| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,238,330 | G→T | 11.7% | L492L (CTG→CTT) | uvrB → | uvrABC excinuclease protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,238,330 | 0 | G | T | 11.7% | 490.3 / 42.3 | 162 | L492L (CTG→CTT) | uvrB | uvrABC excinuclease protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (71/72); new base T (11/8); total (82/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACG > NC_002947/2238182‑2238479 | aGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTggg < 1:191605/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGc > 1:3782419/1‑150 (MQ=255) ggCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGc > 1:3782844/1‑150 (MQ=255) gagcgagTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCAcc > 2:2068482/1‑150 (MQ=255) gagcgagTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCAcc > 2:1087583/1‑150 (MQ=255) agTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGa > 1:613000/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACg > 2:3742273/1‑150 (MQ=255) cTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTg > 2:335794/1‑150 (MQ=255) gACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCtggt > 1:185208/1‑150 (MQ=255) gACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCtggt > 2:3212114/1‑150 (MQ=255) ccACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCtggtgg < 2:228271/150‑1 (MQ=255) cACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTggg > 1:3138698/1‑150 (MQ=255) ttGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATc < 2:1188305/150‑1 (MQ=255) aCCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCGACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAAc < 1:3848914/150‑1 (MQ=255) cAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACct > 2:135819/1‑150 (MQ=255) aaaCGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACctg > 2:1226507/1‑150 (MQ=255) gcGCATGGCAGAAGACCTGACCGAATATCTGCATGAACAAGGTGTTCGCGTACGTTACATGCACTCGGACATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACctgct < 1:1092431/149‑1 (MQ=255) gcGCATGGCAGAAGACCTGACCGAATATCTGCATGAACAAGGTGTTCGCGTACGTTACATGCACTCGGACATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACctgct < 1:1605969/149‑1 (MQ=255) 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gACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTg < 2:454931/150‑1 (MQ=255) gACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTg < 1:5406487/150‑1 (MQ=255) gACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTg < 2:500188/150‑1 (MQ=255) gACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCGGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTg > 2:4173079/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCGATTTCCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGa < 2:3080503/150‑1 (MQ=255) ccTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGa < 2:1924194/150‑1 (MQ=255) tCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGa < 2:3697203/139‑1 (MQ=255) cAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACAt > 1:5040048/1‑150 (MQ=255) tACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAg < 2:2927316/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGAGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAg < 2:1278832/150‑1 (MQ=255) 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gacgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACTCGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTgg < 1:2553565/124‑1 (MQ=255) gacgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTgg > 2:2553565/1‑124 (MQ=255) gacgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGcc < 2:3160316/150‑1 (MQ=255) acgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACGTGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCa < 1:3996156/150‑1 (MQ=255) cGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTc < 1:1387361/150‑1 (MQ=255) aCGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGc > 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aGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCt < 1:5014710/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTcc < 1:1740552/150‑1 (MQ=255) gaTTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCa > 2:575744/1‑150 (MQ=255) ttATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGa > 2:2502757/1‑150 (MQ=255) ttATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGa < 2:1413600/150‑1 (MQ=255) ccGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCAt > 1:2335702/1‑150 (MQ=255) ccGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAt < 1:3212174/150‑1 (MQ=255) cgcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAtt > 2:890228/1‑150 (MQ=255) cgcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAtt < 1:2068482/150‑1 (MQ=255) gcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTcc > 1:2277477/1‑125 (MQ=255) gcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTg > 1:2289647/1‑150 (MQ=255) gcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTg > 2:3048459/1‑150 (MQ=255) atcTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCATCggtc < 2:3572417/148‑3 (MQ=255) atcTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGGATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCATCggtc < 1:2843261/148‑3 (MQ=255) aCCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGcc > 2:4558110/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCcgcg > 2:5003028/1‑150 (MQ=255) gcCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCgg > 1:3092937/1‑150 (MQ=255) gcCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCgg > 1:3341429/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGc > 1:4659281/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGc < 1:3859265/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGc > 2:3296965/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGc < 1:135819/150‑1 (MQ=255) tGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGTGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCAc > 1:5449068/1‑150 (MQ=255) tGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCAc < 2:2271155/150‑1 (MQ=255) gggCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACg > 1:1999016/1‑150 (MQ=255) | CAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACG > NC_002947/2238182‑2238479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |