| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_002947 | 1,942,409 | 0 | T | A | 7.8% | 278.0 / 10.2 | 101 | intergenic (+44/‑161) | betX/yjcH | choline/betaine/carnitine ABC transporter substrate‑binding protein BetX/inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (58/32); new base A (2/6); total (60/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.24e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GGCGAGGTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATGTTGTTTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCTGTGCTGC > NC_002947/1942261‑1942556 | ggCGAGGTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATGTTGTTTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTc < 2:4183495/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATGTTGTTTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCt < 2:1706768/150‑1 (MQ=255) aGGTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATGTTGTTTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTAc > 1:1185203/1‑150 (MQ=255) 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GGCGAGGTGATGCTGGCGATCCAGGAAGGGGCCAAGCCTGAAGCGGCCGCCAAGGACTGGGTCGCCAAGCACCCTGATCGTGTGAAGGAGTGGACTGGCAAGTAAAAGCCTTCCAGGGCCAATGTTGTTTCTTCGCGGGTAAA‑CCCGCTCCTACGGGTGCGGGTTTACCCGCGAACGGGTCATCACTTTGTTACGCAATCGGTAAAACACCGTTGCATCTAAGACTAAGGTCGTCTGGTTGGCGTCCATCGGCAGCATAAAGTAAGGGTGTGGGTTCCATCCCGTATCTGTGCTGC > NC_002947/1942261‑1942556 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |