| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 93,252 | C→G | 6.4% | L114L (CTG→CTC) ‡ | trpB ← | tryptophan synthase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 93,252 | 0 | C | G | 6.4% | 616.8 / 24.1 | 187 | L114L (CTG→CTC) ‡ | trpB | tryptophan synthase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (93/82); new base G (3/9); total (96/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.55e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
ATCTCGGCGCCCAGCAGCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGCGG > NC_002947/93103‑93401 | tctcGGCGCCCAGCAGCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCa < 2:5380206/150‑1 (MQ=255) ctcGGCGCCCAGCAGCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAg < 1:1120538/150‑1 (MQ=255) tcGGCGCCCAGCAGCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAgg < 2:764271/150‑1 (MQ=255) cagcagCTTCATGCGGAAGACGTTTGGCTTCTGACGTTCAACGTCAGTGGCACCCATATAGACCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGGGCTGCAACGGTTGCTGATGCAACGCCATGCTGACCAGCGCCGGTTTCCGCGATGATGCGGgtttt > 1:5388746/1‑150 (MQ=255) cagcagCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCttttt > 1:2648231/1‑150 (MQ=255) cagcagCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCttttt < 1:3999072/150‑1 (MQ=255) cagcagCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCttttt < 2:4409882/150‑1 (MQ=255) agcagcTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTg < 1:2143037/150‑1 (MQ=255) gcagcTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGc < 2:2439389/150‑1 (MQ=255) cTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCAt < 1:1094864/150‑1 (MQ=255) aTGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATgcgc > 1:3825468/1‑150 (MQ=255) tGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCa > 2:688068/1‑129 (MQ=255) tGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCa < 1:688068/129‑1 (MQ=255) tGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCt > 1:2354733/1‑150 (MQ=255) gCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCtt < 1:17241/150‑1 (MQ=255) gCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCtt < 1:774676/150‑1 (MQ=255) cacGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCcag > 2:2337066/1‑150 (MQ=255) cacGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCcag < 2:5222851/150‑1 (MQ=255) cGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCcagca < 1:194442/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTg > 2:137408/1‑130 (MQ=255) gTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCcagcag > 2:1274186/1‑150 (MQ=255) cGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCAc < 1:4184727/150‑1 (MQ=255) gctgGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGc < 1:3369206/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGAt > 2:3820204/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGAt > 2:4247756/1‑150 (MQ=255) cgcTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATg < 2:4074267/150‑1 (MQ=255) gcTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGc > 2:1791305/1‑150 (MQ=255) gcTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGc > 2:4829034/1‑150 (MQ=255) cTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCa > 2:3913644/1‑150 (MQ=255) cTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCa < 1:2427726/150‑1 (MQ=255) tCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAg < 1:4645392/150‑1 (MQ=255) aacgTCAGTGGCACCCATATAGACCACGCAAGGCAGGCCGAAACGGGCTGCAACGGTTGCTGATGCAACGCCATGCTGACCAGCGCCGGTTTCCGCGATGATGCGGGTTTTGCCCATGCGCTTGGCAAGCAGGATCTGGCCGAGGCAatt < 1:3417085/147‑1 (MQ=255) aacgTCAGTGGCACCCATATAGACCACGCAAGGCAGGCCGAAACGGGCTGCAACGGTTGCTGATGCAACGCCATGCTGACCAGCGCCGGTTTCCGCGATGATGCGGGTTTTGCCCATGCGCTTGGCAAGCAGGATCTGGCCGAGGCAatt < 1:1296038/147‑1 (MQ=255) tcagTGGCACCCATCGAGACCCCGCCAGGCAGGCCGAACCGGGCTGCAACGGTTGCTGATGCAACGCCATGCTGACCAGCGCCGGTTTCCGCGATGATGCGGGTTTTGCCCATGCGCTTGGCAAGCAGGATCTGGCCGAGGCAattgtta < 2:3024270/147‑2 (MQ=255) gTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCAcc < 2:1686963/150‑1 (MQ=255) tGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCt > 1:1312396/1‑150 (MQ=255) gCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTtg > 2:3549636/1‑150 (MQ=255) cACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTtgt < 1:1206719/150‑1 (MQ=255) aCCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTtgtg > 1:3480785/1‑150 (MQ=255) cccATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTgc < 1:1712426/150‑1 (MQ=255) ccATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCAAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTgcg > 2:4885444/1‑150 (MQ=255) cATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTgcgc > 1:2767397/1‑150 (MQ=255) aTGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTgcgcg > 2:3321481/1‑150 (MQ=255) gATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGt > 2:577965/1‑150 (MQ=255) cACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAgttg < 2:3342989/127‑1 (MQ=255) cACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAgttg > 1:3342904/1‑127 (MQ=255) cACGCAAGGCAGGCCGAAACGGGCTGCAACGGTTGCTGATGCAACGCCATGCTGACCAGCGCCGGTTTCCGCGATGATGCGGGTTTTGCCCATGCGCTTGGCAAGCAGGATCTGGCCGAGGCAATTGTTAATCTTGTGGCTGCCGGTATg < 1:4405528/150‑1 (MQ=255) aCGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATgg > 2:2919071/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGtt > 2:1254068/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGtt < 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gcgACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGaaa < 2:928213/150‑1 (MQ=255) gACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAAt > 2:2538564/1‑150 (MQ=255) atgcacggtgtcgCCACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCtt < 2:5188199/133‑1 (MQ=255) atgcacggtgtcgCCACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCtt > 1:5188199/6‑138 (MQ=255) aGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCtt > 1:4525777/1‑150 (MQ=255) 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ggtggcgACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTcc > 2:198458/1‑150 (MQ=255) acacCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCaa > 2:2615311/1‑150 (MQ=255) acacCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCaa < 2:113248/150‑1 (MQ=255) gTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTc < 2:3492401/150‑1 (MQ=255) tGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCg < 1:489149/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTc > 1:2607933/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAgg < 1:1652206/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAgg < 2:441122/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAgg < 2:3303982/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGgc > 1:1196605/1‑150 (MQ=255) cGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGgc > 2:4601598/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGgcgc > 1:170728/1‑150 (MQ=255) cgcCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCt < 2:64405/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCg < 1:3679574/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCgg < 2:1196605/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCgg > 1:2027258/1‑150 (MQ=255) ggTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGc < 1:4461640/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGaa < 2:3260425/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGaa < 2:3825565/150‑1 (MQ=255) ggCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTa > 2:2209065/1‑150 (MQ=255) ggCGATCAGGCGCTTGTTGACAATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGAAGGTGTTCACCTTGTGCTCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGAGCTCGGCGAAGTa > 2:109252/1‑150 (MQ=255) cgCGATGATGCGGGTTTTGCCCATGCGCTTGGCAAGCAGGATCTGGCCGAGGCAATTGTTAATCTTGTGGCTGCCGGTATGGTTCAGGTCCTCGCGCTTAAAGTAAATCTTTGc < 2:4057982/113‑1 (MQ=255) gCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTAc > 1:1043038/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAg < 2:2767397/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGCgg < 1:1778446/150‑1 (MQ=255) | ATCTCGGCGCCCAGCAGCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGCGG > NC_002947/93103‑93401 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |