| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
GTCGTAAATGGTGTGAAAGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAGCGC > NC_002947/726838‑727134 | gTCGTAAATGGTGTGAAAGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGAt > 2:4348562/1‑150 (MQ=255) aaaGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCa > 1:4380141/1‑150 (MQ=255) gTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTAGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGAtt < 2:251356/150‑1 (MQ=255) gTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAAGGGCAGATAAAAACTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGAtt < 2:1618648/150‑1 (MQ=255) ggggCGGGATATGGGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGaa < 1:5105349/150‑1 (MQ=255) ggggAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGaa > 1:1704102/1‑150 (MQ=255) ggagggaTATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACa < 1:4899822/150‑1 (MQ=255) ggAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTc > 2:3146375/1‑150 (MQ=255) gAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAAt > 2:446116/1‑119 (MQ=255) gAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCa > 1:2732198/1‑150 (MQ=255) gAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCa < 2:2420319/150‑1 (MQ=255) gAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCa < 2:2650769/150‑1 (MQ=255) acacGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGc < 2:1788332/150‑1 (MQ=255) cacGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGcc > 1:1174534/1‑150 (MQ=255) cGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTg < 1:711462/116‑1 (MQ=255) gAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTtg > 1:3846692/1‑150 (MQ=255) gAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACAGCGTGTTCAGCCTtg > 2:2753293/1‑150 (MQ=255) gCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGcc < 1:2575386/150‑1 (MQ=255) 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cTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAg > 2:3182155/1‑150 (MQ=255) cTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAg > 2:3790560/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAgg > 1:523683/1‑150 (MQ=255) aatcgacAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTCTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTg > 2:4683909/7‑150 (MQ=255) gcgGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGc > 2:2217874/1‑150 (MQ=255) gcgGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGc > 2:2137907/1‑150 (MQ=255) gggCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCAc > 1:3296393/1‑150 (MQ=255) gggCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCAc > 1:1883785/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCAcgcc < 2:1116480/150‑1 (MQ=255) aaGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCAcgccg > 2:3927730/1‑150 (MQ=255) aaGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCAcgccg > 1:2105864/1‑150 (MQ=255) aaGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGATCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCAcgccg > 2:5190625/1‑150 (MQ=255) ccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAAt < 2:2079289‑M2/138‑1 (MQ=255) cgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATg < 1:1537147‑M2/139‑1 (MQ=255) tcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGc > 2:4817942‑M2/9‑150 (MQ=255) ccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGcac > 1:1091307‑M2/7‑150 (MQ=255) cacagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGcc < 2:509037‑M2/97‑1 (MQ=255) cacagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGcc > 1:509092‑M2/6‑102 (MQ=255) cacagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGcaca > 1:2538031‑M2/6‑150 (MQ=255) cacagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGcaca < 1:3146375‑M2/145‑1 (MQ=255) acagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCGTTGGTGGCCAGGGCCCTGGTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAg > 2:2798872‑M2/5‑150 (MQ=255) acagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAg > 1:2266466‑M2/5‑150 (MQ=255) acagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAg > 1:2266370‑M2/5‑150 (MQ=255) acagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAg > 1:3338945‑M2/5‑150 (MQ=255) acagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAg > 1:1723132‑M2/5‑150 (MQ=255) | GTCGTAAATGGTGTGAAAGGGTCGGGGAGGGATATGTGGAACACGAAATTGCAGATAAAAACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATACACCGTGGTGCCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAGCGC > NC_002947/726838‑727134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |