New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5515237 | 92 (0.560) | 12 (0.090) | 10/216 | NT | 12.9% | intergenic (+45/‑109) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | = 5515293 | 88 (0.660) | intergenic (+101/‑53) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCAG > NC_002947/5515089‑5515386 | ccGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAc > 2:1781251/1‑150 (MQ=255) ccGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAc > 2:1137863/1‑150 (MQ=255) cATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGt > 1:2755083/1‑150 (MQ=255) tgtgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAcc > 2:1528576/1‑144 (MQ=255) cGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCGTCGCGGGTAACCCCGTT‑ACTACAg > 2:559459/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCGCATCGCGGGTAACCCCCTA‑CCGACAg > 1:1282503/1‑150 (MQ=255) gTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGt < 2:4474767/150‑1 (MQ=255) gctgcACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTgg > 1:2725138/1‑150 (MQ=255) ctgcACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGATTTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTggg < 2:430446/150‑1 (MQ=255) aCCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTa > 1:4030364/1‑150 (MQ=255) aCCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCGACAGTGGGCGTa > 2:3987587/1‑150 (MQ=255) cAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAAt < 2:1251615/150‑1 (MQ=255) ggggAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑cc > 1:4957114/1‑133 (MQ=255) ggggAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑cc < 2:4957114/133‑1 (MQ=255) ggggAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGc < 2:2092274/150‑1 (MQ=255) ggggAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGc < 1:1231859/150‑1 (MQ=255) ggAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCa < 2:3202046/150‑1 (MQ=255) gtgtGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGATCGGGTGGTCGATGTGTATATGGGCCTCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑ACTACAGTGGGCGTAATGCCATgg < 2:1044193/150‑1 (MQ=255) gtgtGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATgg < 2:599316/150‑1 (MQ=255) tgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGc < 1:519459/150‑1 (MQ=255) tgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCGCGTCGCGGGGTACCCCCTT‑CCGACAGTGGGCGTGAGGGCATggggg > 1:1218786/1‑149 (MQ=255) gCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTc < 2:1239996/150‑1 (MQ=255) ggAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTccc < 2:4030364/150‑1 (MQ=255) ggAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGGT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTccc > 2:3417583/1‑150 (MQ=255) taGGCTCGCTGGAGGTGGTGCTGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCTCTGACCTGTTTTGAATTTTTGGCTCCTGTGCCTGCCTCTTCGCTTGTAACCGGGTT‑GCTACAGTGGGCGTAATTGCATGGGGCGGTTCGcgt < 2:226305/149‑1 (MQ=255) aGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGTTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCcgtc < 2:3058447/150‑1 (MQ=255) cTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTa < 1:2428190/150‑1 (MQ=255) tCGCTTGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAg < 1:1822146/150‑1 (MQ=255) tCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAg < 1:4845810/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCgg < 1:3683122/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCgg < 2:5167483/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCgg < 1:5252542/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCgg < 1:4162133/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAccccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggg < 2:4296794‑M1/150‑56 (MQ=255) aGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCggg < 1:2157092/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCggg < 1:4438611/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCggg < 1:37287/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacgggg < 1:2179076‑M1/150‑57 (MQ=255) cAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggt < 1:544491‑M1/150‑58 (MQ=255) gTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttac > 1:3941411‑M2/1‑146 (MQ=255) tGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacc > 1:298487‑M2/1‑145 (MQ=255) gcaggcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttaccc < 1:4139898‑M1/150‑63 (MQ=255) gcaggcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttaccc > 1:4877928‑M2/1‑144 (MQ=255) caggcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccg > 2:4737388‑M2/1‑143 (MQ=255) caggcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATCTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTccc < 1:2369039/128‑1 (MQ=255) caggcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATCTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTccc > 2:2369039/1‑128 (MQ=255) aggcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgc > 1:33107‑M2/1‑142 (MQ=255) gcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgcga > 2:2819‑M2/1‑140 (MQ=255) gcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCGCTTGGCGGGGTAACCCGGG‑CCGACAGTGGGCGTAATGCCAAGGGGCGGTTGCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccccgc < 1:1697608‑M2/150‑11 (MQ=255) gATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgcgaaga > 1:875120‑M2/1‑137 (MQ=255) aTGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgcgaagag > 1:1246793‑M2/1‑136 (MQ=255) aTGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCGGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgcgaagag > 2:2705432‑M2/1‑136 (MQ=255) tGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGAGCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGGCGGCCTCTTCGGGGGTATacccgctcctacgacgggaaccgccccatggaattccgcccactgtaggaacggggttacccgcgtagagg < 1:868131‑M1/150‑72 (MQ=255) gtATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCCCGTCGCGGGTAACCCCCTT‑CCAACAGTTGGCGTAAATCCCAGGGGCGGTTCCCGGCGTAGGAGCCGGTTTACCCGCGAACAGGCCGGCACAGGCCCAGcca > 2:3704461/1‑148 (MQ=255) tCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcga > 2:3364655‑M1/1‑58 (MQ=255) tCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcga < 1:3364655‑M1/124‑67 (MQ=255) tCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCCTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCAAGGGGCGGGTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATccc > 2:3362104/1‑150 (MQ=255) tGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttaccc < 1:2172671‑M1/118‑63 (MQ=255) tGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttaccc > 2:2172671‑M1/1‑56 (MQ=255) gggCCGCGGCCGGGATTTGAATTTTTGGCGCCGGGGCCGGCCGCTGCGCGGGAAACCCCGGC‑CCCCCCGGGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTGGTCGGAGGGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCttt < 2:1507773/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTGACCGGATTTGAATTTTGGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTc < 2:4523954/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGTT‑CATACAGTGGGGGTAATGCCATGGGGCGGTTACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCCAGCAACCCattaa > 2:2571235/1‑148 (MQ=38) ggCTGACGGGTTTTGAATTTTTGGCGCCTGGGCCGGCCTCTTCGGGGGTAACCCGGTT‑CCTACAGTGGGCGTTATGCCTTGGGGCGGTTCCCGTCTTTGGAGCGGGTTTACCCGCTAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAgg < 2:4076602/149‑1 (MQ=255) gAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCCGGTAACCCCGTT‑CCAACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATACCGTTCAGGAACTCTCAAATGCt > 2:3844888/1‑150 (MQ=39) tgtgCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACAccc < 2:1218786/150‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCcgtcgt > 2:5248829/1‑63 (MQ=255) gCCTCTT‑GGGGGGAACCCCGTTCCCTAAAGGGGGCTTATTGCCTGGGGGGGGTTCCCGTCTTTGTTGGGGTTTTACCGGCGATGCGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCa < 1:2101432/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAg > 2:832561/1‑150 (MQ=255) ccTCTACGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGGAATTCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTatacccccgaagaggccgccacaggcgccaaaaattcaaatccgctcagcggcccagatacacctcgaccacccgctca < 1:868131‑M2/150‑80 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcaccggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcat > 2:2705432‑M1/1‑14 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCa > 2:2621076/1‑111 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGt > 1:1177938/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatc > 2:4810828‑M1/1‑13 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatc > 1:875120‑M1/1‑13 (MQ=255) tctTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggcacaggcaca > 2:3466710/1‑98 (MQ=255) tctTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggcacaggcaca < 1:3466714/98‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggcacaggcaca < 1:3466710/98‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGta > 2:315441/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGta > 1:4389972/1‑150 (MQ=255) ctTCGCGGGTAAacccgctcctccgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaccggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatct < 2:5063031‑M1/150‑139 (MQ=255) tCGCGGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgc > 2:2819‑M1/1‑10 (MQ=255) tCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccaga < 1:3364655‑M2/124‑59 (MQ=255) gcgggggtaaacccgctcctacgacggcaaccgccccttggcattacgcccactgtcggcccgggttaccccgccaagcggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgc < 1:1697608‑M1/146‑141 (MQ=255) gcgGGTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcct > 1:33107‑M1/1‑8 (MQ=255) ggtttAACCCGTTT‑CATACTGGGGGCTTACGGCCTTGGGGGGGTGCCGGTTGTCGGTGGGGTTTTCCCGGCGACGCGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTAcgg < 1:559459/146‑1 (MQ=255) cgGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGacac > 2:484317/1‑132 (MQ=255) cgGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGacac < 1:484440/132‑1 (MQ=255) gggTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgc > 1:2143067‑M1/1‑6 (MQ=255) gggTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCTTGGGGCGGTTCCCGTCTTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTAcggc < 1:3987587/150‑1 (MQ=255) gggTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgc < 2:932736‑M2/150‑89 (MQ=255) gggTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTAcggc > 1:580526/1‑150 (MQ=255) gggAAAacccgctcctacgccgggaaccgccccatggcattccgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgc < 2:4107613‑M1/150‑145 (MQ=255) gTAAacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgcac > 1:3941411‑M1/1‑4 (MQ=255) gTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTttacccgcgaagaggccggcacaggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgcac < 1:2370939‑M2/150‑91 (MQ=255) gTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTAcggcgg > 2:1976393/1‑150 (MQ=255) tAACCCCGTG‑CCTACCGGGGGCGTACTGCCATGGGGCGGTTCCCGGCGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTCCTACggcggc < 2:1791370/150‑1 (MQ=39) aaacccgctcctacgacgggaaccgccccatggcattacgcccactgtaggaacggggttacccgcgaagaggccggccccggcgccaaaaattcaaatccggtcagcggcccagatacacctcgaccacccgctcatctgcctgcacct > 1:4217669‑M1/1‑2 (MQ=255) aaCCCCGTT‑CCTACCGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCa < 2:752824/150‑1 (MQ=255) aCCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTAcggcgg > 2:3555857/1‑147 (MQ=255) aCCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCAg > 1:124030/1‑150 (MQ=255) | CCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTT‑CCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGCGGCAG > NC_002947/5515089‑5515386 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |