New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5863994 = | 170 (1.030) | 12 (0.070) | 9/262 | NT | 7.2% | coding (773/1059 nt) | fbpC | ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 5864058 = | 141 (0.880) | coding (709/1059 nt) | fbpC | ABC transporter ATP‑binding protein |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GTTGACCGTGATCGCTTCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCC > NC_002947/5863912‑5864205 | aCCGTGATCGCTTCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGcc < 1:1604547/150‑1 (MQ=255) ccGTGATCGCTTCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCa < 2:1780641/150‑1 (MQ=255) cGTGATCGCTTCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCAc > 2:3371553/1‑150 (MQ=255) cGTGATCGCTTCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCAc > 2:5011767/1‑150 (MQ=255) tGATCGCTTCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGa > 2:2925298/1‑150 (MQ=255) tGATCGCTTCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGa > 2:2925136/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGACCGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGt > 2:1738178/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGt > 1:3680846/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGt > 1:276498/1‑150 (MQ=255) tCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTg > 2:4060779/1‑150 (MQ=255) gggCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGcc > 2:3187705/1‑150 (MQ=255) gggCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCGGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGACCTCGGCCCCGAACGCCGTGGcc > 2:5013848/1‑150 (MQ=255) gcAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGggtg < 1:4505760/150‑1 (MQ=255) cAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATa < 1:3948566/150‑1 (MQ=255) ccGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGAt > 2:1598024/1‑150 (MQ=255) ccGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGAt > 1:931869/1‑150 (MQ=255) ggCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGAttt > 1:1625017/1‑150 (MQ=255) ccACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTcc > 1:1308518/1‑150 (MQ=255) 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tgGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCgggg > 1:4280439/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTgg > 1:5052014/1‑150 (MQ=255) cTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGc < 2:4280439/150‑1 (MQ=255) ggCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTa < 1:1487556/150‑1 (MQ=255) tGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTg > 2:4409148/1‑150 (MQ=255) 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gcgcCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCt < 1:3570157/150‑1 (MQ=255) tGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTtca > 2:1991977/1‑150 (MQ=255) gTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACCCg < 2:2195375/76‑1 (MQ=255) gTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACCCg > 1:2195375/1‑76 (MQ=255) ttCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTtcatc > 1:4384513/1‑150 (MQ=255) ttCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTtcatc > 1:1209338/1‑150 (MQ=255) 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GTTGACCGTGATCGCTTCCGGGCGGCAGAACAGCCGGCCACTGCTGGCCTGGGCTGAACCCGGCGCCAGGCGCATGTTCATGTCGCCGACCAGGGCATGGCTGTCGCTGCTGCGCTGGAACGGCAGCCAGTTGCCCTGGCCGACGAACTCGGCCACGAACGGCGTGGCCGGGTGGTCATAGATTTCCTGCGGGGTGGCGTACTGCTCGACCTGGCCGTTGTTCATCACCGCGATGCGGTCGGCCATCAACATGGCCTCGTCCTGGTTGTGGGTAACCATCAACGTGGTGATGCC > NC_002947/5863912‑5864205 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |