| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 6000099 = | 177 (1.080) | coding (308/339 nt) | PP_5254 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
GCTGAACAGCACGGGCTTGCCGCTGCCCCAGTCCTTGAAATAGATCGAAGTGCCATCGCGGGTAACGAACGTGCTCATAGCGGTATCTCCTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGCGCAGCCAGTTGGCGCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCATCGGGCAGATCAC > NC_002947/5999950‑6000247 | cTGAACAGCACGGGCTTGCCGCTGCCCCAGTCCTTGAAATAGATCGAAGTGCCATCGCGGGTAACGAACGTGCTCATAGCGGTATCTCCTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGCGCAGCCAGTTGGCGCAGCGGCGGGt > 2:3437221/1‑150 (MQ=255) tGAACAGCACGGGCTTGCCGCTGCCCCAGTCCTTGAAATAGATCGAAGTGCCATCGCGGGTAACGAACGTGCTCATAGCGGTATCTCCTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGCGCAGCCAGTTGGCGCAGCGGCGGGtt > 2:1879384/1‑150 (MQ=255) aaCAGCACGGGCTTGCCGCTGCCCCAGTCCTTGAAATAGATCGAAGTGCCATCGCGGGTAACGAACGTGCTCATAGCGGTATCTCCTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGCGCAGCCAGTTGGCGCAGCGGCGGGTTAc > 1:5409628/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) gcgcAGCCAGTTGGCGCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGAt > 1:1025548/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCAGTTGGCGCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGAt < 1:4002742/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCCAGTTGGCGCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGAt > 1:290910/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCAGTTGGCGCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGAt > 2:2798984/1‑150 (MQ=255) tgcgccaactggctgcgcggcggGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGa > 2:648718‑M2/24‑150 (MQ=255) ccAGTTGGCGCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCAt < 1:4210657/150‑1 (MQ=255) cAGTTGGCGCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATg < 2:2243260/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGt < 2:1238363/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGGTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCAt > 2:325325/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCATc < 2:3686420/150‑1 (MQ=255) cgcAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACTACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCATCg < 1:4327169/150‑1 (MQ=255) cgcAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCATcc < 1:1388183/150‑2 (MQ=255) cgcAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCATCg < 1:3615998/150‑1 (MQ=255) gcAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCATCgg > 2:3107559/1‑150 (MQ=255) gcAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCATCgg > 2:5306778/1‑150 (MQ=255) gggTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCATCGGGCAGATCa < 2:899867/150‑1 (MQ=255) gGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCTGGATGACGAACATGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGTAGCGCGCAAACAGCGTCGCCAGCAGTTGCTGGATGACCATGGTCATCGTGCAGATCAc < 2:4478610‑M2/149‑1 (MQ=255) gGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCATCGGGCAGATCAc > 1:2741094‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCTGAACAGCACGGGCTTGCCGCTGCCCCAGTCCTTGAAATAGATCGAAGTGCCATCGCGGGTAACGAACGTGCTCATAGCGGTATCTCCTTGAAAGTGTCGAGATGAAGGCGTCGGCTCAGCCGCGCAGCCAGTTGGCGCAGCGGCGGGTTACCCAAGGCATGATGTAGAACACCACGGGCAGGATGACGAACAGGTTGACGATCAGGTTGCCGGTAATCACGCCGCCCAGCTGCGGGAAGCGCGCAAACAGCGGCGCCAGCAGTTGCGGGATGACCATGGTCATCGGGCAGATCAC > NC_002947/5999950‑6000247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |