New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 90357 | 165 (1.000) | 24 (0.160) | 14/244 | NT | 14.4% | intergenic (+32/+90) | PP_0079/PP_0080 | transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 90414 | 134 (0.890) | intergenic (+89/+33) | PP_0079/PP_0080 | transcriptional regulator/hypothetical protein |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GCGGCGTGGGGCGTTGATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGT > NC_002947/90265‑90563 | gTGGGGCGTTGATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCgtcgc > 2:2930634‑M2/1‑145 (MQ=255) gATCGAGCGTTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTgc < 1:1173101/150‑1 (MQ=255) gATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTgc < 2:4572602/150‑1 (MQ=255) gAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgcag > 2:2083045/1‑150 (MQ=255) cgCGGTTTGTGGATTGGTGGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgcagc < 2:4024704/149‑1 (MQ=255) aGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgcagc > 2:1939995/1‑150 (MQ=255) ggggTTTGGGGTGTGGTGGGAGCAGGCGCGCAGCCTTTGCGATGTTGGGGCCGCTGTGCGGCCCATCGCGCCACCCGGCCGCTCCCACCGGGGCACTGCCCCCGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTGGCGTCGCGCTGGGCTGCgcagca < 1:3519693/148‑1 (MQ=255) gCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgcagca > 2:4889377/1‑150 (MQ=255) gCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACACTGGCACAGCACACGCCG‑GCCCAAGTGGGAGCCGCCTTGCCTCCCCAAGGGCAGCgcagca > 1:4313874/1‑150 (MQ=37) gCGGGTTGGGGCTTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGCTTTGGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCgcagca < 2:5260791/150‑1 (MQ=38) ggTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTCGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACAGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCagcagc > 1:4804677/1‑150 (MQ=255) tttGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGccc < 1:150710/150‑1 (MQ=255) tttGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACACTGTCACAGCACACCCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCATGCGTCGCCATGGGCGGCGCAGCAGccc > 1:1694520/1‑150 (MQ=38) tgtgGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGAGTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCg < 2:3460651/150‑1 (MQ=255) gtgGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCgg < 1:5396359/150‑1 (MQ=255) aTTGGTTGGAGCAGGGGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAAt > 2:1284738/1‑150 (MQ=255) ttggttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAATGCCGCTACCACAGTGGCACAGCACACCCCG‑GCCCCTGTGGGAGCGGCCGTGCGTCGCCGTGGGCGGCGCAGCAGCCCCCGCaaac > 1:179492/1‑148 (MQ=37) ttggAGCTGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGa < 1:3658061/150‑1 (MQ=255) ttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGATATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGa < 1:3658167/150‑1 (MQ=255) ttggAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGa > 2:2212283/1‑150 (MQ=255) cAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGa > 2:2173240/1‑150 (MQ=255) aGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGTGCGGCCGTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGaa > 2:4534957/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTc > 2:1711164/1‑150 (MQ=255) cAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAgg < 2:5406156/150‑1 (MQ=255) tttGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTgctc < 2:2646386/150‑1 (MQ=255) tttGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCC‑GCCCATGTGGGAGCGGCCATGCGTCGCGATTGGCTGCGCAGCAGCCCCCGCAAACAACACCACCAAGTTCAGGTgctc > 1:4353630/1‑150 (MQ=38) tttGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACAAAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACAGCACACCCCC‑GCCCCTGTGGGAGCGGCCTTTCGTCGCGCTGGGCGGCGCAGCAGCCCCGGCAATCGAGAACACCAATTTCAGGTgcgc > 1:3807687/1‑148 (MQ=37) agaTTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTgctcgctc < 1:2177996/150‑1 (MQ=255) agaTTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTgctcgctc < 1:2177728/150‑1 (MQ=255) tttGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGt < 1:2083622/150‑1 (MQ=255) tttGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGt < 2:5228852/150‑1 (MQ=255) ggggCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCa > 2:987135/1‑150 (MQ=255) gggCCGCAAAGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCGCCCACAGTGGCACTGCCCCCGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCGGCGCCGCAGCCCCGGCCATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCGCGCTCCGGTGCaa > 1:353161/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAg < 1:4000154/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTTGCGGCCCATCGCGGCACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCAGGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACCAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGt > 2:2344876/1‑150 (MQ=255) gCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGt > 2:823610/1‑150 (MQ=255) gcGCTTGGCGGCCCATCGCGACACACGGCCGCTCCCACCGTGGCACGGCCCCCGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtc < 2:3372232/149‑1 (MQ=38) gCTTTGCGGCCCATCGCGCCACAAGGCCGCTCCCCCCGTGGCACGGCACACGCCC‑GCCCAGGTGGGAGCGGCCGTGCGGCGCGCTGGGCTGCGCAGCCGCCCCCGCCAGCGAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtccc > 1:3372232/1‑149 (MQ=255) cTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtccag > 2:3950686/1‑150 (MQ=255) cTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtccag < 1:3045156/150‑1 (MQ=255) cGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtccagctcca < 2:24210/150‑1 (MQ=255) ccATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCAt < 2:3837626/150‑1 (MQ=255) ccATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCAGGTGGGAGCGGCCTTGCgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgc < 2:1031326‑M2/150‑84 (MQ=255) aTCGCGACGCAAGGCCGCTCCCACA‑TGGGCCGGCGTGTGCAGTGCCACTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGt > 1:3672088/1‑150 (MQ=17) aTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGt < 2:1976307/150‑1 (MQ=255) gcgACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTcca > 1:1914371/1‑150 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTccacc > 1:4018621/1‑150 (MQ=255) acacAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTccacca < 1:5404630/150‑1 (MQ=255) acaAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgc < 2:1909594‑M2/150‑94 (MQ=255) caAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATcc < 2:5332873/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggctccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgctt < 2:5099410‑M2/150‑96 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATccc > 1:249395/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgc < 2:307835‑M2/150‑100 (MQ=255) ccGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCt > 1:1522120/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgcgg < 1:3849343‑M2/150‑102 (MQ=255) gCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGc > 1:5188509/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgcggcg < 2:484045‑M2/150‑104 (MQ=255) tCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgcggcg < 1:939551‑M2/150‑104 (MQ=255) tCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgcggcg < 1:270663‑M2/150‑104 (MQ=255) tCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGa < 1:2456930/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGa > 2:5209902/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGa > 1:1400299/1‑150 (MQ=255) ccACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaacccatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgcggcggg < 1:678075‑M2/150‑106 (MQ=255) ccACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgcggcggt < 1:2979528‑M2/150‑106 (MQ=255) ccACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgcggcggt < 2:4509343‑M2/150‑106 (MQ=255) ccACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgcggcggt < 1:1313357‑M2/150‑106 (MQ=255) cacaGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgcggcggta < 2:1851543‑M2/150‑107 (MQ=255) acaGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcacaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgcgcgatcaacgccccacgccgcgggcgcggcggtgg < 1:4601507‑M2/150‑108 (MQ=255) caGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTg < 1:1577987/150‑1 (MQ=255) caGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTg < 1:4391545/150‑1 (MQ=255) caGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTg < 1:1996619/150‑1 (MQ=255) aGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTgg < 1:4773639/150‑1 (MQ=255) gTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGa < 2:1091178/150‑1 (MQ=255) gTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGa < 2:1091460/150‑1 (MQ=255) gTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGa < 2:5633/150‑1 (MQ=255) gTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGa < 2:754530/150‑1 (MQ=255) gTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTAGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTggc < 1:1725373/150‑2 (MQ=255) gCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACaa > 1:3753380/1‑150 (MQ=255) cACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAg < 2:2274725/150‑1 (MQ=255) tGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAgcgc < 1:4119174/150‑1 (MQ=255) tGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAgcgc > 1:2245066/1‑150 (MQ=255) cgCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGCTGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAgcgc < 2:661479/149‑1 (MQ=255) gCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGcgcc < 2:1690048/150‑1 (MQ=255) gCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGcgcc < 2:179460/150‑1 (MQ=255) cacaCGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGTgtcgcgatgggccgcaaagcggccccaaaatctcaaaggctgcgctcctgctccaaccaatccacaaaccgctcgatcaacgccccacgccgcttgcgcggcggtaagactacgtaata > 2:939551‑M2/1‑31 (MQ=255) acacGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGcgccgc > 2:461861/1‑150 (MQ=255) acGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtc < 2:4983193/99‑1 (MQ=255) aagCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGtc > 1:4983193/3‑99 (MQ=255) cGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAAc < 2:912915/150‑1 (MQ=255) g‑gCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCt > 2:2742609/1‑150 (MQ=255) gCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTc < 1:5444948/150‑1 (MQ=255) ccATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTcag > 2:399870/1‑150 (MQ=255) gtgGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTcagccag < 1:826471/150‑1 (MQ=255) gggAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCagccagcc > 1:3093253/1‑150 (MQ=255) gggAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCagccagcc > 1:3093246/1‑150 (MQ=255) gCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAgg < 1:287575/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCt > 1:1044842/1‑150 (MQ=255) cTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCa < 2:3006633/150‑1 (MQ=255) ttGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAg > 2:3896151/1‑150 (MQ=255) cGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCCCGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGt < 2:4313874/150‑1 (MQ=255) | GCGGCGTGGGGCGTTGATCGAGCGGTTTGTGGATTGGTTGGAGCAGGAGCGCAGCCTTTGAGATTTTGGGGCCGCTTTGCGGCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTGGCACTGCACACGCCG‑GCCCATGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATGGGCTGCGCAGCAGCCCCGGCAATCTAGACCACGAAGTTCAGGTGCTCGCTCCGGTGCAAGTCCAGCTCCAGCATGTCCACCATCCCCGCTGCGATCCTGGACAAGCGCCGCAACGGCTCAGCCAGCCCAGGCTCCAGCGT > NC_002947/90265‑90563 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |