Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 2,004,616 | 0 | T | C | 5.2% | 490.4 / 9.9 | 152 | intergenic (+63/+87) | PP_1787/PP_1788 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (69/75); new base C (4/4); total (73/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) tttGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCTCAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGa < 2:1105258/150‑1 (MQ=255) tttGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCTCAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGa < 2:3828624/150‑1 (MQ=255) tttGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCTCAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGa < 2:5386433/150‑1 (MQ=255) ttGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCTCAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGAt < 1:4648058/150‑1 (MQ=255) | CGCCCGTATTTTCAAGGTTTCAAAGTTCGCGGTCGAAATTTAAAAGTGAGTTTTTTGACGTGACTGAAATGACGCTTAATGCTTAATAAGATATTTATAGTCTACCTCCCCTTGACATGCCCCGAAAATGAAATAGCTTATTGCAGATTTGCAATAAGCTATTTCTAAATTTGTTAGCTGAGGCGATCGGTTTTTTGGATGTGAAACCGCTCGCCTCAGGCTTTGTGATGTGTATTTATGATAGTGTTGATCTAAGCTTGCAATACGGATTGGTTTTAATGGTGCCATCTTTTTTGAT > NC_002947/2004468‑2004765 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |