| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,578,050 | G→C | 5.5% | R80R (CGC→CGG) ‡ | ttgC ← | efflux pump outer membrane protein TtgC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,578,050 | 0 | G | C | 5.5% | 603.5 / 18.5 | 181 | R80R (CGC→CGG) ‡ | ttgC | efflux pump outer membrane protein TtgC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (71/100); new base C (6/4); total (77/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
GCTGGTGATGCCAGATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCAGCCAC > NC_002947/1577903‑1578199 | gctggTGATGCCAGATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGAcgcg > 1:2608910/1‑150 (MQ=255) gCCAGATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTcgcg > 2:1842908/1‑150 (MQ=255) gCCAGATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTcgcg < 1:611243/150‑1 (MQ=255) gCCAGAGTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTcgcg < 2:4586387/150‑1 (MQ=255) gATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACCTGCGCGTCGCggcgt < 1:39436/150‑4 (MQ=255) gATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACCTGCGCGTCGCggcgt < 1:3028274/150‑4 (MQ=255) tCGCCCGTTTGCGACCTGGTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCTCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTg < 2:3967935/150‑1 (MQ=255) gCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGAc < 1:1293556/150‑1 (MQ=255) ccGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCa > 2:4281323/1‑150 (MQ=255) ccGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCa > 2:3094611/1‑150 (MQ=255) gTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGc > 2:1122768/1‑150 (MQ=255) tttGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCg < 2:1719870/150‑1 (MQ=255) ttGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTGTAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTTACCAGCGa < 1:49381/150‑1 (MQ=255) gACGTGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTc > 1:1909109/1‑150 (MQ=255) gACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACCTGCGCGTCGCggcgttga > 1:5417737/1‑132 (MQ=255) gACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACCTGCGCGTCGCggcgttga < 2:5417737/138‑7 (MQ=255) aCATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCt < 1:76118/150‑1 (MQ=255) aTGTTCGCCGGGACACGCTTGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTgg < 2:795968/150‑1 (MQ=255) aTGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTgg < 2:876928/150‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGa < 1:2800801/150‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGa < 2:3505894/150‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGa < 2:378438/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATc > 1:3817594/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCa > 2:4123294/1‑150 (MQ=255) ccGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCt > 1:1713342/1‑150 (MQ=255) ggACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGtt > 1:1020981/1‑150 (MQ=255) ggACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGtt < 2:2280755/150‑1 (MQ=255) ggACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGtt > 2:125732/1‑150 (MQ=255) acGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAg > 1:3702438/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAgcg > 1:4088578/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGcc > 2:1886302/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGcc < 2:4788227/150‑1 (MQ=255) cggcTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCggg < 1:4093165/150‑1 (MQ=255) ggcTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGt < 1:4810809/150‑1 (MQ=255) ggcTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGt < 2:1558272/150‑1 (MQ=255) ggcTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCGGACTGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGt > 2:4940882/1‑150 (MQ=255) gctgccgctgccGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCa < 2:3264535/131‑1 (MQ=255) tgccgctgccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAGCGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGt < 1:431425/150‑1 (MQ=255) tgccgctgccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTAtt > 2:5134179/1‑109 (MQ=255) tgccgctgccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTAtt < 1:5134179/109‑1 (MQ=255) tgccgctgccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGt < 1:431459/150‑1 (MQ=255) tgccgctgccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGt < 2:1675200/150‑1 (MQ=255) cgctgccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGga < 2:3849530/150‑1 (MQ=255) gctgccgGTGGACGAAACCGCCGGTAAAAGGTCGGCGCGATGAATGCGGTATTTCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGgaa < 1:5025284/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTg > 1:2284510/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTg < 2:4870514/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTgg < 1:115416/141‑1 (MQ=255) cGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCa > 1:3336000/1‑150 (MQ=255) cGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCa > 2:1997500/1‑150 (MQ=255) gAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAg > 2:2658359/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGccc < 1:3121551/150‑1 (MQ=255) gccgGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCTAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGgc > 2:2869102/1‑139 (MQ=255) gccgGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCTAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGgc < 1:2869102/139‑1 (MQ=255) gccgGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGt > 2:2414339/1‑150 (MQ=255) ccgGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGtt < 2:3336000/150‑1 (MQ=255) cgGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTc < 1:1032062/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTcagca > 2:1261668/1‑150 (MQ=255) gTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGc > 1:3470814/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCa > 2:4980194/1‑150 (MQ=255) cGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCaa < 1:1842908/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCgg < 1:3349394/145‑1 (MQ=255) gtGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGATGTTCAACGCCGCGTCGCGCATGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATccgc < 1:3200270/149‑1 (MQ=255) cTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATccgc < 2:5271593/150‑1 (MQ=255) tGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATccgcc < 2:442262/150‑1 (MQ=255) aTGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGAt < 2:3702438/150‑1 (MQ=255) tGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGAtt < 2:1231308/150‑1 (MQ=255) tGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGAtt < 2:1766117/150‑1 (MQ=255) cGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGc > 2:4283810/1‑150 (MQ=255) ggTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCg > 2:2985753/1‑150 (MQ=255) tGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGc < 2:5114076/150‑1 (MQ=255) cgcACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGa < 1:965768/150‑1 (MQ=255) gcACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAg > 2:1420030/1‑150 (MQ=255) gcACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAg > 2:26191/1‑150 (MQ=255) gcACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAg > 2:2752994/1‑150 (MQ=255) cACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGt < 2:2696658/150‑1 (MQ=255) aCGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTa > 2:4474880/1‑150 (MQ=255) aCGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCG‑CAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTaa < 2:3406815/150‑1 (MQ=255) cGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTaa < 2:2863578/150‑1 (MQ=255) gTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGATATTGACCAGCGAGGACTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCACCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGAATGCGTCGGCGAGTAAGc > 1:2733638/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAgg < 1:4763507/150‑1 (MQ=255) gCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTca > 1:4446952/1‑108 (MQ=255) cGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGc < 2:2284510/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGcc < 1:3181751/150‑1 (MQ=255) gAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTg > 1:2004887/1‑150 (MQ=255) gAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTg > 1:4743162/1‑150 (MQ=255) aGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGc < 1:4980194/150‑1 (MQ=255) ggTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCg < 1:1466044/150‑1 (MQ=255) tcaataaccgcGACCTGCGCGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGc > 1:2624328/8‑150 (MQ=255) cAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCa < 1:1579328/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCAc < 1:139705/150‑1 (MQ=255) taaccgcGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCg < 2:2327593/141‑1 (MQ=255) taaccgcGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCg > 1:2327593/4‑144 (MQ=255) taaccgcGACCTGCGCGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACt > 2:1356182/4‑150 (MQ=255) accgcGACCTGCGCGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTgc > 2:1554445/2‑150 (MQ=255) ccgcGACCTGCGCGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGa < 2:2206915/124‑1 (MQ=255) ccgcGACCTGCGCGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGa > 1:2206915/1‑124 (MQ=255) gcgACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCa > 2:673372/1‑150 (MQ=255) gcgACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCa < 1:2941871/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGc < 1:2807921/93‑1 (MQ=255) gcgcAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCAGCCAc < 1:4934671/150‑1 (MQ=255) | GCTGGTGATGCCAGATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCAGCCAC > NC_002947/1577903‑1578199 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |