| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,695,062 | C→G | 8.1% | A329G (GCC→GGC) | wspC → | biofilm formation methyltransferase WspC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,695,062 | 0 | C | G | 8.1% | 686.0 / 38.3 | 210 | A329G (GCC→GGC) | wspC | biofilm formation methyltransferase WspC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (79/114); new base G (5/12); total (84/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
GCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATC > NC_002947/1694913‑1695211 | cggtgcgtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGc > 1:2035747/3‑150 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt < 1:3369983/150‑1 (MQ=255) ttCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTg < 2:4187488/150‑1 (MQ=255) ttCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTg < 2:576092/150‑1 (MQ=255) cACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGTCGGCATTGGCCAGCCggg < 1:4173801/150‑2 (MQ=255) cACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGc < 2:3813898/150‑1 (MQ=255) cACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGc < 1:4265337/150‑1 (MQ=255) cgacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCa < 2:2272936/150‑1 (MQ=255) gacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGc < 1:4629680/147‑1 (MQ=255) gacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCaa > 2:39607/1‑150 (MQ=255) gTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGc < 2:5290000/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGcc < 1:2518056/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGcc < 2:5364120/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCTGCTCGCTG‑GCACCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCgg < 1:2793151/150‑1 (MQ=25) tGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCg < 1:1552132/150‑1 (MQ=255) gCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCgg > 2:4742440/1‑150 (MQ=255) cccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGt < 2:4649047/150‑1 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 2:5107220/1‑150 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 1:1350143/1‑150 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCAGTGCCCGGCGGGCCAATGCCGGTg > 2:1630327/1‑150 (MQ=255) cGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCggcca < 2:4763587/150‑4 (MQ=255) cACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCa < 1:39607/150‑1 (MQ=255) ggTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGc < 2:4552194/144‑1 (MQ=255) ggTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGc > 1:4552194/1‑144 (MQ=255) ggTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGGTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGa < 2:5149455/150‑1 (MQ=255) tttATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGc < 1:937495/150‑1 (MQ=255) tATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAg > 1:5341913/1‑150 (MQ=255) aTCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAgg > 1:222456/1‑150 (MQ=255) aTCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAgg < 1:4889559/150‑1 (MQ=255) tCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGc < 1:4029788/150‑1 (MQ=255) tCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGc > 1:3868627/1‑150 (MQ=255) cAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGt < 1:5052328/150‑1 (MQ=255) cAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt < 1:4257951/114‑1 (MQ=255) cAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGAAGCGa > 2:2871892/1‑150 (MQ=255) gtgtGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAAt < 2:3285609/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCaa > 2:4125302/1‑150 (MQ=255) cGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc < 1:3436047/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc < 1:4234954/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc < 1:3710878/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc < 1:1390004/150‑1 (MQ=255) ttGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGTCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGc < 2:3181964/150‑1 (MQ=255) gCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTa < 2:2022152/150‑1 (MQ=255) cTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGTCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAcc > 2:3588899/1‑150 (MQ=255) 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agCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActg < 1:2607206/150‑1 (MQ=255) agCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActg > 1:439454/1‑150 (MQ=255) gcgAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggct < 1:4806732/150‑1 (MQ=255) cgAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggctg < 1:3554781/150‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggctgg < 2:1511544/150‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggctgg < 1:1930426/150‑1 (MQ=255) cccGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGtt > 2:5182450/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGttt > 2:4971644/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGttt < 1:5011041/150‑1 (MQ=255) gcgAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGc > 2:4937767/1‑150 (MQ=255) 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gggggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCGACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAgg < 1:569129/150‑1 (MQ=255) ggggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGc > 2:5368704/1‑150 (MQ=255) ggggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGc < 1:471657/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCg > 2:789177/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGAt > 1:1103094/1‑150 (MQ=255) 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gAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCgcag > 1:3748478/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgc > 2:2658948/1‑150 (MQ=255) gcaccGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCGGCGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc > 2:1145433/4‑150 (MQ=255) gCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTg > 1:2679269/1‑150 (MQ=255) gCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTg > 1:1139210/1‑150 (MQ=255) 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GCGTGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATC > NC_002947/1694913‑1695211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |