| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_002947 | 2,480,371 | Δ3 bp | 7.0% | coding (103‑105/444 nt) | PP_2172 → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2480374 = | 95 (0.580) | 6 (0.050) | 6/216 | NT | 7.0% | coding (106/444 nt) | PP_2172 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 2480370 | 82 (0.620) | coding (102/444 nt) | PP_2172 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CAACCCGCACTTTAGCTACCCACTCGCGCCTCCGGAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTC‑TTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGCTGGAAAGGCGACACGCGATCATGG > NC_002947/2480221‑2480519 | cAACCCGCACTTTAGCTACCCACTCGCGCCTCCGGAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTC‑TTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAg > 2:3265609/1‑150 (MQ=255)cAACCCGCACTTTAGCTACCCACTCGCGCCTCCGGAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTC‑TTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAg > 2:3265277/1‑150 (MQ=255)cAACCCGCACTTTAGCTACCCACTCGCGCCTCCGGAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTC‑TTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAg > 1:3977220/1‑150 (MQ=255)cAACCCGCACTTTAGCTACCCACTCGCGCCTCCGGAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTC‑TTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAg > 1:4428010/1‑150 (MQ=255) aCCCGCACTTTAGCTACCCACTCGCGCCTCCGGAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTC‑TTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGgg < 1:3748411‑M2/150‑3 (MQ=255) ccGCACTTTAGCTACCCACTCGCGCCTCCGGAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTC‑TTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtg < 1:3271146‑M2/150‑5 (MQ=255) tttAGCTACCCACTCGCGCCTCCGGAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTC‑TTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtg < 1:4050645‑M2/150‑11 (MQ=255) gCTACCCACTCGCGCCTCCGGAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTC‑TTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtgg < 1:1356962‑M2/150‑15 (MQ=255) 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cccGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGc > 1:4231621/1‑150 (MQ=255) cccGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGc > 1:4266541/1‑150 (MQ=255) cGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGACGGGCCTTGGAAGTGATCACGCTg > 1:4559592/1‑150 (MQ=255) cGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGCTg > 1:3383271/1‑150 (MQ=255) cGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGCTg > 2:3386060/1‑150 (MQ=255) 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ccatggggggggggggggggggtggtggtgggggcggtggcggtggtcatggcggtggaaacggtgccggacatggcggtggcatgggagggcatagtggaagcgggaagggccttggaagtgatcacgctggaaaggcgacacgcgatc > 2:4266541‑M2/8‑8 (MQ=255) tGCCATGGGGGGTGGTGGTGGTGTTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGCTGGAAAGGCGACACGCGa < 2:961208/150‑1 (MQ=255) ccAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGCTGGAAAGGCGACACGCGATc > 1:3890953/1‑150 (MQ=255) cAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGCTGGAAAGGCGACACGCGATCa > 1:2318552/1‑150 (MQ=255) cAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGCTGGAAAGGCGACACGCGATCa > 1:5356992/1‑150 (MQ=255) gggtggtggtggtggtggtggtggtggcggtggcggtggtcatggcggtggaaacggtgccggacatggcggtggcatgggagggcatagtggaagcgggaagggccttggaagtgatcacgctggaaaggcgacacgcgatcatggggt < 2:3477862‑M2/150‑150 (MQ=255) gggtgggggtggTGGTGGTGGGGGGGGTGGGGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGCTGGAAAGGCGACACGCGATCATgg < 2:3383271/150‑1 (MQ=255) | CAACCCGCACTTTAGCTACCCACTCGCGCCTCCGGAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTC‑TTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGTGATCACGCTGGAAAGGCGACACGCGATCATGG > NC_002947/2480221‑2480519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |