| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,053,030 | 0 | T | A | 5.8% | 554.3 / 15.4 | 189 | intergenic (‑63/+23) | PP_1825/PP_1826 | hypothetical protein/isochorismatase family hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (91/81); new base A (6/6); total (102/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
ACAGGCCGGCCGCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGACGCG > NC_002947/2052883‑2053179 | cAGGCCGGCCGCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGcc < 1:876098/150‑1 (MQ=255) ggccggccGCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCgg < 2:2267820/150‑1 (MQ=255) gccggccgCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCggg < 2:1836314/150‑1 (MQ=255) ccggccgCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGc > 2:3146321/1‑150 (MQ=255) cggccgCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGGGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCg < 1:1213583/150‑1 (MQ=255) cggccgCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCg > 1:2203679/1‑150 (MQ=255) cggccgCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCg > 1:2203546/1‑150 (MQ=255) ccgccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTc < 1:4488916/150‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTc < 1:1523196/150‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTc < 1:1861859/150‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCAGTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCAGCCGGGCggaa < 2:3713015/150‑3 (MQ=255) cgccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTcc > 2:696388/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGc < 1:980216/150‑1 (MQ=255) 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ccccAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCa < 1:298159/150‑1 (MQ=255) cccAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAg > 2:2302685/1‑150 (MQ=255) ccAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCCCTCAGa > 1:1023232/1‑150 (MQ=255) cAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGGCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGAt < 2:3336901/150‑1 (MQ=255) cAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCGGCAAGCCGCTCAGAt > 2:3703086/1‑150 (MQ=255) 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tgctgcCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCAACACGGCCATTTCGCCCAGGTGAAAATGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGaa > 1:2603447/1‑150 (MQ=255) gctgcCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAAt < 2:4345762/150‑1 (MQ=255) gcCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGcc < 2:2534198/150‑1 (MQ=255) cccATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCa > 2:4915730/1‑150 (MQ=255) cccATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCa < 1:4976355/150‑1 (MQ=255) 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ggaccGCCCGGCAGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAAt < 1:1348496/119‑1 (MQ=255) gaccGCCCGGCAGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCaa > 2:5154246/3‑65 (MQ=255) ccGCCCGGCAGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTg > 1:2744/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGc > 1:3992993/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGc > 2:825768/1‑150 (MQ=255) cccGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAAt < 1:5373588/116‑1 (MQ=255) cccGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAAt > 2:5373588/1‑116 (MQ=255) cccGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGcc < 1:2302685/150‑1 (MQ=255) cGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGa > 1:392856/1‑150 (MQ=255) cGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGa > 1:1923576/1‑150 (MQ=255) ggCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGAc < 2:396526/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAAt > 2:1143032/1‑112 (MQ=255) cTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGAcgc < 2:2393/150‑1 (MQ=255) cTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGAcgc < 1:4210731/150‑1 (MQ=255) | ACAGGCCGGCCGCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGACGCG > NC_002947/2052883‑2053179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |