| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,578,055 | G→C | 5.4% | L79V (CTG→GTG) ‡ | ttgC ← | efflux pump outer membrane protein TtgC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,578,055 | 0 | G | C | 5.4% | 620.6 / 18.4 | 186 | L79V (CTG→GTG) ‡ | ttgC | efflux pump outer membrane protein TtgC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (72/103); new base C (6/4); total (78/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GCCAGATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCAGCCACCGGC > NC_002947/1577912‑1578203 | gCCAGAGTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTcgcg < 2:4586387/150‑1 (MQ=255) aGATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGtt > 2:1466044/1‑150 (MQ=255) gATTCGCCCGTTTGCGACCTGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGTGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTa < 1:4576056/150‑1 (MQ=255) gATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACCTGCGCGTCGCggcgt < 1:3028274/150‑4 (MQ=255) tCGCCCGTTTGCGACCTGGTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCTCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTg < 2:3967935/150‑1 (MQ=255) gCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGAc > 1:4046112/1‑150 (MQ=255) gCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGAc > 1:5308897/1‑150 (MQ=255) gCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGAc < 1:1293556/150‑1 (MQ=255) ccGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCa > 2:3094611/1‑150 (MQ=255) gTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGc > 2:1122768/1‑150 (MQ=255) tttGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCg < 2:1719870/150‑1 (MQ=255) ttGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTGTAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTTACCAGCGa < 1:49381/150‑1 (MQ=255) gACGTGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTc > 1:1909109/1‑150 (MQ=255) gACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTc > 1:548987/1‑150 (MQ=255) gACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACCTGCGCGTCGCggcgttga < 2:5417737/138‑7 (MQ=255) aCATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTcgcg > 1:894666/1‑130 (MQ=255) aTGTTCGCCGGGACACGCTTGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTgg < 2:795968/150‑1 (MQ=255) aTGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTgg < 2:876928/150‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGa < 1:2800801/150‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGa < 2:3505894/150‑1 (MQ=255) tGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGa < 2:378438/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATc > 2:1859105/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCa > 2:4123294/1‑150 (MQ=255) ccGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCt > 1:1713342/1‑150 (MQ=255) ggACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGtt > 1:1020981/1‑150 (MQ=255) ggACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGtt < 2:2280755/150‑1 (MQ=255) ggACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGtt > 2:125732/1‑150 (MQ=255) acGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAg > 1:3702438/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAgcg > 1:4088578/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGcc < 2:4788227/150‑1 (MQ=255) cggcTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCggg < 1:4093165/150‑1 (MQ=255) cggcTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCggg < 1:670785/150‑1 (MQ=255) ggcTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGt < 2:1558272/150‑1 (MQ=255) ggcTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCGGACTGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGt > 2:4940882/1‑150 (MQ=255) ggcTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCGGAATGCGGTAGTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCgggc < 1:4810789/150‑2 (MQ=255) gctgccgctgccGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCa < 2:3264535/131‑1 (MQ=255) gctgccgctgccGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCa > 1:3264535/1‑131 (MQ=255) tgccgctgccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAGCGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGt < 1:431425/150‑1 (MQ=255) tgccgctgccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTAtt > 2:5134179/1‑109 (MQ=255) tgccgctgccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGt < 2:1675200/150‑1 (MQ=255) cgctgccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGga < 2:3849530/150‑1 (MQ=255) gccgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGgaagaa < 1:5088875/150‑1 (MQ=255) cgGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCGGCGCCGGGTCGTGGAAGAACt < 2:5054874/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTg > 1:2284510/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTg < 2:4870514/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTgg < 1:115416/141‑1 (MQ=255) gAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAg > 2:2658360/1‑150 (MQ=255) gAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAg < 2:2727749/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGccc < 1:3121551/150‑1 (MQ=255) cgccgGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTg > 1:442262/1‑150 (MQ=255) gccgGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCTAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGgc < 1:2869102/139‑1 (MQ=255) gccgGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGt > 2:2414339/1‑150 (MQ=255) ccgGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGtt < 1:1762638/150‑1 (MQ=255) cgGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTc < 1:1032062/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGc > 2:1360791/1‑150 (MQ=255) gTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGc > 1:3470814/1‑150 (MQ=255) gcgcgcTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCgg > 2:3349394/1‑145 (MQ=255) gcgcgcTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCgg < 1:3349394/145‑1 (MQ=255) cgcTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATcc < 2:2016333/150‑1 (MQ=255) gtGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGATGTTCAACGCCGCGTCGCGCATGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATccgc < 1:3200270/149‑1 (MQ=255) cTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATccgc < 1:3837864/150‑1 (MQ=255) cTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATccgc < 2:1928134/150‑1 (MQ=255) cTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATccgc < 2:5271593/150‑1 (MQ=255) tGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATccgcc < 2:442262/150‑1 (MQ=255) aTGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGAt < 2:3702438/150‑1 (MQ=255) tGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGAtt < 2:1231308/150‑1 (MQ=255) tGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGAtt < 2:1766117/150‑1 (MQ=255) cGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGc > 2:4283571/1‑150 (MQ=255) cGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGc > 2:4283810/1‑150 (MQ=255) cGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGCTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACAACCGCCGATTGc > 2:2635186/1‑150 (MQ=255) ggTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCg > 2:2985753/1‑150 (MQ=255) tGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGc < 2:5114076/150‑1 (MQ=255) cgcACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGa < 1:965768/150‑1 (MQ=255) gcACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAg > 2:2752994/1‑150 (MQ=255) aCGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTa > 2:4474880/1‑150 (MQ=255) aCGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCG‑CAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTaa < 2:3406815/150‑1 (MQ=255) cGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTaa < 2:2863578/150‑1 (MQ=255) ggTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAg > 1:3782364/1‑150 (MQ=255) gTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGATATTGACCAGCGAGGACTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCACCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGAATGCGTCGGCGAGTAAGc > 1:2733638/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAgg < 1:4763332/150‑1 (MQ=255) cGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGc < 2:2284510/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGcc < 1:3181751/150‑1 (MQ=255) gAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTg > 1:2004887/1‑150 (MQ=255) aGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGc < 1:4980194/150‑1 (MQ=255) ggTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCg < 1:1466044/150‑1 (MQ=255) tcaataaccgcGACCTGCGCGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGc > 1:2624328/8‑150 (MQ=255) cAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCa < 1:1579328/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCAc < 1:139705/150‑1 (MQ=255) taaccgcGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCg < 2:2327593/141‑1 (MQ=255) taaccgcGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCg > 1:2327593/4‑144 (MQ=255) accgcGACCTGCGCGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTgc > 2:1554445/2‑150 (MQ=255) ccgcGACCTGCGCGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGa > 1:2206915/1‑124 (MQ=255) ccgcGACCTGCGCGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGa < 2:2206915/124‑1 (MQ=255) gcgACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCa < 1:2941871/150‑1 (MQ=255) gcgACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCa > 2:673372/1‑150 (MQ=255) gcgACGCGCAGGTCGCGGTTACTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCa > 1:4819937/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGc < 1:2807921/93‑1 (MQ=255) gcgcAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCtt > 2:1284143/1‑131 (MQ=255) gcgcAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCAGCCAc < 1:4934671/150‑1 (MQ=255) aGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCAGCCACCGgc < 2:2864609/150‑1 (MQ=255) | GCCAGATTCGCCCGTTTGCGACATGTTCGCCGGGACACGCTGGCGGCTGCCGCTGCCGGTGGCCGAAACCGCCGGGAACAGGTCGGCGCGCTGAATGCGGTATTGCGCACGGTAGGCGTCGAGGTTCAACGCCGCGACGCGCAGGTCGCGGTTATTGACCAGCGAGGTCTGGATCAGCTGTTGCAGCGCCGGGTCGTGGAAGAACTGGCGCCAGCCCTGTTCAGCAGCGGCAACATCCGCCGATTGCGTCGGCGAGTAAGCAGGGCCTTGCGGCCACTGCGCAGCCACCGGC > NC_002947/1577912‑1578203 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |