| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2052560 | 40 (0.240) | 13 (0.110) | 12/194 | NT | 33.8% | intergenic (‑88/+87) | PP_1824/PP_1825 | Smr domain‑containing protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 2052596 | 22 (0.180) | intergenic (‑124/+51) | PP_1824/PP_1825 | Smr domain‑containing protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
AACAGGGAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCAC > NC_002947/2052447‑2052743 | aaCAGGGAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCt < 1:1988477/150‑1 (MQ=255) cgggaAAAATCGTCGTCTGGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgta > 1:3664907‑M2/2‑147 (MQ=255) aGGGAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgta > 2:2418369‑M2/1‑147 (MQ=255) gggAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGATCCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGTAGACGGCGGGGTGCCTgtag > 2:1166025‑M2/1‑146 (MQ=255) gggAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtag > 1:4051657‑M2/1‑146 (MQ=255) cgcttgcgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAg > 2:929288‑M1/74‑150 (MQ=255) cgcttgcgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAg > 1:2668787‑M1/74‑150 (MQ=255) gAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtagga > 2:1125633‑M2/1‑144 (MQ=255) aaaaaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCCCGCCGAACGGGGTGGCACAGAGCCCGAAGAAGGCGGGGTGGCGgtaggag < 2:5184438‑M2/150‑8 (MQ=255) aaaaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagc > 2:166280‑M2/1‑142 (MQ=255) aaaaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagc > 2:2457163‑M2/1‑142 (MQ=255) aaaaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagc > 1:4496631‑M2/1‑142 (MQ=255) aaaaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAAACCCCTCCAACCGGGATGGAACACAGCCCCAAGAACGCGGGGTGCCCggaggagc < 2:4732599‑M2/150‑9 (MQ=255) aaaaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACATAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagc > 2:1851733‑M2/1‑142 (MQ=255) aaaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcg > 2:2563777‑M2/1‑141 (MQ=255) cgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCgg > 2:937538‑M1/68‑150 (MQ=255) cgccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCgg > 2:2841514‑M1/68‑150 (MQ=255) aaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgg > 1:5406403‑M2/1‑140 (MQ=255) aaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgg > 1:1305251‑M2/1‑140 (MQ=255) aaTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgg > 1:4455104‑M2/1‑140 (MQ=255) gccgcgggcgggagcttaacctgtcgccgcacctgatgaagaagcacgattgatggttttgcgtaaCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCggg > 1:1261497‑M1/67‑150 (MQ=255) aTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGACGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcggg > 1:324267‑M2/1‑139 (MQ=255) aTCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcggg > 2:1071139‑M2/1‑139 (MQ=255) tcgtcTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGGGTAACCGCGCCGACGGGGGTGTGGAAGAGCCCCCAGACGGCGGGGTGGCGGGGGGAGCGGGttga > 2:2324837/1‑148 (MQ=255) tcgtcTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGCTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgggttca < 1:4000420‑M2/150‑16 (MQ=255) cgtcTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgggttcac > 2:2088930‑M2/1‑134 (MQ=255) gCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGGACCCGCTCCGACCGGGGTGTCCCACAGCCCCCAGACCGCCGGGTGCCGggaggagcggggtcacccgccg < 2:4209355‑M2/150‑23 (MQ=255) cATGATGCCTCCCCGTTGGGGGGTTTGTTTCCGCGACTGTGGGGGGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGTTGAACCCGCTCCTACGGGTATGTCACAGAGCCCTATGACGGCGGGGTGCCTGTTGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 2:1472529/150‑1 (MQ=37) atgatgCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgggttcacccgcgaag > 2:4389776‑M2/1‑126 (MQ=255) tgatgCCCCCAGGTTGGCGGCTTAGTTTAGGCGACTGTGGGGCGGTGTGCCGCCTGTGCGGGCCTCTTCGGGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgttggagcgggttcacccgcgaaga > 2:2102884‑M2/1‑125 (MQ=255) gatgCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGTACCCGCGCCTACGGGGCGGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCGgtaggagcggggtcacccgcgaagag < 2:4014134‑M2/150‑27 (MQ=255) ttgcCTCCAGGTTGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGGGCGGGCCTCTTCGGGGGTGAACCCGCTCCGCCGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGGGGGGTGCCTgtaggtgcgggttcacccgcgaagagg > 2:4880031‑M2/2‑123 (MQ=255) ctgCCTCCACGTCGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGGGGGGCGGGGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCGTCGCGGGTGAACCCGCACCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGCCGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAGAgg < 2:4880018/149‑1 (MQ=255) 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tgtgGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGGGTAACCCCACCAAACCGGGTTTCACAAACCCCGCACAACGCGGGGGGGCGGTAAGCCCCGGGTCACCCCCCAACAGGCCCCCCCACGTTAAGCAAAAAcaacaaaagggc > 2:2941893/1‑144 (MQ=255) tgGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGTGCCCGCTCCTACCGGGATGTGCCAGAGCCCGACCACGGCGGGGGGCCGGGGGGAGCGGGTTCACCCCCGAAGAGGCCCCCCCAGGGTACGCAAAACCAACAAACGGGctt > 2:4959227/1‑150 (MQ=255) gggggggGTGTTCCGCGTGTGGGGGCCTGTGCGGGGGGTTACCCGCTCCTCGGGGGTTGCCCACGCCCCCGATGAGGGGGGGGGGGGTGTTGGTGGGGGTGCCCCGGGGATGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGctt < 2:2875247/149‑1 (MQ=255) ggggCCTCTGCGCGGGTTACCCCGCACCTCGGGGGATGTCACAGACCCCGATGAGGGGGGGGTGCCTGTCGGCGGGGGTACCCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAg < 2:4674545/149‑1 (MQ=255) gGGGCCTCTTGGGGGGTGAACCCGCTCCTCGGGGTTTTTCACTGAGCCCTAAGACGGCGGGGGGCCTGTTGGTGGGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAg > 2:4675180‑M1/2‑150 (MQ=255) 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acaGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTgcgc > 2:2688995/1‑150 (MQ=255) caGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggctgcacaccgccccacagtcgcgtaaactacgccgcctacgtggaggca < 2:2233323‑M2/112‑87 (MQ=255) caGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggctgcacaccgccccacagtcgcgtaaactacgccgcctacgtggaggca > 1:2233323‑M2/1‑26 (MQ=255) caGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGcgcc > 1:3858430/1‑150 (MQ=255) gagCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGcgccgc > 2:1411721/1‑150 (MQ=255) gagCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGcgccgc < 2:4758640/150‑1 (MQ=255) cccGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAg > 1:3988366/1‑150 (MQ=255) cccGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAg > 1:3193117/1‑150 (MQ=255) gAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGaaa > 1:2712712/1‑150 (MQ=255) ggcggGGTGCCTgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggctgcacaccgccccacagtcgcgtaaactacgccgc < 1:1838876‑M2/85‑74 (MQ=255) ggcggGGTGCCTgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgcacaggctgcacaccgccccacagtcgcgtaaactacgccgc > 2:1838876‑M2/1‑12 (MQ=255) ggcggGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAacgcacg > 2:3994690/1‑150 (MQ=255) 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ccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCcac > 2:2752235/1‑150 (MQ=255) | AACAGGGAAAAATCGTCGTCTTGCATGATGCCTCCACGTAGGCGGCGTAGTTTACGCGACTGTGGGGCGGTGTGCAGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGATGTCACAGAGCCCGAAGACGGCGGGGTGCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGTTACGCAAAACCATCAATCGTGCTTCTTCATCAGGTGCGGCGACAGGTTAAGCTCCCGCCCGCGGCGCAAGCGGATACGGCTGCGCCGCCAGAAACGCACGCCCAGCCAC > NC_002947/2052447‑2052743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |