New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5290364 = | 130 (0.790) | 7 (0.050) | 5/208 | NT | 8.1% | intergenic (‑75/+109) | PP_4660/mdaB | LysR family transcriptional regulator/drug activity modulator B |
? | NC_002947 | 5290458 = | 58 (0.450) | intergenic (‑169/+15) | PP_4660/mdaB | LysR family transcriptional regulator/drug activity modulator B |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGCCTT > NC_002947/5290314‑5290607 | catttaTTAGATAACCGTTTTTCGTTGCAAAGTCCATCGGCGCCTTTATGGTCATCTTCGCGGGCTTGCCCGCTACAACAAGTCCTGCAATGTCCTTTATAAATGCGAAATAAATTTGGTAGCGGGCAAGCCCGCTAAGAGGCCGGTACa < 2:5451289/145‑1 (MQ=255) aaGGATTAGATAACGGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAg < 2:4415265/150‑1 (MQ=255) aaGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACAGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGGAATACCTGTGGGAGCGGGCAACCCCGCGAACAGGCCGGTACAg > 2:5191233/1‑150 (MQ=255) aaGGATAAGATAACCGCTTTCCGTGGCCAAGTCCTGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTGCGGGGGTTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGTAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAg < 2:1671033/150‑1 (MQ=37) aTTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTTCCCGCTACCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACAt > 2:3145586/1‑150 (MQ=255) aTTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACAt > 2:382281/1‑150 (MQ=255) aGATACCCGCTTGTCGAGGCCACGTCCAGCGGCGCCTTTATGGGCATCTTCGCGGGCGTGCCCGCCCCCACACGTCCTGCAAAGTCCTTTAAACCTGGGTAATACCTGTGGGTGGGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATaaa < 2:820107/150‑1 (MQ=37) aaCCGGTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTTTTTGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTa < 2:2191036/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCCCGCCCAAAAGTACTGCAAAGTCCGTGTAACCGGCGGAATAACTGTGGGAGCGGGCAACGCCGCGAACAGGCCCGTACCGACCAAAAAATa > 2:978788/1‑150 (MQ=255) gCTGGTCGCGGCCACGTCCTGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACCCGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACtgt < 2:4540295/150‑1 (MQ=37) ccAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTTAAACCTGCGTAATAACTGTGGGAGTGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCaaa > 2:287919/1‑150 (MQ=255) cAAGTCCCGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACCAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAac < 2:3161028/150‑1 (MQ=255) cgTCCAGCGGCGCGAGTATGGGCCTGTGCGCGGGCTGGCCCGCCCCCACCAGTACGGCAAAGTCCTTGAACCCTGCTTAATACCTGTGGTCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAacac < 2:5018645/149‑1 (MQ=255) aGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTACCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATAACGGTTGGAGCGGGCAAGCCCGCGCAGAGGCCGGTACAGACCTAAAAATAAGGTGCCGTGCCCAACAccattt > 2:2774573/1‑146 (MQ=37) gcggcgCCTGTTGGGGCCCCTTCGCGGGTTTCCCCGACCCCACACGAACTCAAAATCCCTTTAAACCTGCTTAATCCCTGGGGGCGGGGGAACGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTc < 2:1516125/150‑1 (MQ=255) gcggcgCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCCCTCCCACAAGTAAAGCCAAGACCATGAAACCATCGGAAAACCAGGGGGAGCGGGCAAGCCCCCGAACAGGCCGGTACCTTCAAAAAATTACGGTGGCCTGCCCAACACCgtgtt > 2:4085897/1‑149 (MQ=255) gggcgCCGTTATGGGCCTCTGCGGGGGCTGGCCCGCTCCAACAAGCACGCCAAAGCCCTTCAACCCGGCTAAATAGCGGTGGGCGGGGCCACCCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTcc < 2:652173/149‑1 (MQ=255) cTGTTTGGGCCTCTCCGGGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAATGTCCTTGAAACCTGCTAAATACGTGGGGGCGGGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATgg < 2:965342/150‑1 (MQ=255) 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TGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAAcgccgc < 1:3354229‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACAcc > 1:646763‑M1/1‑113 (MQ=255) CCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACAcc < 2:646763‑M1/113‑1 (MQ=255) ccgctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggtcGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg > 1:5180657‑M2/76‑150 (MQ=255) ccgctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg > 1:848802‑M2/76‑150 (MQ=255) ccgctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg > 1:4343939‑M2/76‑150 (MQ=255) cgctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg < 2:3336586‑M2/75‑1 (MQ=255) ccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACAcc < 2:3280533‑M2/37‑1 (MQ=255) ccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACAcc > 1:3280533‑M2/70‑106 (MQ=255) CACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATcc < 2:4233049‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATcc < 2:4902915‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATcc < 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tgggcgcggccacccccgctaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGc < 1:674789‑M2/122‑1 (MQ=255) ggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCg < 1:382281‑M2/124‑1 (MQ=255) ggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCg < 1:3145586‑M2/124‑1 (MQ=255) gagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGc < 1:4834463‑M2/24‑1 (MQ=255) gagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGc > 2:4834463‑M2/26‑49 (MQ=255) gagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCgg > 1:419148‑M2/26‑150 (MQ=255) 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gcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGc > 1:2376450‑M2/20‑150 (MQ=255) gcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGc > 1:4389396‑M2/20‑150 (MQ=255) aagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGccc > 1:924912‑M2/18‑150 (MQ=255) agcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCa < 1:4259794‑M2/134‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCGTGCCCAGGa > 1:3338272‑M2/14‑150 (MQ=255) agaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAAcgccgc > 1:299240‑M2/8‑79 (MQ=255) agaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAAcgccgc < 2:299240‑M2/72‑1 (MQ=255) gaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGtt < 2:1080388‑M2/144‑1 (MQ=255) gaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGtt < 2:1228187‑M2/144‑1 (MQ=255) gccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGACCTGGTTGGc > 2:2519303‑M2/4‑150 (MQ=255) gccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGc > 2:4160905‑M2/4‑150 (MQ=255) cGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGCCt > 2:1146727‑M2/2‑150 (MQ=255) | CAAGGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGCCTT > NC_002947/5290314‑5290607 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |