| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 93,259 | T→G | 5.6% | K112T (AAG→ACG) ‡ | trpB ← | tryptophan synthase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 93,259 | 0 | T | G | 5.6% | 604.4 / 18.6 | 179 | K112T (AAG→ACG) ‡ | trpB | tryptophan synthase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (90/79); new base G (2/8); total (92/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.25e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
CGCCCAGCAGCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGCGGGTTGGGG > NC_002947/93110‑93408 | cagcagCTTCATGCGGAAGACGTTTGGCTTCTGACGTTCAACGTCAGTGGCACCCATATAGACCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGGGCTGCAACGGTTGCTGATGCAACGCCATGCTGACCAGCGCCGGTTTCCGCGATGATGCGGgtttt > 1:5388746/1‑150 (MQ=255) cagcagCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCttttt < 2:127624/150‑1 (MQ=255) cagcagCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCttttt < 1:3999072/150‑1 (MQ=255) cagcagCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCttttt < 2:4409943/150‑1 (MQ=255) cagcagCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCttttt > 1:2648231/1‑150 (MQ=255) cagcagCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCttttt < 1:2386149/150‑1 (MQ=255) cTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCAt < 1:1094864/150‑1 (MQ=255) aTGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATgcgc > 1:3825565/1‑150 (MQ=255) aTGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATgcgc > 1:3825468/1‑150 (MQ=255) gAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGc < 2:4315975/150‑1 (MQ=255) cacGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCcag < 2:5222851/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTg < 1:137408/130‑1 (MQ=255) gTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCcagcag > 2:2912915/1‑150 (MQ=255) cGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCAc > 2:4014297/1‑150 (MQ=255) cGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCAc < 1:4184727/150‑1 (MQ=255) gctgGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGc < 1:3369206/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGAt > 2:3820204/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGAt > 2:1079777/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGAt > 2:4247756/1‑150 (MQ=255) cgcTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATg < 2:4074267/150‑1 (MQ=255) gcTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGc > 2:1791305/1‑150 (MQ=255) cTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCa > 2:760183/1‑150 (MQ=255) cTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCa > 2:3913644/1‑150 (MQ=255) tCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAg < 1:4645392/150‑1 (MQ=255) aacgTCAGTGGCACCCATATAGACCACGCAAGGCAGGCCGAAACGGGCTGCAACGGTTGCTGATGCAACGCCATGCTGACCAGCGCCGGTTTCCGCGATGATGCGGGTTTTGCCCATGCGCTTGGCAAGCAGGATCTGGCCGAGGCAatt < 1:3417085/147‑1 (MQ=255) tcagTGGCACCCATCGAGACCCCGCCAGGCAGGCCGAACCGGGCTGCAACGGTTGCTGATGCAACGCCATGCTGACCAGCGCCGGTTTCCGCGATGATGCGGGTTTTGCCCATGCGCTTGGCAAGCAGGATCTGGCCGAGGCAattgtta < 2:3024270/147‑2 (MQ=255) cGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCa > 1:2055586/1‑150 (MQ=255) gTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCAcc < 2:1686963/150‑1 (MQ=255) tGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCt > 1:1312630/1‑150 (MQ=255) gCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTtg > 2:3549636/1‑150 (MQ=255) aCCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTtgtg > 1:3480785/1‑150 (MQ=255) aCCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTtgtg > 2:4890271/1‑150 (MQ=255) cccATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTgc < 1:1712426/150‑1 (MQ=255) cccATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTgc < 2:1126703/150‑1 (MQ=255) cATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTgcgc > 1:2767397/1‑150 (MQ=255) aTGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTgcgcg > 2:3321481/1‑150 (MQ=255) aTGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTgcgcg > 2:4769517/1‑150 (MQ=255) tAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCg < 2:4448358/150‑1 (MQ=255) gATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGt > 2:577965/1‑150 (MQ=255) aTCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTa > 1:1307909/1‑150 (MQ=255) tCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGTGACAGTGGAGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCGTGTGCGCGCCGGTAt > 2:4875624/1‑150 (MQ=255) cACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAgttg < 2:3342989/127‑1 (MQ=255) cACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAgttg > 1:3342904/1‑127 (MQ=255) cACGCAAGGCAGGCCGAAACGGGCTGCAACGGTTGCTGATGCAACGCCATGCTGACCAGCGCCGGTTTCCGCGATGATGCGGGTTTTGCCCATGCGCTTGGCAAGCAGGATCTGGCCGAGGCAATTGTTAATCTTGTGGCTGCCGGTATg < 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aaGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTCGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGa < 1:507703/150‑1 (MQ=255) caggcCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCTGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGctc > 2:2363318/1‑150 (MQ=255) caggcCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGctc > 2:5347651/1‑150 (MQ=255) caggcCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGctc > 2:1522086/1‑150 (MQ=255) caggcCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGctc > 2:3167655/1‑150 (MQ=255) 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ccGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCa < 2:3602752/150‑1 (MQ=255) gcgcgcGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCtt > 2:1655942/1‑150 (MQ=255) gcgcgcGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCtt < 2:2672009/150‑1 (MQ=255) gcggcgACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTgaag > 2:2189276/1‑150 (MQ=255) ggcgACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCTGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTgaagaa < 1:1165575/150‑1 (MQ=255) 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cgcCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCt < 2:64405/150‑1 (MQ=255) gcCGGTTTCCGCGATGATGCGGGTTTTGCCCATGCGCTTGGCAAGCAGGATCTGGCCGAGGCAATTGTTAATCTTGTGGCTGCCGGTATGGTTCAGGTCCTCGCGCTTAAAGTAAATCTTTGCGCCACCCAGATGCTTGGTCAGgccttc < 1:4898207/150‑5 (MQ=255) ccGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCg < 1:3679574/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCgg < 2:1196605/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGTCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGc < 1:70004/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGc < 1:4461640/150‑1 (MQ=255) tttCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGa > 2:1134590/1‑150 (MQ=255) ttCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTGGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGaa < 1:1747238/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGaa < 2:3825565/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGaa < 2:3260425/150‑1 (MQ=255) ggCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTa > 2:2523312/1‑150 (MQ=255) gCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTAc > 1:1043038/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGc < 1:198458/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGCgg < 1:1778483/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCGTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGCggg < 2:1446453/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCtt > 1:2527087/1‑90 (MQ=255) cgcTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGCGGGTTg < 1:1629273/150‑1 (MQ=255) gcTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGCGGGTTgg > 2:2248227/1‑150 (MQ=255) cTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGCGGGTTggg < 2:3198752/150‑1 (MQ=255) | CGCCCAGCAGCTTCATGCGGAACACGTTCGCCTGCTGGCGCTCGATGTCGGTGGCACCCATGTAGATCACGCAAGGCAGGCCGAAGCGCGCGGCGACAGTGGCGGTGGCGACACCGTGCATGCCGGCGCCGGTTTCGGCGATCAGGCGCTTTTTGCCCATGCGCTTGGCCAGCAGCACTTGGCCGATGCAGTTGTTCACCTTGTGCGCGCCGGTATGGTTGAGCTCTTCACGCTTGAAGAAAATCTTCGCTCCGCCGCAATGCTCGGTCAGGCGCTCGGCGAAGTACAGCGGGTTGGGG > NC_002947/93110‑93408 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |