| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 5596065 = | 61 (0.370) | 16 (0.120) | 10/212 | NT | 22.8% | intergenic (‑39/+106) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
| ? | NC_002947 | 5596158 = | 60 (0.460) | intergenic (‑132/+13) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAGC > NC_002947/5596011‑5596307 | ggctggGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGGGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCACAGGGTAAg > 1:4502499/1‑150 (MQ=255) gATGTCATGGTCCTGGCCGCAGGCGTGATGTTAAGTGCCATCCCCCACCCTGTGGGCGGGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCg < 2:605510/150‑1 (MQ=25) cttggtcttgTCGGCTGGTGTGATTTTAAGTGGCATACCCCACCCTGTGGGAGCGGGATGGCCCGCTAACACCGGCAAAGCCGTTGCCATGCACCGAAGTGCTTGTTTCGGGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTa < 2:1441155/148‑1 (MQ=25) catggtcttgTCCGCAGGTGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTa < 2:831188/150‑1 (MQ=255) atggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCCGCAAAGCCGGTGCCAAGCACCCCCGTGCTTGCTTAGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAg > 1:4042498/1‑150 (MQ=37) ggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTTCCCGCGAACAACCGCAAAGCCGGTGCCCGGCACCCCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACACGGTAAGGTGCTGCGGGTTAGAc > 2:4685128/1‑150 (MQ=37) cGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTTCCCGCGCACACCCGCAAAGCCGGTGCCCTGCACCCCAGTGCTTGCGTCGCGGGCAACCCCGCTCCCACACGGTAAGGTGCTGCGGGTTAGACTTTGTGGTa > 2:1399381/1‑150 (MQ=38) cGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTTCCCGCGAAAACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCCCAGTGCTTTCTTCGCCGGCCAGCCCCCTCCCACCGGGTAAGGTGCAGCGGTTTAGACATTGTGGTa > 2:1399390/1‑150 (MQ=37) gTGATGTGAGGTCGCAAACACCACCCTGGGGGCGGGGGCGGCCCCGCGCCCCCCGCCACAGCCGGGCCCAGCCCCCGCCGGGCTGGCTGCGCGGGCAACCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAgctgg < 1:1114543/150‑1 (MQ=255) tGATGTATAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGGGGGCTTGCCGGCGAACCCCGGCAACGCGGGTGCCAGGCACCGCCGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAgctggc < 1:2257835/150‑1 (MQ=37) gatgggaaGTGGCATACCCCCCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAACGCCGGTGCCCGGCCCCGCAGGGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAgctggct < 2:4164956/144‑1 (MQ=25) aTGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGGCCGCGAACACACGCAAAGCCGGTGCCATTCACCCCAGGGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCCCAGGGTAAGGTGCTGGGGGTTAGACTTTGTGGTACCgctggctg > 2:1832680/1‑150 (MQ=37) tAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCCAGCCCGCTCCCACAGGGTGAGGGGCTGCGGGTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCtt > 2:1879631/1‑150 (MQ=255) aaGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGCACACCCGCCAACCCGGTGCCCTGCACCGCACTGCTTTCGTCGCCGGCAAGCCCGCGCCCCCCGGGGGAGGTGGTGGGGTTTGGACGTTGTGGTACAGCGGGCTGCCATc > 2:1833906/1‑150 (MQ=19) aGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAACCGGCAAAGCCGGTGCCAGGCACCGCAGTGCGTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGGTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTcc > 2:369643/1‑150 (MQ=255) gtcgCACACACCACCCTGTGGGAGGGGGCTGGCCCGCCAACACCGGAAAAGCCGGGGCCATGCACCGCTGTGCTTGCTGCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCt < 1:4769094/147‑1 (MQ=37) aTACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACCCCGGCAACGCCGGTGCCAGGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCgg < 2:4329527/150‑1 (MQ=255) caccacCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCCCGAACACCGGCAAATCCGGTGCCAAGCACCGCAGGGGTTTCGTAGCGGGCAAGCCCCCGCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGGTTAGACTTTGTGGTAAAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAAc > 2:1100322/1‑150 (MQ=37) 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cGCAGTGGGTGCTGCGCGGGCACCCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGACCCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTg < 1:316194/150‑1 (MQ=255) cGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTg < 2:1227759/150‑1 (MQ=255) cGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTg > 2:2690649/1‑150 (MQ=255) gCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTgg < 2:4078783/150‑1 (MQ=255) aGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCa > 2:4158315/1‑150 (MQ=255) tgcttgctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGc > 2:3497088/1‑150 (MQ=255) cttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCt > 1:691215/1‑114 (MQ=255) cttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCt < 2:691215/114‑1 (MQ=255) cttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGt > 1:821701/1‑150 (MQ=255) ttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTa < 2:2695795/150‑1 (MQ=255) ttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCa > 1:421435‑M2/29‑150 (MQ=255) ggagcgggcttgcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCa > 2:1271657‑M2/29‑150 (MQ=255) cgggcacgcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTGAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCGTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCGTGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCa < 2:3060681‑M2/126‑1 (MQ=255) aagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCtt > 1:322958‑M2/20‑128 (MQ=255) aagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCtt < 2:322958‑M2/109‑1 (MQ=255) aagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTcc > 2:2051162‑M2/20‑150 (MQ=255) gcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTg > 2:844911‑M2/18‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg < 2:5240743‑M2/134‑1 (MQ=255) cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg > 1:2860257‑M2/17‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg < 1:2702351‑M2/134‑1 (MQ=255) cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg < 2:3717944‑M2/134‑1 (MQ=255) cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg > 1:3658132‑M2/17‑150 (MQ=255) gctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTg > 2:4284649‑M2/14‑150 (MQ=255) tcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGAt > 2:4785905‑M2/12‑150 (MQ=255) ccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCt > 1:2347439‑M2/10‑150 (MQ=255) ccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCt > 2:697068‑M2/10‑150 (MQ=255) acagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTc > 2:643610‑M2/8‑150 (MQ=255) agggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCAt > 2:4562866‑M2/6‑150 (MQ=255) agggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCAt < 1:4679837‑M2/145‑1 (MQ=255) tAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGt > 1:1908680‑M2/2‑89 (MQ=255) aaGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAGc < 1:910348/150‑1 (MQ=255) | GGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAGC > NC_002947/5596011‑5596307 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |