Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,238,384 | G→T | 7.8% | M510I (ATG→ATT) | uvrB → | uvrABC excinuclease protein B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,238,384 | 0 | G | T | 7.8% | 546.4 / 26.7 | 167 | M510I (ATG→ATT) | uvrB | uvrABC excinuclease protein B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (79/75); new base T (8/5); total (87/80) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGC > NC_002947/2238238‑2238532 | tACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAg < 1:2797076/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAg < 2:2927316/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGAGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAg < 2:1278832/150‑1 (MQ=255) aCCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAgg < 2:2150967/150‑1 (MQ=255) tGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGgtgt < 1:3742273/150‑1 (MQ=255) tGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGgtgt > 1:328332/1‑150 (MQ=255) tGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGgtgt > 2:3501700/1‑150 (MQ=255) cGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ct < 2:4686175/150‑1 (MQ=255) cGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ct < 2:4686170/150‑1 (MQ=255) gacgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGcc < 2:3160316/150‑1 (MQ=255) acgTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACGTGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCa < 1:3996156/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATc > 1:1380601/1‑150 (MQ=255) tGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATcc < 2:3635188/150‑1 (MQ=255) cGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCg < 1:4959182/150‑1 (MQ=255) cTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGa > 2:1130851/1‑150 (MQ=255) aCCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACa > 1:2155104/1‑150 (MQ=255) ccTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACac > 2:3527577/1‑149 (MQ=255) cTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACaag > 1:1136212/1‑150 (MQ=255) cTCGGACATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACaaggaagg > 1:885340/1‑150 (MQ=255) tCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGt < 2:4677470/150‑1 (MQ=255) tCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGt > 2:1957646/1‑150 (MQ=255) tCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGt < 2:2514902/150‑1 (MQ=255) tCGGACATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGAACTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACaaggaaggc > 1:2172267/1‑149 (MQ=255) aCATCGACACGCTGGAACGCATCGAAATCATCCGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGcttcc < 2:1832861/150‑3 (MQ=255) cATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCt < 2:556028/150‑1 (MQ=255) cATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCt < 2:1836036/150‑1 (MQ=255) cATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCt < 2:273761/150‑1 (MQ=255) cGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCg < 2:5280452/150‑1 (MQ=255) acacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGtt > 1:77871/1‑150 (MQ=255) acacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGtt > 1:55163/1‑150 (MQ=255) cacGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTc < 2:1401435/150‑1 (MQ=255) acGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTcc < 1:5344909/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ctggtgg < 1:4230232/110‑1 (MQ=255) ggTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑Ctggtgg > 2:4230232/1‑110 (MQ=255) ggAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAgcg > 2:2172998/1‑150 (MQ=255) aGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCt < 1:5014710/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTcc < 1:1740552/150‑1 (MQ=255) ggAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGAt > 1:3988982/1‑150 (MQ=255) gaTTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCa > 2:555570/1‑150 (MQ=255) ttATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGa > 2:2502757/1‑150 (MQ=255) ttATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGa < 2:1413600/150‑1 (MQ=255) ccGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATCTTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCag > 2:4525924/1‑149 (MQ=255) ccGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCAt > 1:1724104/1‑150 (MQ=255) ccGCGATCTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGTATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCAt > 1:2335702/1‑150 (MQ=255) ccGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAt < 1:3212114/150‑1 (MQ=255) cgcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAtt < 1:2068482/150‑1 (MQ=255) gcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTcc > 1:2277477/1‑125 (MQ=255) gcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTg > 2:3048459/1‑150 (MQ=255) gcgACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTg > 1:2289647/1‑150 (MQ=255) atcTGCGCCTTGGCGCTTTCGATGGATTGGTGGGTATCAACCTGCTGCGCGAGGGTCTCGATATTCCGGA‑ATGCGGTTTCGTCGCCATTCTGGATGCCGACAAGGAAGGCTTCCTACGTTCGGAAACTTCGCTGGTCCAGACCATCggtc < 1:2843261/148‑3 (MQ=255) aCCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGcc > 2:4558110/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCcgc > 1:4545213/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCcgcg > 2:5003028/1‑150 (MQ=255) gcCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCgg > 1:3092937/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGc < 1:135819/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGc > 1:4659281/1‑150 (MQ=255) tGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGTGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCAc > 1:5449068/1‑150 (MQ=255) tGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCAc < 2:2271155/150‑1 (MQ=255) gggCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACg > 1:1999016/1‑150 (MQ=255) ggCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGt < 2:2289647/150‑1 (MQ=255) ggCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGt > 1:1080905/1‑150 (MQ=255) cTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCt > 1:2564559/1‑150 (MQ=255) cTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCt < 2:4001631/150‑1 (MQ=255) cGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCaa < 2:328332/150‑1 (MQ=255) aCGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATg < 2:3341429/150‑1 (MQ=255) aCGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATg < 1:1087583/150‑1 (MQ=255) aCGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATg > 2:1751090/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCgg < 2:3336104/150‑1 (MQ=255) ggtggGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGc < 2:3782827/150‑1 (MQ=255) ggtggGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGc < 2:3782419/150‑1 (MQ=255) ggtggGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGc < 1:2407460/150‑1 (MQ=255) gtggGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCAtt < 1:1456639/117‑1 (MQ=255) gtggGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGcc > 1:51334/1‑150 (MQ=255) tggGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCa > 1:2404276/1‑150 (MQ=255) tggGCATCAACCTGCGGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCa > 1:2404443/1‑150 (MQ=255) gCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTc > 2:2012575/1‑150 (MQ=255) aTCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTg > 2:3123935/1‑150 (MQ=255) aTCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTg > 2:3187753/1‑150 (MQ=255) cAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTa < 2:1678431/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACg > 2:4346165/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGc < 2:1080905/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCg > 2:4837967/1‑150 (MQ=255) tgcGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATa < 1:335446/150‑1 (MQ=255) tgcGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATa < 1:335794/150‑1 (MQ=255) tgcGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATa < 1:2672127/150‑1 (MQ=255) gcgcGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATac > 2:5391514/1‑149 (MQ=255) gcgcGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATaa > 2:3541183/1‑150 (MQ=255) gcgcGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATaa > 2:799961/1‑150 (MQ=255) gggCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAAc < 2:905564/150‑1 (MQ=255) ccTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAgg > 2:4203129/1‑150 (MQ=255) cTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCt > 2:1789084/1‑128 (MQ=255) tGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCt < 2:2298993/150‑1 (MQ=255) gACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGc > 2:297957/1‑98 (MQ=255) gACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGc < 1:297957/98‑1 (MQ=255) gACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTcc < 1:2502757/150‑1 (MQ=255) gACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTcc > 2:3221215/1‑150 (MQ=255) aCATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCa > 1:788203/1‑150 (MQ=255) cATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCAt > 2:2456736/1‑150 (MQ=255) aTGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATg < 1:4441148/150‑1 (MQ=255) tGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGc < 2:3138698/150‑1 (MQ=255) | GATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACGGTGGAGCGGGTGGAGATTATCCGCGACCTGCGCCTGGGCACCTTCGACGTGCTGGTGGGCATCAACCTGCTGCGCGAGGGCCTGGACATGCCCGAGGTGTCG‑CTGGTGGCCATCCTCGATGCGGACAAGGAAGGTTTTCTGCGTTCCGAGCGCTCCCTGATCCAGACCATTGGCCGCGCGGCACGTAACCTCAATGGCCGGGCCATTCTGTACGCCGATAACGTAACAGGCTCCATGC > NC_002947/2238238‑2238532 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |