New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5758636 = | 110 (0.670) | 11 (0.070) | 7/250 | NT | 8.9% | intergenic (+335/‑353) | glnG/PP_5050 | two‑component system DNA‑binding response regulator GlnL/GlnG/transposase |
? | NC_002947 | 5758710 = | 123 (0.800) | intergenic (+409/‑279) | glnG/PP_5050 | two‑component system DNA‑binding response regulator GlnL/GlnG/transposase |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGCGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCT > NC_002947/5758487‑5758785 | tacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaatacggtggtggcggcaacgctgaacggcaggtggagattggccagcaggcccggcctcTTc > 2:2008614‑M1/148‑150 (MQ=255) tacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaatacggtggtggcggcaacgctgaacggcaggtggagattggccagcaggcccggcctcTTc < 1:5121540‑M1/3‑1 (MQ=255) gccgccTCCGTATGCGCGGGCAATCCCGCGCCTACCGCGGCGGTGGGCACAGATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTcgc < 2:312837/150‑1 (MQ=14) 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gtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaatacggtggtggcggcaacgctgaacggcaggtggagattggccagcaggcccggcctcTTCGCgg > 2:4190764‑M1/144‑150 (MQ=255) gtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaatacggtggtggcggcaacgctgaacggcaggtggagattggccagcaggcccggcctcTTCGCgg > 2:2321255‑M1/144‑150 (MQ=255) gtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaatacggtggtggcggcaacgctgaacggcaggtggagattggccagcaggcccggcctcTTCGCgg > 1:3299013‑M1/144‑150 (MQ=255) cggctccGTATGCGCGGGCAAACCCGCGCCTACCCCTGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCgg < 2:4174943/145‑1 (MQ=17) cgccACCGTATTCGCGGGTACACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCgg < 2:4738013/150‑1 (MQ=255) 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ccgGGTAAACCCGCGCCTACCACTGCGGTGGCCACATATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 2:5388159/149‑1 (MQ=255) ggTAAACCCGCGCCTCCCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 1:3466242/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGCGAACATAACGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTAACCCGCCAACAGGCCGCGCCTGCTGGCAAATCTCCACCTGCCGTTCAGCTTTCCCGCCACCACCGTATGCGCGGGTAAACCCGCTGCTAcc > 2:3817059/1‑150 (MQ=14) ccGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGCg > 2:1283462/1‑150 (MQ=255) cgcgCCTCCCCCGGCGGTGGGCACATCTCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGCGt < 1:5266985/150‑1 (MQ=255) 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ttCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGGAAACCCCCGCCGACCACGGCGGGGCCCCACAGCGCGGGCGGCGGTGGGGCGGGGTCACCCGCGCAGAGGCCGGGCCGGCGGGCCAAACGCCACCCGCCCTTCAGCGGTGCCGccccc > 1:2449779/1‑150 (MQ=9) aGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACCACGGCGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCaccacc > 2:71759/1‑150 (MQ=255) ccgccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGCGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCAGCCCTTCAGCGTTGCCGCCACCACCGTATTcg > 1:2715305/1‑150 (MQ=255) ccgccACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGCGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCgg < 2:4145679/150‑1 (MQ=255) ccgccACCGTATCCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGCGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGACGCCACCACCGTATTCGCgg < 2:1555913/150‑1 (MQ=255) 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TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGCGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCt < 2:3988546‑M1/150‑1 (MQ=255) | TGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACCACGGCGGTGGGCACATATCGGGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGCGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGCGTGGACACACATCGCGGTCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCTGCCGTTCAGCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCT > NC_002947/5758487‑5758785 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |