Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,645,927 | T→A | 7.0% | Q491L (CAG→CTG) | gcd ← | quinoprotein glucose dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,645,927 | 0 | T | A | 7.0% | 418.4 / 15.9 | 128 | Q491L (CAG→CTG) | gcd | quinoprotein glucose dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (62/57); new base A (5/4); total (67/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CCACTGCGCCTTGTGGGGTGGGGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGTCCGGGGTCTGG > NC_002947/1645778‑1646076 | aCTGCGCCTTGTGGGGTGGGGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCggctgg > 1:2618209/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTTGTGGGGTGGGGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCggctggct > 1:701528/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTTGTGGGGTGGGGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTGTTCAGGTGTACCAGGGTCggctggct > 2:2551932/1‑150 (MQ=255) cgcCTTGTGGGGTGGGGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGc < 1:4310480/150‑1 (MQ=255) cgcCTTGTGGGGTGGGGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGc < 1:1565545/150‑1 (MQ=255) ttGTGGGGTGGGGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGAc > 1:2199168/1‑150 (MQ=255) ttGTGGGGTGGGGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACAAGGGTCGGCTGGCTGCCGAc > 1:2513950/1‑150 (MQ=255) gtgtgGGGTGGGGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCAGCCAGCCGAc < 2:1674267/149‑1 (MQ=255) gtggggtgggGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGt > 2:2343743/1‑150 (MQ=255) gtggggtgggGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCAGCCAGCCGAccc < 1:2369110/150‑3 (MQ=255) gtggggtgggGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTGGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTGTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGt < 2:474915/150‑1 (MQ=255) ggggtggggATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTcc < 1:1964737/150‑1 (MQ=255) ggtggggATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCAt < 2:130463/150‑1 (MQ=255) gggATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGAACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTAGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGACGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCAAGTcc > 1:5149526/1‑150 (MQ=255) ggATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTccc < 2:2271571/150‑1 (MQ=255) tcGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAgg > 1:2452742/1‑150 (MQ=255) tcGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAgg > 1:2688260/1‑150 (MQ=255) gcgGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTc < 2:2240273/150‑1 (MQ=255) gcgGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCAGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCggctg > 1:625639/1‑123 (MQ=255) aTCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCgtgg < 1:2712055/150‑1 (MQ=255) aTCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCgtgg < 2:2211677/150‑1 (MQ=255) ggCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGtggtgg < 1:3252506/150‑1 (MQ=255) gCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTggtggg > 2:1136189/1‑150 (MQ=255) cACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTggtgggt > 2:743758/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAAc < 1:1040034/150‑1 (MQ=255) ggCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCATGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGa < 2:305606/150‑1 (MQ=255) ggCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGa < 2:4748988/150‑1 (MQ=255) ggCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGGGGTGGGTGAACTGa > 2:1663869/1‑150 (MQ=255) gCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGAt > 2:2163398/1‑150 (MQ=255) cGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATa < 2:2877383/150‑1 (MQ=255) cGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATa < 2:4265343/150‑1 (MQ=255) cGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATa < 2:2485945/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTAGCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCt > 2:4275891/1‑150 (MQ=255) tCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGATTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACATGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTg > 2:2682746/1‑150 (MQ=255) tCGAGCACGTACAGGCTGCCGTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGGGCCTTg < 1:5006494/150‑1 (MQ=255) cGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGc < 2:151759/150‑1 (MQ=255) cGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGc < 2:791533/150‑1 (MQ=255) gAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGcc < 1:1511808/150‑1 (MQ=255) gAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGcc < 1:1511781/150‑1 (MQ=255) gAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGcc < 2:3394568/150‑1 (MQ=255) gAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGcc < 1:80671/150‑1 (MQ=255) gAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGCCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGcc > 1:2254862/1‑150 (MQ=255) cACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGt < 1:3785949/150‑1 (MQ=255) gTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGc > 2:275960/1‑150 (MQ=255) aCAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCa > 1:2653562/1‑150 (MQ=255) aCAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCa < 2:359787/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAg < 1:796204/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGt > 1:3728600/1‑150 (MQ=255) ggCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGt > 1:4731513/1‑150 (MQ=255) gCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTc > 2:3846108/1‑150 (MQ=255) gCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTc > 2:2836332/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCaa > 2:5194980/1‑150 (MQ=255) gCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAg < 1:2063372/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAg < 1:1168503/150‑1 (MQ=255) ccTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCAGCCAGCCGAccctg < 2:956823/84‑5 (MQ=255) ccTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCAGCCAGCCGAccctg > 1:956823/1‑80 (MQ=255) cttgcttgGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAggg > 1:3446157/1‑150 (MQ=255) tgcttgGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCg < 1:4334611/150‑1 (MQ=255) ttgGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGAcc > 2:4010097/1‑150 (MQ=255) ggTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCAc > 2:1438118/1‑150 (MQ=255) cGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGcc > 1:4947278/1‑150 (MQ=255) ggTACGATGATCGCCGTTTTCAAACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACAAGGGTCGGCTGGCTGCCTACGTCCATGTCACACAGGTCGTGGTTGGTGAACTGTTAGTTGGAGCGTGCCTTGGCGGTGGCGAGGTCATGGGCGACCACGCCg > 2:4519834/1‑150 (MQ=255) tACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGgc > 1:3365505/1‑150 (MQ=255) aCGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGgcg < 2:4947278/150‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGt > 1:117797/1‑120 (MQ=255) gatgatCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGt < 2:117797/120‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACTACGCCGGCGCt < 2:2676023/150‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCt > 1:3935785/1‑150 (MQ=255) gatCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTa < 2:1405895/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGTTTCATACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACt > 2:52357/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTtct > 2:4824608/1‑150 (MQ=255) ccGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTtct > 2:49746/1‑150 (MQ=255) gTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCgg > 1:3489705/1‑150 (MQ=255) cacaCCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGcc > 2:845104/1‑150 (MQ=255) acacCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGc > 1:3873013/1‑91 (MQ=255) acacCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGccc > 1:4844181/1‑150 (MQ=255) acCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGt > 2:5078923/1‑91 (MQ=255) acCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCgg > 1:3053381/1‑150 (MQ=255) ccATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCggg < 1:4837807/150‑1 (MQ=255) cATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCgggg > 2:2576093/1‑150 (MQ=255) gtcgGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCg > 2:3542258/1‑150 (MQ=255) gtcgGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCg > 2:4773905/1‑150 (MQ=255) gTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGAc > 2:4304896/1‑110 (MQ=255) gTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGAc < 1:4304896/110‑1 (MQ=255) ttttCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCgg > 2:2792264/1‑150 (MQ=255) aGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGccc < 1:3794358/150‑1 (MQ=255) aGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGccc < 1:831529/150‑1 (MQ=255) gtgtACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCa > 2:1864679/1‑150 (MQ=255) gtgtACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGACCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGccccg < 2:2618209/150‑2 (MQ=255) tggacgTCGGCAGCCAGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGt > 1:2464733/6‑150 (MQ=255) ccAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGt > 1:2584659/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGTc > 2:437187/1‑150 (MQ=255) aGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGGTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGTcc < 1:5194980/150‑1 (MQ=255) acgTCGGCAGCCAGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGTCCg > 2:51701/3‑150 (MQ=255) ggTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGTCCgg < 2:1719142/150‑1 (MQ=255) gTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGTCCggg < 2:4404572/150‑1 (MQ=255) gTCGGCAGCCAGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCAc > 2:4068697/1‑141 (MQ=255) gTCGGCAGCCAGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCAc < 1:4068697/141‑1 (MQ=255) tggctgCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGTCCGGGGTCTgg < 2:701528/150‑1 (MQ=255) tggctgCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGTCCGGGGTCTgg < 2:4116904/150‑1 (MQ=255) | CCACTGCGCCTTGTGGGGTGGGGATCTCGCGGATCGGCACGATTGGCGTACCGTCGCGGCGGTCGAGCACGTACAGGCTGCCTTGCTTGGTCGGTACGATGATCGCCGGTTTCACACCATCGTCGGTTTTCAGGTGTACCAGGGTCGGCTGGCTGCCGACGTCCATGTCCCACAGGTCGTGGTGGGTGAACTGATAGTTCCAGCGTGCCTTGCCGGTGGCCAGGTCAAGGGCGACCACGCCGGCGCTGTACTTCTCGGCGCCCGGGGTGCGGTCGGCGCCCCACTGGTCCGGGGTCTGG > NC_002947/1645778‑1646076 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |