| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,449,018 | G→C | 6.6% | A148P (GCC→CCC) ‡ | nagZ → | beta‑N‑acetylglucosaminidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,449,018 | 0 | G | C | 6.6% | 604.4 / 24.2 | 183 | A148P (GCC→CCC) ‡ | nagZ | beta‑N‑acetylglucosaminidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (86/85); new base C (6/6); total (92/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
TGAGCAGTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTG > NC_002947/2448870‑2449167 | tGAGCAGTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGc > 1:1354208/1‑150 (MQ=255)tGAGCAGTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGc > 2:1168367/1‑150 (MQ=255) gCAGTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCgg < 1:1218753/150‑1 (MQ=255) aGTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGgcg > 1:2910742/1‑150 (MQ=255) tGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGGCCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGcgcg > 1:1251284/1‑150 (MQ=255) gCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGGCCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGt < 2:1251283/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCGGCCAGGCGCGtt < 2:642351/150‑1 (MQ=255) tggctgATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCGGCCAGGCGCGttgcaa < 1:2203926/150‑5 (MQ=255) tgATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTg > 2:2230334/1‑150 (MQ=255) gACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGaa > 1:1784404/1‑150 (MQ=255) cGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATgc > 2:1761560/1‑150 (MQ=255) aGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATgcgg > 1:4358454/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATgcgtcg < 2:2843268/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATgcggcg < 1:2063806/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCggg > 1:1609934/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGCCGCATTCATgccacgga < 2:5113677/150‑7 (MQ=255) gCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGCCGCATTCATgccacgga < 2:1212667/150‑7 (MQ=255) tGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCGGCCAGGCGCGtt > 2:634726/1‑124 (MQ=255) tGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCGGCCAGGCGCGtt < 1:634726/124‑1 (MQ=255) gCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATg > 2:5449433/1‑150 (MQ=255) ggTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGgc > 2:285149/1‑150 (MQ=255) gCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCt < 2:319511/150‑1 (MQ=255) cTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCtgt > 1:1899272/1‑150 (MQ=255) ggACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTgg < 1:1234674/150‑1 (MQ=255) ccTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCaa < 1:3921999/150‑1 (MQ=255) cTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAg > 2:2009554/1‑150 (MQ=255) cAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCa > 1:2338077/1‑150 (MQ=255) ttCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTc < 2:3013295/150‑1 (MQ=255) ttCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTc < 2:4849540/150‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTcc < 2:78658/150‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTcc < 2:3858853/150‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTcc < 1:3628311/150‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTcc < 1:267021/150‑1 (MQ=255) gCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCg < 2:3892601/150‑1 (MQ=255) cTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCgg < 2:2642477/150‑1 (MQ=255) cTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCgg > 2:4140262/1‑150 (MQ=255) cTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCgg < 2:4397609/150‑1 (MQ=255) tCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCggg > 2:1896241/1‑150 (MQ=255) tCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCggg > 2:4980018/1‑150 (MQ=255) gTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCAt < 1:4761139/150‑1 (MQ=255) gCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATgg < 1:285149/150‑1 (MQ=255) tCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCt > 2:2393563/1‑150 (MQ=255) tCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCGGCCAGGcgcg > 1:3049396/1‑86 (MQ=255) cGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCgggg < 2:4977671/142‑1 (MQ=255) gACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTgg > 1:725754/1‑150 (MQ=255) gACCTGGACCACCAGCGCAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTgg < 2:2319240/150‑1 (MQ=255) ccTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGc > 1:3325602/1‑150 (MQ=255) ccTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGc < 2:4592026/150‑1 (MQ=255) gACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGaa < 1:412364/150‑1 (MQ=255) gACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGaa > 2:3069978/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGc < 2:3439412/150‑1 (MQ=255) caccaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGcc > 2:3825721/1‑150 (MQ=255) accaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCg < 1:5086812/150‑1 (MQ=255) accaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCg < 2:2634930/150‑1 (MQ=255) ccaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGcggcgg > 2:4676137/1‑98 (MQ=255) ccaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGcggcgg < 1:4676137/98‑1 (MQ=255) ccaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTg > 2:2097198/1‑138 (MQ=255) caGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCACTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGAt > 1:2099087/1‑150 (MQ=255) gCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTc < 2:5112629/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCAc < 2:1090666/150‑1 (MQ=255) gcCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTg > 1:5166634/1‑150 (MQ=255) ccGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTgg > 2:223164/1‑150 (MQ=255) gtggGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTCTGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATc > 1:2565249/1‑150 (MQ=255) gtggGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATc > 1:2565451/1‑150 (MQ=255) gggCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATccc > 1:1618646/1‑150 (MQ=255) gggCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATccc > 1:497099/1‑150 (MQ=255) aGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACt > 2:1059996/1‑150 (MQ=255) ccGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtga < 2:512129/150‑1 (MQ=255) ccGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtga > 1:1517477/1‑150 (MQ=255) cgcgcgTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtgat < 1:917366/150‑1 (MQ=255) gcgcgTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtgatg > 1:665311/1‑150 (MQ=255) cgcgTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtgatga < 2:211223/150‑1 (MQ=255) gTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACg > 1:4560337/1‑150 (MQ=255) tCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCa > 1:2420422/1‑150 (MQ=255) gAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGc > 1:3495825/1‑150 (MQ=255) aGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTCTGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATGCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGcc > 2:4182593/1‑150 (MQ=255) aGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGcc < 1:5303925/150‑1 (MQ=255) aGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGcc < 1:3682347/150‑1 (MQ=255) tGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCGAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGa > 2:3593119/1‑150 (MQ=255) gACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaa < 2:1354208/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaacaa > 1:271661/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaacaa > 2:5396568/1‑150 (MQ=255) cGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaacaac < 2:3617114/150‑1 (MQ=255) cGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaacaac < 2:5414471/150‑1 (MQ=255) cGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaacaac < 2:5414286/150‑1 (MQ=255) cGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaacaac < 2:5414241/150‑1 (MQ=255) tgctTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTgc < 2:5202877/150‑1 (MQ=255) tgctTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGAGGAACGCAGCCTGGAACAACTgc > 1:3911851/1‑150 (MQ=255) ttGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGcc > 2:1657404/1‑150 (MQ=255) tgaaCGCGCCGGCCAGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAg > 2:833877/3‑150 (MQ=255) aaCGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtgat > 1:5012550/1‑121 (MQ=255) aaCGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtgat < 2:5012550/121‑1 (MQ=255) aaCGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTc > 2:2575256/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTc > 2:3548666/1‑150 (MQ=255) aCGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTcc < 1:3337123/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGa > 2:294029/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCt > 1:3442328/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtgatga > 1:3872945/1‑116 (MQ=255) cTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTg < 2:3495825/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGt < 1:4949865/150‑1 (MQ=255) | TGAGCAGTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTTCGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCCGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTG > NC_002947/2448870‑2449167 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |