| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,584,395 | T→A | 6.5% | F261Y (TTC→TAC) ‡ | PP_2263 → | sugar ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,584,395 | 0 | T | A | 6.5% | 653.9 / 24.3 | 199 | F261Y (TTC→TAC) ‡ | PP_2263 | sugar ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (92/94); new base A (6/7); total (98/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
GGTGAATGCCAAGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTAGAGCGACGGGGCTTTT > NC_002947/2584246‑2584544 | ggTGAATGCCAAGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCtt < 1:2136617/150‑1 (MQ=255) gTGAATGCCAAGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTc < 1:971173/150‑1 (MQ=255) gTGAATGCCAAGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTc < 1:1619051/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTg < 1:1125940/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTg > 1:3285952/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTgg < 1:5378152/150‑1 (MQ=255) cAAGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTggg > 1:5198445/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCCAGGGCGAAGCCCTTGGc < 2:4778207/150‑1 (MQ=255) aaGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGc > 1:67960/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGc > 2:1114357/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGc > 1:2020543/1‑150 (MQ=255) aGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGcc > 1:4283910/1‑150 (MQ=255) gCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCCAGGGCGAAGCCCTTGGcca < 2:5378393/150‑2 (MQ=255) gCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTc > 1:4229888/1‑139 (MQ=255) gCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTc < 2:4229888/139‑1 (MQ=255) gATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGgt < 1:3400365/150‑1 (MQ=255) gATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGgt < 1:1191040/150‑1 (MQ=255) gATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGgt < 1:5115088/150‑1 (MQ=255) 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gcgGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTgagga > 1:1721842/1‑150 (MQ=255) ggTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGaggagg < 1:3689855/150‑1 (MQ=255) tgatgaCCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGc < 1:920272/150‑1 (MQ=255) gaCCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAgcg > 2:366500/1‑150 (MQ=255) gaCCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAgcg > 2:2057438/1‑150 (MQ=255) cccGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTgg > 2:2704712/1‑126 (MQ=255) cGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATg < 1:4718507/150‑1 (MQ=255) cGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATg > 2:265774/1‑150 (MQ=255) cACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGa < 2:1394347/150‑1 (MQ=255) cGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGt < 1:3001837/150‑1 (MQ=255) gtgtCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTgg < 2:4845584/150‑1 (MQ=255) gtCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGAt < 1:5403488/150‑1 (MQ=255) tCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATg > 2:4002175/1‑150 (MQ=255) tCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGCGGCCCAGGGCGAAGCCCTTGGccac > 1:2525752/1‑118 (MQ=255) cGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATgg < 1:1865534/150‑1 (MQ=255) ggcatcgggcatcgACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCCTGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGc > 2:1244415/1‑150 (MQ=255) ggcatcgggcatcgACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGc > 1:2235628/1‑150 (MQ=255) gcatcgggcattgACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGcc > 1:190039/1‑150 (MQ=255) gcatcgggcatcgACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGcc < 1:954001/150‑1 (MQ=255) tcgggcatcgACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTgg > 1:769913/1‑150 (MQ=255) 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< 2:4283910/150‑1 (MQ=255) aTCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGaa < 1:3843622/150‑1 (MQ=255) ggTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGc < 2:240000/150‑1 (MQ=255) gTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCg > 1:2754961/1‑150 (MQ=255) tGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGcc < 1:5058511/150‑1 (MQ=255) gcgcAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGccc > 2:4318241/1‑150 (MQ=255) gcgcAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGCGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGccc < 1:263517/150‑1 (MQ=255) cgcAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGcagg > 2:4473404/1‑108 (MQ=255) aaTCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGc > 1:2447877/1‑150 (MQ=255) tCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGt > 1:1491243/1‑150 (MQ=255) acccggCCCAGGGCGAAGCCCTTGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTag > 2:600679/5‑150 (MQ=255) acccggCCCAGGGCGAAGCCCTTGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTag > 2:600807/5‑150 (MQ=255) aTGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTag > 1:2910657/1‑150 (MQ=255) tgtgGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTaga < 1:4579119/150‑1 (MQ=255) tgtgGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTaga < 2:5198445/150‑1 (MQ=255) ccggCCCAGGGCGAAGCCCTTGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTagag > 2:2637282/3‑150 (MQ=255) cAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTaga > 1:1773024/1‑144 (MQ=255) cAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTaga < 2:1773024/144‑1 (MQ=255) cAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTAGAGCGACg > 1:1372236/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTAGAGCGACGGGGCttt > 1:3095929/1‑150 (MQ=255) tCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTAGAGCGACGGGGCtttt < 1:1072472/150‑1 (MQ=255) | GGTGAATGCCAAGCCGATTGCCGCGGTGATGACCCGCACGGTGTCGGCATCGGGCATCGACTGGGGTGTGCTGGCGGCGGCGGGGGTGCTGACCATCTTGCCGGGCATGCTGGTGATCTGGTTCGTGCGCAATCATGTGGCCAAGGGCTTCGCCCTGGGCCGGGTGTGAGGAGGGCAGCGCATGGAGTGGATGGCCTGGACCCTGCCGACAGCGCTGTTCTTCGCCGCTGTGGGCCTGTTGCTGCTGGGCATGACCCTGCTTGAACTGCGTCGCCCCTGCGTAGAGCGACGGGGCTTTT > NC_002947/2584246‑2584544 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |