| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 86765 | 88 (0.530) | 11 (0.080) | 8/236 | NT | 13.5% | intergenic (‑48/+97) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 86824 | 64 (0.440) | intergenic (‑107/+38) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGC > NC_002947/86675‑86972 | gAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGgcgc < 2:5416047/150‑1 (MQ=255) aaGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCg > 1:2726947‑M2/1‑149 (MQ=255) taccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGgcgcgc > 1:5194304‑M1/74‑150 (MQ=255) gCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcc > 1:2939782‑M2/1‑147 (MQ=255) caccgaggccgatgggtatgccctggaggccgacaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTCAGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAACCCAACCCCTTGCTTGGCACCGGCAATGCCGGTGTACGCGGGCGCCCCCg < 1:5277692‑M1/80‑1 (MQ=255) aaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacccgccaagCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTc > 2:562828‑M1/68‑150 (MQ=255) tGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCTATGCTTGGTTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCTAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCTAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgcgaa > 1:1527594‑M2/1‑141 (MQ=255) aaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCccgcgaa > 2:408059‑M1/67‑147 (MQ=255) gAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgctccc > 1:4276803‑M2/1‑140 (MQ=255) gAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgctccc > 2:2450985‑M2/1‑140 (MQ=255) gAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgcgaac > 2:3227221‑M2/1‑140 (MQ=255) aggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTccc > 2:4225066‑M1/66‑150 (MQ=255) aggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTccc > 1:3730865‑M1/66‑150 (MQ=255) gAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgctcccaca < 1:3693316‑M2/150‑14 (MQ=255) aaGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCgcccgctcccacag > 1:3527420‑M2/1‑136 (MQ=255) gcagTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt < 2:14282/150‑1 (MQ=255) gcagTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt < 1:3442181/150‑1 (MQ=255) gcagTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt < 1:5444487/150‑1 (MQ=255) gatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGTCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt > 1:4825463‑M1/55‑150 (MQ=255) aaaGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGtt > 2:1571602/1‑150 (MQ=255) gagagGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCt > 1:3129450/1‑150 (MQ=255) ggCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgt < 1:827707/150‑1 (MQ=255) ggCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgt < 2:2892112/150‑1 (MQ=255) ggCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgt < 1:604486/150‑1 (MQ=255) ggCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgt < 2:3527059/150‑1 (MQ=255) cGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTga < 2:1530093/150‑1 (MQ=255) cGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTga < 1:478937/150‑1 (MQ=255) tcaaagccaatctgtaatctcacaaagcaacacaccatCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCTCGAAAAAGCCTACGCGTTGCTTGGGAGCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTTTGTTGCTTTGTgaga > 2:5277692‑M1/39‑150 (MQ=255) 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cactctCCTTAAGGGGTCGCCACGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACGCCACCGCGTGGCTTGGCACCGGCTGTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCtt < 2:195891/145‑1 (MQ=25) acaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCttt > 1:573183/1‑150 (MQ=255) acaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGGTTGGCttt > 2:2918643/1‑150 (MQ=255) acaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGGTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCttt > 2:159683/1‑150 (MQ=255) cTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGc > 1:366994/1‑150 (MQ=255) 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ccGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATg > 1:237934/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATg > 1:333178/1‑150 (MQ=255) cggcaaagCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATgc > 2:4675052/8‑150 (MQ=255) cGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTcc < 1:4142538/87‑1 (MQ=255) cGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTcc > 2:4142538/1‑87 (MQ=255) ggCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATgcg > 1:794773/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCa < 2:794773/150‑1 (MQ=255) gtgtTCGCGGGCGCGCCCTCTCCAAAATGGTTTTTGTGTTGCTTTGTGAGATTACTGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGTCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCa < 1:5266029/150‑1 (MQ=255) tgggagcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAg > 2:3383779/6‑150 (MQ=255) gtTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAgg < 2:3693316/150‑1 (MQ=255) ggagcgGGCGCGCCCGCACCCACAGGGTTGGTGGGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATACCCATCGGCCTGGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCAACCAACCCTTCAGGATGCGCTTTAACCCAGGc > 2:1950874/4‑150 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCtt < 2:412873/150‑1 (MQ=255) gggCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTgg > 1:350223/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGcc < 2:665494/150‑1 (MQ=255) gcgcccgctcccacagggcttggcgaccccttaaggattgtggataacccatgcatcgcctctctttactgctgcccttcctcacctggcttccccgccaatcgggccgcagcctgcgccaggacctgctggtaggcctgagcggcgcca > 1:2035853‑M2/1‑2 (MQ=255) | GAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGC > NC_002947/86675‑86972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |