| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,170,156 | G→C | 5.3% | intergenic (+91/+597) | PP_1921 → / ← PP_1922 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,170,156 | 0 | G | C | 5.3% | 506.4 / 13.5 | 152 | intergenic (+91/+597) | PP_1921/PP_1922 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (72/72); new base C (5/3); total (77/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
AGGATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAG > NC_002947/2170007‑2170304 | ggATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCaga < 1:2569600/150‑1 (MQ=255) gATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCagag < 1:4920554/150‑1 (MQ=255) aTCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGc > 2:2440416/1‑150 (MQ=255) tctcCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCt < 1:3849693/150‑1 (MQ=255) tcCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAg > 2:469285/1‑150 (MQ=255) ccAGAGGGACAAAACTAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGc > 1:2489441/1‑150 (MQ=255) ccAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGc > 2:34034/1‑150 (MQ=255) ccAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGc < 1:4171137/150‑1 (MQ=255) ccAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGc > 1:865275/1‑150 (MQ=255) ccAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGc > 1:1301494/1‑150 (MQ=255) aaaaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTg < 2:3595076/150‑1 (MQ=255) aaaaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTg > 1:2977593/1‑150 (MQ=255) aaaCGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTgg > 1:1645591/1‑150 (MQ=255) gAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCAtt > 2:703563/1‑150 (MQ=255) aTAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATtgt < 2:1301494/150‑1 (MQ=255) tAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTTGCATtgtg > 1:3453549/1‑150 (MQ=255) tCTTTTTTTGGGGGCTTTTTGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACGGAAAAGCGCGAATTAAGTATTATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCTGATGCGGTTCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCg < 2:146032/150‑1 (MQ=255) cTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCgg < 2:2150321/150‑1 (MQ=255) cTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCgg < 1:4614498/150‑1 (MQ=255) tATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTGATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCgat > 2:5221411/1‑148 (MQ=255) ttGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGtctc > 1:4366386/1‑142 (MQ=255) ttGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGtctc < 2:4366386/142‑1 (MQ=255) ggggCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAgctgc > 2:4672573/1‑150 (MQ=255) ggCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGctgctg < 1:1986621/150‑1 (MQ=255) tttATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTg > 2:2861746/1‑150 (MQ=255) tttATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATAGCTTATTTGGGGCCGTAGGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTg > 2:1719859/1‑150 (MQ=255) tATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGAc > 1:4539727/1‑150 (MQ=255) tATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGAc > 1:3704651/1‑150 (MQ=255) tgctgcGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCt > 1:182410/1‑150 (MQ=255) tgctgcGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCt > 1:5293177/1‑150 (MQ=255) tgcGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCtata < 1:5141427/150‑1 (MQ=255) gcGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAg > 2:1196088/1‑150 (MQ=255) gACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATCAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGcc < 2:566376/150‑1 (MQ=255) tACGCGGTATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGaa > 2:4641286/1‑150 (MQ=255) tACGCGGTATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGaa > 2:4641179/1‑150 (MQ=255) ccgcgGCAGAGAGCGACCGAAAAGCGCGAAGGAAGTAATCGCCGATGTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGaaa < 2:3777704/149‑1 (MQ=255) aCGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGTAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGaaa < 1:2538950/150‑1 (MQ=255) cgcgGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTTTTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAg < 1:2783795/150‑1 (MQ=255) gcgGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGc > 1:2259827/1‑150 (MQ=255) cgGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCt < 2:2172470/150‑1 (MQ=255) cgGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCt < 2:1586937/150‑1 (MQ=255) gCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAGGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTgg < 2:2921757/150‑1 (MQ=255) gCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTgg < 1:1619440/150‑1 (MQ=255) gCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTgg < 2:2640160/150‑1 (MQ=255) gCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTgg < 1:1102659/150‑1 (MQ=255) aTAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGTGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGt > 2:4237719/1‑150 (MQ=255) gCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCttt < 2:2212870/150‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGa < 1:3152030/150‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGa < 2:5124125/150‑1 (MQ=255) ccGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAg > 2:455298/1‑150 (MQ=255) cGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGt > 1:3162928/1‑150 (MQ=255) cGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGt > 1:552913/1‑150 (MQ=255) gAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTc < 2:4076250/150‑1 (MQ=255) gAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTc > 2:1379622/1‑150 (MQ=255) aaaaGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCg > 2:5197569/1‑150 (MQ=255) cgAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGa > 2:5027667/1‑150 (MQ=255) gAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGaa < 2:4294321/150‑1 (MQ=255) aaTTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAAt < 2:1616501/150‑1 (MQ=255) aTTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATg > 1:1244263/1‑150 (MQ=255) tAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTa < 2:81523/150‑1 (MQ=255) gTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCATTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTacaa < 1:24334/150‑1 (MQ=255) aaTATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg > 1:1574034/1‑127 (MQ=255) aaTATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTacaaca < 2:309775/150‑1 (MQ=255) atCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGtt < 2:3417681/150‑1 (MQ=255) tCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTg > 2:388048/1‑150 (MQ=255) cTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTgg < 1:2514688/150‑1 (MQ=255) ttATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg > 1:1687403/1‑121 (MQ=255) ttATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTg < 2:1687403/121‑1 (MQ=255) ttATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGc > 1:2160368/1‑150 (MQ=255) ttATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGc > 2:3952585/1‑150 (MQ=255) tATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCa > 2:4375526/1‑150 (MQ=255) tATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCa > 2:690351/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCAcc > 1:3577831/1‑150 (MQ=255) tGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCgc < 1:4672573/150‑1 (MQ=255) ccGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTc > 1:4119549/1‑150 (MQ=255) gTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTcac > 1:335022/1‑150 (MQ=255) aTGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTAAAACAGTTGGCACCGCTGCTCACaa > 1:2913963/1‑150 (MQ=255) tgtgCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAg > 1:4019231/1‑150 (MQ=255) tgCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGc < 1:3644563/150‑1 (MQ=255) gCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCt < 1:1415628/150‑1 (MQ=255) tttGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGa < 1:1149392/150‑1 (MQ=255) tttGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGa > 2:552874/1‑150 (MQ=255) ttGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGAc < 2:4103545/150‑1 (MQ=255) ttGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGAc < 1:1332611/150‑1 (MQ=255) tCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTc < 1:4641179/150‑1 (MQ=255) tCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTc < 1:469285/150‑1 (MQ=255) cAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTcc < 2:4653637/150‑1 (MQ=255) gATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCtt < 1:34034/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCTAGCTCTGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACaa > 1:803352/1‑130 (MQ=255) cGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTcc < 2:1882218/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTcc < 2:3273861/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTcc < 2:2636976/150‑1 (MQ=255) ggTGCTAGCTCTGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCg > 1:5174028/1‑150 (MQ=255) ggTGCTAGCTCTGCTAGCACCGCATTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCg > 1:4469352/1‑150 (MQ=255) tGCTAGCTCTGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTc > 2:3274479/1‑150 (MQ=255) tGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTc < 2:182410/150‑1 (MQ=255) gCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGAc < 2:5189145/128‑1 (MQ=255) gCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGAc > 1:5189145/1‑128 (MQ=255) gCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCAtctc < 1:5232905/150‑1 (MQ=255) agagCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAg > 1:648581/1‑150 (MQ=255) | AGGATCTCCAGAGGGACAAAACGAATAGCATCTATTTTTGGGGGCTTTATGCTGCGTGACTACGCGGCATAGAGCTACCGAAAAGCGCGAATTAAGTAATATCTTATTTGGGGCCGTATGTGCTTTGAAAGTCAGATGCGGTGCTAGCAGAGCTAGCACCGCTTTTGGCATTGTGTCTCGGGCAAGCTGCTGGTGACCTATAGCGCCGAAAGCTGGGTGCTTTGGAGTCGCTCTCGAATGTACAACAGTTGGCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAG > NC_002947/2170007‑2170304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |