| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 95,665 | A→C | 10.8% | intergenic (+57/+15) | PP_0087 → / ← PP_0088 | hypothetical protein/alkanal monooxygenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 95,665 | 0 | A | C | 10.8% | 280.3 / 5.8 | 96 | intergenic (+57/+15) | PP_0087/PP_0088 | hypothetical protein/alkanal monooxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/15); new base C (2/11); total (69/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.39e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTAC > NC_002947/95519‑95811 | cTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGcc > 1:5224737/1‑150 (MQ=255)cTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGcc > 1:5224767/1‑150 (MQ=255) tGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGccc < 1:4462715/150‑1 (MQ=255) tGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGccc < 2:1092960/150‑1 (MQ=255) tGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGccc < 1:5419437/150‑1 (MQ=255) ggAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGTGCGAGCCcg < 2:4998700/150‑1 (MQ=255) ggAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCcg > 1:4985054/1‑150 (MQ=255) ggAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCcg > 2:5177173/1‑150 (MQ=255) ggAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGAGTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCcg < 2:5092510/150‑1 (MQ=255) gTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAg > 1:1254458/1‑150 (MQ=255) tCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAgg > 1:635965/1‑150 (MQ=255) aaaGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGTGACGAGGGTCAc < 1:657301/150‑1 (MQ=255) aaGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACt > 2:653012/1‑150 (MQ=255) tGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCatat > 2:558596/1‑150 (MQ=255) gggggCGGGTACCACGTTGTTTGTTTCCCGCCGCGGCTATTGTTTTTGCTCTTGCGGGGGATTGCGCGCACCCACGAAACCCTCGGGGCGGGGGCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGa < 2:2234770/147‑1 (MQ=255) gAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGAc > 2:344905/1‑150 (MQ=255) ggcggttACCATGGATTTTTTTTCCCGCCGGGGCTATTGTGTTTGCTCTTGCGCGGGCTTGCTCGCTCCCCCGTCAACCTCTGGGCGGGGGGGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCg < 2:4448237/144‑1 (MQ=255) ggCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATAAGATCg > 1:1764314/1‑150 (MQ=255) aaGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTcc > 1:1077571/1‑150 (MQ=255) aaGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTcc > 2:3415848/1‑150 (MQ=255) gagaTTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCa > 2:2909455/1‑150 (MQ=255) gagaTTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCa > 2:1453855/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGc > 2:5223524/1‑150 (MQ=255) ttGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCt > 1:4141357/1‑150 (MQ=255) ttGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCt > 2:3721752/1‑150 (MQ=255) tgtACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCAt > 1:2640511/3‑150 (MQ=255) aCCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACa > 1:2666295/1‑150 (MQ=255) gcgGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTcac > 2:5382247/1‑150 (MQ=255) gggttattgttTTTGCTCTTTGGGGGGGTTGCTCGATCCAACGTCCCCGTTTGGTTGGGGGGGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTcaca < 2:391222/143‑1 (MQ=255) cgGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTcaca > 1:3298702/1‑150 (MQ=255) ggCTATTGTTTTTGCTCTTTCGGGGGGTTGCTCGATCCAAATTCAACCTTTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAg < 2:4021706/150‑1 (MQ=255) gCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAgg > 2:4989621/1‑150 (MQ=255) aaTGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTaa > 1:550214/1‑150 (MQ=255) 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tttGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAATGATCa > 1:383600/1‑150 (MQ=255) tttGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCa > 1:1495949/1‑150 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCa > 1:1640730/1‑150 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCa > 2:2777406/1‑150 (MQ=255) tCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCa > 1:337757/1‑150 (MQ=255) 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ccAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCcagca > 1:1814512/1‑150 (MQ=255) ccAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCcagca > 1:3619997/1‑150 (MQ=255) ccAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCcagca > 2:557493/1‑150 (MQ=255) aaGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCagcagc > 2:234530/1‑150 (MQ=255) acaaaaCCTTGGGGTGCGGCCTCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAgcagca < 2:2923048/146‑1 (MQ=255) gTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCAc < 2:2886884/150‑1 (MQ=255) tCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCa < 2:921914/64‑1 (MQ=255) tCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCa > 1:921914/1‑64 (MQ=255) aCCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCt > 2:3755935/1‑150 (MQ=255) ccTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTa > 1:3332693/1‑150 (MQ=255) ttGGGAGCGAGCAAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCt > 2:3908903/2‑150 (MQ=255) ggggggggggCGCCCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCCTATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCtt < 1:1080406/143‑1 (MQ=255) gggtgggggCGTCCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTg < 2:3151757/144‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAg > 2:4431353/1‑109 (MQ=255) ggAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAg < 1:4431353/109‑1 (MQ=255) tcgCGGGCTCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGc > 2:4389538/3‑150 (MQ=255) tcgCGGGCTCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGc > 2:3996723/3‑150 (MQ=255) gtgggggCGCGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGc < 2:1254458/146‑1 (MQ=255) cGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCtt > 2:1610682/1‑150 (MQ=255) gggCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCttt < 1:4989621/150‑1 (MQ=255) gCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTAc < 1:5146302/150‑1 (MQ=255) gCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTAc > 1:3197840/1‑150 (MQ=255) | CTGGAGATCGTCAAGAAAGGCGAGCCGGCGGGCAAGGTGATTGGTAGCTGCGAGGCCGGTACCAAGGAGATTGTTTACCGCCGCGGCTAATGTGTTTGCTCATTCGCGGGCTTGCTCGCTCCCAAGTCAACCTATGGGAGCGGGCGAGCCCGCGACGAGGGTCACTCGGTCTTGAGGGCCTGCGCCATCAGCTCATATGACCGAATGCGGTCCGCATGCTCATACAGGTCACAGGTAAAGATCAGCTCATCCGCACCCGTCTGTTCCAGCAGCACTTCTACCTTGGCCTTTAC > NC_002947/95519‑95811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |