Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 2,423,923 | G→A | 5.5% | P82P (CCG→CCA) | moeA → | molybdenum::molybdopterin ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 2,423,923 | 0 | G | A | 5.5% | 566.8 / 14.7 | 180 | P82P (CCG→CCA) | moeA | molybdenum::molybdopterin ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (101/69); new base A (7/3); total (108/72) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.42e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
CGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGATGGCCGGGTGCG > NC_002947/2423774‑2424072 | cgcgAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCg < 1:2498656/150‑1 (MQ=255) cgcgAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCg > 1:4630197/1‑150 (MQ=255) gcgAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCgg > 1:1089461/1‑150 (MQ=255) 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gaCCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTcag > 2:3220670/1‑150 (MQ=255) aCCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTcagc > 1:4429219/1‑150 (MQ=255) gAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTcagccag > 1:934194/1‑150 (MQ=255) gAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTcagccag > 2:3891881/1‑150 (MQ=255) aaaaCCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTcagccagc < 1:3492523/150‑1 (MQ=255) aaaaCCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTcagccagc > 2:4382607/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCCGCGTAtt > 2:2944758/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTAttt > 1:723326/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGACAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTAttt > 2:2111975/1‑150 (MQ=255) tGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCg < 2:2108558/150‑1 (MQ=255) 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CGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTCAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGATCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGATGGCCGGGTGCG > NC_002947/2423774‑2424072 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |