| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 6078298 = | 152 (0.920) | 10 (0.060) | 8/252 | NT | 6.5% | coding (242/2289 nt) | PP_5328 | phosphate ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | 6078335 = | 144 (0.930) | coding (205/2289 nt) | PP_5328 | phosphate ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
CGGGTAGTTCGACACGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGTCCTTGAGGGCGCGC > NC_002947/6078149‑6078447 | tttcaatacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtt > 2:1690636‑M1/150‑150 (MQ=255)cGGGTAGTTCGACACGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCt > 1:3952792/1‑150 (MQ=255) ttcaatacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTc < 2:1040963‑M1/2‑1 (MQ=255) ttcaatacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcgtatgtggtgctgccactgtTc < 1:860775‑M1/2‑1 (MQ=255) gTAGTTCGACACGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCa < 1:2341112/150‑1 (MQ=255) caatacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTCCa > 1:1049889‑M1/147‑150 (MQ=255) aatacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTCCAg > 1:2978789‑M1/146‑150 (MQ=255) atacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTCCAgg > 1:2529913‑M1/145‑150 (MQ=255) atacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTCCAgg > 2:3493327‑M1/145‑150 (MQ=255) atacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTCCAgg > 1:2529716‑M1/145‑150 (MQ=255) tacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTCCAggg > 1:3820415‑M1/144‑150 (MQ=255) actcGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCa < 1:2837282/139‑1 (MQ=255) acacGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTc < 1:109059/150‑1 (MQ=255) 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aGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGc > 1:587322/1‑150 (MQ=255) gATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGcc > 1:5197461/1‑150 (MQ=255) ggCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGcaca < 2:2998631/150‑1 (MQ=255) ccgacccGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACAt > 1:1427591/5‑150 (MQ=255) ttCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATAc > 2:988741/1‑150 (MQ=255) ccGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAg > 1:4429214/1‑150 (MQ=255) ccGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAg > 1:339895/1‑150 (MQ=255) cGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGc > 1:2902769/1‑150 (MQ=255) gCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCgg < 1:2250595/150‑1 (MQ=255) cATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCggg > 1:1666919/1‑150 (MQ=255) ctgctgCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAg > 2:3786198/1‑150 (MQ=255) tgctgcAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAgg > 2:4201837/1‑150 (MQ=255) tgctgcAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAgg > 1:1016111/1‑150 (MQ=255) tgcAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCgg < 1:1879242/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGTcc > 1:430849/1‑150 (MQ=255) gCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACGTAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGTCCTTGAGGgcgc > 2:2744952/1‑150 (MQ=255) | CGGGTAGTTCGACACGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGTCCTTGAGGGCGCGC > NC_002947/6078149‑6078447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |