGGAGCGCCATGGCGGTAGCCTGATGCTGGAGAATCATCCACAGGGTGGGTTTGTGGCCAGGCTGGAGTTGCCCTTGGCTGGAGCGGCAGGCAGTTGATGGGGTGCAAAGGCGCCAGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGATGTGGATGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGATGCCTTGATGCATGAATCAGCCCAAGGCCAGGTTACTCACCCCAGCTACTAACGAAATCAGCCGTTTCC > NC_002947/5121407‑5121704 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |