| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 5397437 | 143 (0.880) | intergenic (+45/‑56) | hsdR/hsdM | type I restriction modification system endonuclease/type I restriction modification system methylase | |||||
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GACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCGGCGTCGATG > NC_002947/5397261‑5397556 | aaaaTCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCa > 1:4924721/1‑150 (MQ=255) aaaTCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCaa > 1:2941632/1‑150 (MQ=255) aaaTCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCaa > 2:3072872/1‑150 (MQ=255) aaTCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAAc > 2:1380445/1‑150 (MQ=255) ctccAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAAcggcg < 1:1953124/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGa < 2:1823242/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGa < 1:2134359/150‑1 (MQ=255) aGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGc < 2:4300185/150‑1 (MQ=255) gCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCACAGCTGGCTACAACACAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGcc < 2:5202405/150‑1 (MQ=255) gCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGcc > 1:5372088/1‑150 (MQ=255) gCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGcc < 1:1063313/150‑1 (MQ=255) tCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑tt > 1:3351540/1‑150 (MQ=255) tCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑tt > 1:4398791/1‑150 (MQ=255) 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aTCCGCTCTACCCGTTgggtgggcaacggcggagccttgtccacctaacgggtagagcggattaactggcgtacagcgcgtcttccagttcatggatagctttgttgtagccagctttgccgccaaaggctttaacca < 1:1443570‑M1/138‑123 (MQ=255) aTCCGCTCTACCCGTTgggtgggcaacggcggagccttgtccacctaacgggtagagcggattaactggcgtacagcgcgtcttccagttcatggatagctttgttgtagccagctttgccgccaaaggctttaacca < 1:1443665‑M1/138‑123 (MQ=255) tCCGCTCTACCCGTTgggtgggcaacggcggagccttgcccacccaacgggtagagcggattaactggcgtacatcgcgtcttccagttcatggatagctttgttgtagccagctttgccgccaaaggctttaaccagttcgatgggtgc > 1:4426836‑M1/1‑15 (MQ=255) tCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGa > 1:2406951/1‑135 (MQ=255) tCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGa < 2:2406951/135‑1 (MQ=255) cGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACg > 2:1369604/1‑150 (MQ=255) gCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGt > 1:3810435/1‑150 (MQ=255) ctctACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTc < 1:915279/150‑1 (MQ=255) tctACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCg < 1:4799348/150‑1 (MQ=255) cccGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCtt < 2:1897984/67‑1 (MQ=255) cccGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCtt > 1:1897945/1‑67 (MQ=255) cccGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCGGCGt > 1:1567963/1‑150 (MQ=255) ccGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCGGCGt < 2:3454957/149‑1 (MQ=255) ccGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCGGCGTc > 1:726337/1‑150 (MQ=255) gTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGTCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCGGCGTCGa > 2:3198881/1‑150 (MQ=255) gTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCGGCGTCGa < 2:3255319/150‑1 (MQ=255) gTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCAAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCATTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAACTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCGGCGTCGa < 2:2798046/150‑1 (MQ=255) tgggtgggCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCGGCGTCgcca < 1:3758762/150‑4 (MQ=255) tgggtgggCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCGGCGTCGATg < 1:2641822/150‑1 (MQ=255) | GACATCAAAATCCTCCAGCTCGATCCCTTTAACCAGCTCGGTGCACCCATCGAACTGGTTAAAGCCTTTGGCGGCAAAGCTGGCTACAACAAAGCTATCCATGAACTGGAAGACGCGCTGTACGCCAGTTAATCCGCTCTACCCGTTGGGTGGGCAACGGCGGAGCC‑TTGTCCACCTAAGCAGCCAACTCCATTACAATCCCCCGCTTTGCCACACCGATTGAGAATTCGTTATGTCCATCAGCTCCACCATCAAGTCCATCCAGGACATCATGCGCAAAGACGTCGGCGTCGATG > NC_002947/5397261‑5397556 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |