New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1899260 = | 151 (0.920) | 13 (0.090) | 6/238 | NT | 10.1% | intergenic (+288/‑232) | PP_t18/PP_1703 | tRNA‑Asp/assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
? | NC_002947 | 1899320 = | 97 (0.660) | intergenic (+348/‑172) | PP_t18/PP_1703 | tRNA‑Asp/assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
ATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGGCGCCTTTTT > NC_002947/1899173‑1899468 | gggctgtcgacgttgacagcccgggatgaggtagatcagcaatgtatgggcccgctataccggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCCCAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaa > 2:5293311‑M1/79‑150 (MQ=255) aTTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCCGCCCTCAGGCCGGGCGATATCCCGGTGGGAGCGGGCCTGCCCGCGaaa > 1:268441/1‑150 (MQ=39) aTTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaa > 2:1420178/1‑150 (MQ=255) ccAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGTGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCACTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCg < 1:306038/150‑1 (MQ=255) cAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCCTGCCCGCGAAAGGGCCgg > 2:2307825/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAg < 1:2014907/150‑1 (MQ=255) cTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGcc > 2:1888404/1‑150 (MQ=255) gCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATaaa < 1:1327383/150‑1 (MQ=255) aTGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAAtt > 2:1153493/1‑150 (MQ=255) tGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTg < 2:4867778/150‑1 (MQ=255) tggTTGCCACCGCATGGTGCTTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGTGCACGCCCGCTCCCAATGTTACTGCGCCGCCATAAGGCCTTGCGATCACCCTGTGTGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCt < 1:4275184/149‑1 (MQ=37) aGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCt < 1:1241712/150‑1 (MQ=255) aGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCt < 1:2212012/150‑1 (MQ=255) gTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCTATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGa < 1:1165524/150‑1 (MQ=255) gTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGa < 1:3915293/150‑1 (MQ=255) gTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGa > 2:3536777/1‑150 (MQ=255) gTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCCCGCCCCCAGGTACTGCGCCCCCCGCAGGCCGTGCGCTATACCGGGGGGGGCCGGCATGCCCCCCCAAGGGCCCGGGTAGCAGGGCCCAGAAAttctgg > 1:638181/1‑146 (MQ=255) ttGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCGGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGCAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTgtt > 2:3796858/1‑148 (MQ=255) 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cgccCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCAtgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctggggcaatttccagcatgagcactgccctcccatgtcccagga > 2:2983645‑M2/1‑38 (MQ=255) cccTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCt < 1:3419838/150‑1 (MQ=255) cccTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCt < 1:3109215/150‑1 (MQ=255) gcctgagggcggcgcagtacctgtgggagcgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAAt < 2:233814‑M2/37‑1 (MQ=255) cTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTg > 2:5016763/1‑150 (MQ=255) cTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGc < 2:4507002/150‑1 (MQ=255) ttGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCCTGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCGGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACGTCACGACAAAGGCGCCGGGTTGCCCCGCTTgcagcagca > 1:106011/1‑150 (MQ=255) ttGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGACGACAGCCCACACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTAGCATCAGCa > 1:5324622/1‑150 (MQ=255) atatCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCg < 1:2850586/150‑1 (MQ=255) gtacctgtgggagcgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCggg < 1:3696885‑M2/132‑1 (MQ=255) tCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCgggg < 2:966244/150‑1 (MQ=255) tCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCGCACCACGTCACGACAAAGGCGCCGGGTTGCCCCGCGAGCATCAGCATGCCgggg > 1:3006402/1‑150 (MQ=255) tgtgggagcgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCgt > 2:825508‑M2/14‑117 (MQ=255) tgtgggagcgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGc > 2:3769583‑M2/14‑150 (MQ=255) gtgggagcgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGAcagcccggg > 1:3234837‑M2/13‑90 (MQ=255) tttcgcgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCgg > 2:1336165‑M2/11‑150 (MQ=255) gggagcgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCgg < 2:3970837‑M2/140‑1 (MQ=255) ttcgcggGCAcgcccgcgaagaggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctggggcaatttccagcatgagcactgccctcccatgtcccaggagatgccggtgatcgaggacgggtttgag < 2:602176‑M2/147‑141 (MQ=255) ggagcgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGgc < 2:3236153‑M2/141‑1 (MQ=255) gagcgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGA‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGgcg > 2:3330626‑M2/9‑150 (MQ=255) cgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGa > 2:3320699‑M2/6‑97 (MQ=255) cgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGa < 1:3320699‑M2/92‑1 (MQ=255) cgggcATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGa > 2:595332‑M2/6‑97 (MQ=255) cGGGCAtgcccgcgaaagggcctgcacaggttacgcaccatgcggtggcaacctcatgctcccaggcgctttgctggggcaatttccagcatgagcactgccctcccatgtcccaggagatgccggtgatcgaggacgggtttgaggtgc > 2:3110885‑M2/1‑6 (MQ=255) | ATGCTGGAAATTGCCCCAGCAAAGCGCCTGGGAGCATGAGGTTGCCACCGCATGGTGCGTAACCTGTGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCCGCCCTCAGGCCTTGCGATATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCGGTATAGC‑TGGCCCATAAATTGCTGATCTACCTCATCCCGGGCTGTCAACGTCGACAGCCCTCACCACTTCACGACAAAGGCGCCGTGTTGCCCCGCTTGCATCAGCATGCCGGGGCAGCCGGCGCCTTTTT > NC_002947/1899173‑1899468 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |