| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 100443 = | 102 (0.620) | 15 (0.100) | 13/234 | NT | 11.9% | intergenic (‑35/+87) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 100525 = | 132 (0.920) | intergenic (‑117/+5) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
TCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAGCC > NC_002947/100377‑100670 | tCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATg > 1:2187303/1‑150 (MQ=255) gAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCAtt > 1:3164988/1‑150 (MQ=255) gAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCAtt > 1:1890186/1‑150 (MQ=255) aaGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTc > 1:1177753/1‑150 (MQ=255) gagGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAg > 2:1345358/1‑150 (MQ=255) gagGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAg > 2:4959211/1‑150 (MQ=255) gagGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCGTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCAAGCCCGCGAATGCGGTCATTCAg > 1:77127/1‑150 (MQ=255) agGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAgg > 1:1794197/1‑150 (MQ=255) gATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGtt > 2:4217956/1‑150 (MQ=255) gATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGtt > 2:4483085/1‑150 (MQ=255) gATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGtt > 1:3719354/1‑150 (MQ=255) ttttttGCTGGTGATTTTACCGGGTTCCACTTGTGTGGTGGGTGGCATTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTTAACGCGCTGGCCTTGAAGGGGCCACTCACCGTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGa < 1:91559/148‑1 (MQ=255) ttttGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATc < 2:1652040/150‑1 (MQ=255) tttGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCg > 2:668627/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGt > 2:3690204/1‑150 (MQ=255) gtGGTGCATGTACTGGGTTCCAGTTGTGGGCTGGGTGGCCTTCTTCGGGGGCAGGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCCGGCCTTTAAGGGGCCACTCAACCGGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGc < 1:4201331/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGc > 2:730814/1‑150 (MQ=255) tgattGTACAGGGTTCCAGTTGAGTGCTGGGTGGCCTTGTGGGCGGGCATGCCCGCTCCCACCGGTAAAGCGCAGGCCTTGATGGGGCCACTCAACCTGGGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTc < 1:3420487/146‑1 (MQ=255) tGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGcc > 1:4257004/1‑150 (MQ=255) actgggTTCCACTTGTGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGGGGGCTTGCCCGCTCCCACCGGTAAAGCGCTGGCCTTGATGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAgg < 1:1021628/147‑1 (MQ=255) aGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTg > 2:4392417/1‑150 (MQ=255) ttCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCATGTTGATAGTAGCCTTAGGCCAGGTGCTgg > 1:1612596/1‑150 (MQ=255) caattGTGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCCCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTcc < 1:4773143/147‑1 (MQ=255) 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tgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCAc > 1:4013683/1‑150 (MQ=255) gcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACg > 1:3928496/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGcc > 1:4304068/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGcc < 2:3366979/150‑1 (MQ=255) tcttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCg < 2:1586257/150‑1 (MQ=255) 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aaCCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCAc > 2:4914080/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCAc > 1:2409323/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCGTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCAc < 1:2377256/150‑1 (MQ=255) cTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCgg > 2:1060460/1‑150 (MQ=255) tGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGa < 1:4515960/150‑1 (MQ=255) tGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGa < 1:4576578/150‑1 (MQ=255) ggggCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGc < 1:3646112/150‑1 (MQ=255) ggggCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGc < 2:596434/150‑1 (MQ=255) gggcgggcATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGcc < 1:322158/150‑1 (MQ=255) ggcgggcATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCGCCTGGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGccc < 2:2187303/150‑1 (MQ=255) cgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCAt < 1:4914080‑M2/134‑1 (MQ=255) tgaatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGt > 2:2115885‑M2/15‑150 (MQ=255) cccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGccc < 1:4642127‑M2/132‑1 (MQ=255) cccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGt < 2:5157821‑M2/142‑1 (MQ=255) cgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTg < 2:4038082‑M2/41‑1 (MQ=255) cgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAggtcg > 2:4591886‑M2/7‑148 (MQ=255) cgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAg > 2:2322569‑M2/7‑150 (MQ=255) gcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGt > 1:3278005‑M2/6‑147 (MQ=255) gcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGt < 2:552133‑M2/142‑1 (MQ=255) gcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGt < 2:3278005‑M2/142‑1 (MQ=255) gcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAGc < 2:2995553‑M2/145‑1 (MQ=255) tGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCAc > 2:3615323/1‑122 (MQ=255) | TCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAGCC > NC_002947/100377‑100670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |