Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,592,024 | C→A | 15.7% | intergenic (‑89/‑114) | PP_1395 ← / → PP_1396 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,592,024 | 0 | C | A | 15.7% | 439.1 / 64.6 | 166 | intergenic (‑89/‑114) | PP_1395/PP_1396 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (69/70); new base A (13/13); total (82/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
GCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGTCACCCACCTTGCTT > NC_002947/1591875‑1592171 | gCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGcc < 2:4539907/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGcc < 1:4153153/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCcg > 1:3360274/1‑150 (MQ=255) cAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGc < 2:1990316/150‑1 (MQ=255) gCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAg < 2:3864107/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAgg < 1:3907795/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAgg > 1:2735716/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGa < 1:4277428/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGa < 2:3598679/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGACGCGCTGCAGGAt > 1:3565327/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATc < 2:2387801/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTCGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATc < 2:216562/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCa < 1:917772/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCa < 2:525050/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCAg < 1:1061487/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAgg < 1:2842133/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAgg < 1:4744717/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAgg < 1:105229/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATc < 1:4261152/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATc < 1:2430631/150‑1 (MQ=255) cAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCAggagtgcg > 2:1522731/1‑144 (MQ=255) ttCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTCGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCAGGCAATCcaca < 1:3177869/150‑1 (MQ=255) ccAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATg < 2:2858740/150‑1 (MQ=255) cggttcggtGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTCGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCAGGCAATCCACATGCAgcttt < 1:4442689/150‑5 (MQ=37) ggttcggtGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCt > 2:708198/1‑120 (MQ=255) ttcggtGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGc > 2:2516236/1‑150 (MQ=255) ttcggtGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAACTGCATGTCGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCAGGCAATCCACATGCAgctttcga < 1:4893622/150‑8 (MQ=25) cggtGGACGTGGCGGTGGCCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAACGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCt < 1:865242/150‑1 (MQ=255) tGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAgg < 2:4767518/124‑1 (MQ=255) gACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCa > 2:4358654/1‑120 (MQ=255) gACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCa < 1:4358654/120‑1 (MQ=255) cGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAAcgcgc > 1:3017430/1‑150 (MQ=255) cGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAAcgcgc > 1:3017413/1‑150 (MQ=255) gCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAAcgcgccgcg > 1:1332267/1‑150 (MQ=255) ggtggtCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCcgcgcg > 2:4953789/1‑150 (MQ=255) gtggtCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCgg < 2:1674990/150‑1 (MQ=255) gtggtCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCgg < 2:2551188/150‑1 (MQ=255) ggtCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGt < 2:2667528/150‑1 (MQ=255) ggtCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGAAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGt < 1:3185918/150‑1 (MQ=255) ggtCATGAGGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGCTGGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGt < 1:2713199/150‑1 (MQ=255) tCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGa < 2:3033243/150‑1 (MQ=255) tCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCACGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCAAACGCGCCGCGCGGGTGa > 1:209202/1‑150 (MQ=255) atgatgGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAgc < 1:566835/150‑1 (MQ=255) atgatgGCTTTCCACTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAgc < 1:566620/150‑1 (MQ=255) gatgGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAgcgc > 1:2176496/1‑150 (MQ=255) tttCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTCAcc > 1:3810329/1‑150 (MQ=255) tttCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCa > 2:3623030/1‑97 (MQ=255) tCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCtt < 2:5156961/150‑1 (MQ=255) ctctGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTgg < 2:3443867/150‑1 (MQ=255) ctctGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTgg < 2:2015169/150‑1 (MQ=255) tctGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAgg > 1:1354870/1‑94 (MQ=255) gctgACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGc > 1:176911/1‑150 (MQ=255) tgACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTCGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCAGGCAATCCACATGCAgcttt > 2:3801110/1‑103 (MQ=18) aCCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTgg > 2:1657787/1‑150 (MQ=255) cGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGCTCAGGCCATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCGAACCTGGGCAGCCTGGCt > 2:5318553/1‑150 (MQ=255) gACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCtt > 2:1897054/1‑150 (MQ=255) gcagcaTAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTtc > 2:2784606/1‑150 (MQ=255) gcagcaTAGGTGTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTtc > 2:4559483/1‑150 (MQ=255) cagcaTAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTtcc < 2:1507115/150‑1 (MQ=255) gcaTAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTtccgt < 2:1187464/150‑1 (MQ=255) gcaTAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTtccgt > 1:1187464/1‑150 (MQ=255) caTAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCGGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGcc < 1:712684/137‑1 (MQ=255) caTAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCCATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTtccgtc > 1:1892966/1‑150 (MQ=255) aTAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTtccgtcc > 2:1015830/1‑150 (MQ=255) aGGTTTGGGCAAAGCCGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGc < 1:2801132/150‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGc < 2:2425619/150‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGc < 1:4418940/150‑1 (MQ=255) gggCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCGAACCGTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCGGCtt > 1:2277486/1‑150 (MQ=255) gCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCa > 2:1803390/1‑150 (MQ=255) gCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCGTTTCCGTCCGCCTGCTTCa > 2:2446780/1‑150 (MQ=255) cAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCGAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCaa > 1:643179/1‑150 (MQ=255) cAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTCGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAg > 2:752285/1‑64 (MQ=255) aaaGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAg < 2:176911/150‑1 (MQ=255) aGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCTGGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCTGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGga < 1:2484877/150‑1 (MQ=255) aCGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGgaga < 1:2282914/150‑1 (MQ=255) gggCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGAtt < 2:1390841/150‑1 (MQ=255) gggCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGAtt > 2:2820258/1‑150 (MQ=255) cgcTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATtgtg > 1:4792413/1‑150 (MQ=255) tAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCaa > 2:890052/1‑150 (MQ=255) attacTGCATGTCGATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCAGGCAATCCACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGAccc > 1:3806640/5‑150 (MQ=37) aaaGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAg > 2:5162963/1‑132 (MQ=255) aaaGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAg < 1:5162963/132‑1 (MQ=255) aaaGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGAccc < 1:1799194/150‑1 (MQ=255) cTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTaa < 2:3360274/150‑1 (MQ=255) tGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTaaa > 1:3622905/1‑150 (MQ=255) tgtgGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAaacaac < 2:4905103/150‑1 (MQ=255) gtgGATTGCCTGCTCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTACCGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAAcc < 2:3177624/150‑1 (MQ=255) gtcgATTGCCTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCGAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGAATGTGCAATGACCCTTAAACAAcc > 2:752174/4‑150 (MQ=38) gATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCCGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGt > 2:5067611/1‑150 (MQ=255) gATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGt > 1:2954545/1‑150 (MQ=255) ccTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGTcaccc > 2:5044781/1‑150 (MQ=255) ccTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGTcaccc > 2:4708380/1‑150 (MQ=255) cTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGTcaccca > 2:928599/1‑150 (MQ=255) cTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGTcaccca > 1:3737151/1‑150 (MQ=255) cTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGTcaccca > 2:4351245/1‑150 (MQ=255) cTGATCCTGCAGCGCGGCAGGATCAGGCAATCCACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGTcaccca > 2:1269208/1‑150 (MQ=255) cTGATCCTGCAGCGAGGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGACTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCATTCCGCATTCTTAAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGTTcaccca > 2:660466/1‑150 (MQ=255) tGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCTATGACCCTTAAACAACCGGTcacccac > 2:3239283/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGTCACCCACCTTGc < 2:3777249/150‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGTCACCCACCTTGCtt > 1:3071706/1‑150 (MQ=255) | GCTCGGCCAGCTCCAGGCGCTGCAGTTCCAGGGTCGGTTCGGTGGACGTGGCGGTGGTCATGATGGCTTTCCTCTGCTGACCGACGCAGCATAGGTTTGGGCAAAGACGGGCGCTAGTCGAAAGCTGCATGTGGATTGCCTGATCCTGCCGCGCTGCAGGATCAGGCAATCGACATGCAGTAATGGCCTAACGCGCCGCGCGGGTGAGCGCCTAACCTTGGCAGCCTGGCTTTTCCGTCCGCCTGCTTCAAGGAGATTGTGCAATGACCCTTAAACAACCGGTCACCCACCTTGCTT > NC_002947/1591875‑1592171 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |