| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,889,517 | G→A | 5.4% | L373L (CTG→TTG) | PP_2542 ← | GntR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,889,517 | 0 | G | A | 5.4% | 286.3 / 4.5 | 92 | L373L (CTG→TTG) | PP_2542 | GntR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/46); new base A (2/3); total (43/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 | |||||||||||
CGCATCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCC > NC_002947/2889368‑2889663 | cgcATCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAg < 2:334582/150‑1 (MQ=255)cgcATCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAg < 1:471749/150‑1 (MQ=255)cgcATCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAg < 2:4270308/150‑1 (MQ=255) aTCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGgcg > 1:4901859/1‑150 (MQ=255) tCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGgcgc > 2:3393237/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCCGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCtg > 2:4073521/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCtt < 1:533924/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCtt < 2:3595878/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCtt < 2:334767/150‑1 (MQ=255) tCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTg < 2:640686/150‑1 (MQ=255) tCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTg > 2:2743790/1‑150 (MQ=255) tCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAAgcacctc > 1:526669/1‑145 (MQ=255) aCGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCt < 2:4441175/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCt < 2:4441485/150‑1 (MQ=255) cgcgGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCtt < 2:2896215/150‑1 (MQ=255) gCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTgcgc < 2:269716/150‑1 (MQ=255) aCTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCa < 1:5431519/150‑1 (MQ=255) tGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAAGCACCTCAAGCGCCTGCGCCAgc < 1:1876433/150‑1 (MQ=39) tCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAgcgc < 2:2808586/150‑1 (MQ=255) tCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAgcgc > 2:1330747/1‑150 (MQ=255) tCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAgcgc < 2:1478489/150‑1 (MQ=255) tCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAgcgc < 1:2545251/150‑1 (MQ=255) gggAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGCGGTGCTGGCGCCAGCGccc > 2:1192893/1‑150 (MQ=255) gggAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGccc > 1:4551357/1‑150 (MQ=255) gAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAAGCACCTCAAGCGCCTGCGCCAGCGcctgg < 1:2942787/150‑4 (MQ=38) cGCCTGATGGGGGGTCCTTTTTTAATTGCCTTCATCCTTTTGGGTTAAAAATTAAACGCCCAGTCTTTGCTGATGCCGGCAAAGTTCCTTATGCGCCTCGGCCAGGGGGTGGCGCTGGGGTTTGTGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCgat < 2:4280533/150‑1 (MQ=255) gCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCgatg > 1:2419669/1‑150 (MQ=255) ccGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTg > 2:2132484/1‑131 (MQ=255) ccGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTg < 1:2132484/131‑1 (MQ=255) ggATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATc > 2:962329/1‑150 (MQ=255) gATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATcg > 2:801173/1‑150 (MQ=255) gCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATcgccgc > 2:4381389/1‑150 (MQ=255) gggTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGGTGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCAt > 1:2203205/1‑150 (MQ=255) cctgATGTACTTGCCTACATCCGATTCGGTTAACAATTCAACGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCGTGATGCGCCTCGGCCCGGCGCGGGCGCTGGCGCTTGTGGTGCTGGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATacac < 1:5448358/147‑1 (MQ=255) aGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAAGCACCTCAAGCGCCTGCGCCa < 1:1373110/121‑1 (MQ=38) aGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAAGCACCTCAAGCGCCTGCGCCa > 2:1373110/1‑121 (MQ=38) aCATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCt > 1:4470022/1‑150 (MQ=255) ttGCCTTCATCCGTTTCGGTTAAAAATTAACAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGTTGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCTGGCGCTTGCGGTGCTGGCGCCCGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTcc < 1:2205034/149‑1 (MQ=255) cTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCa > 1:2445508/1‑150 (MQ=255) cTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCa > 2:5093834/1‑150 (MQ=255) cTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCa > 2:5093521/1‑150 (MQ=255) cTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCa > 1:5049082/1‑150 (MQ=255) cTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCGCCATCa > 1:4565074/1‑150 (MQ=255) aTCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTg > 1:3742371/1‑150 (MQ=255) tCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGc > 1:4506604/1‑150 (MQ=255) cGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCTGTCGATGCTTATGCGGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCTGGCGCTGGCGCTGGGGCTTGTGGTGCTTGCGCCTGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGa < 2:754415/150‑1 (MQ=255) cGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGa < 2:3999106/150‑1 (MQ=255) tGAACAATACAACGCCCCGTCGATGCTGAGGCCGGCCACCTTCCTGATGCGCCTCGGCCCGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCa < 1:4062272/150‑1 (MQ=255) aaCAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAgg > 2:3358923/1‑150 (MQ=255) ttCAACCCCCTGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGa < 2:4308327/150‑1 (MQ=255) cAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAgc < 2:2419669/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAgcg > 1:4744143/1‑150 (MQ=255) aaaGCCCAGTCGATGAAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGAAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAgcg > 2:3152740/1‑150 (MQ=255) aaGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCAATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAgcgc > 1:5319402/1‑150 (MQ=255) gCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCAt > 1:4273095/1‑150 (MQ=255) cccAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATc > 1:5081570/1‑150 (MQ=255) cAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGccc < 1:2133167/84‑1 (MQ=255) cAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGccc > 2:2133167/1‑84 (MQ=255) tgTCGTTGCAGTGGCCGGCCAACTTCCTGCGGCGCCTCGGCCTGGGGGTGGCGCAGGCGGTTGTGGTGCGGGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTc < 1:991619/149‑1 (MQ=255) tCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAg < 2:4810285/150‑1 (MQ=255) gcGATGCATATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCCGGCGCGGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCTGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAg < 1:1325302/149‑1 (MQ=255) aGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCTTACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTgcagc > 1:1617012/1‑150 (MQ=255) aGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTgcagc > 1:1617077/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGt > 1:1340656/1‑150 (MQ=255) ggCCACCTCCCTGCTGCGCCGCGGCCAGGCGGTGGCGCTGGCGCTTGCGGTGCTTGCGCCAGGGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGttttt < 2:1961161/150‑1 (MQ=255) 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cTTCCTGCTGCGCCTCGGCCCGGCGCTGGCGCCGGCGCTTGTGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCa < 2:362607/150‑1 (MQ=255) ttCCTGATGCGCCTCGGCCTGGGGCTGGCGCAGGCGCTTGATTTGTTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCCCGCGCTCCATCACCTGCGAGGTTGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAg < 1:373465/150‑1 (MQ=255) gATGCGCCTCGGCCTGGCGCTGGCGCTGGCGCTTGTGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCgg < 1:4073521/150‑1 (MQ=255) gATGCGCCGCGGCCCGGCGCGGGCGCGGGCGGTTGTGGTGCGGGCGCCTGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCAGCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCgg < 1:2657576/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCTCGGCCTGGGGGTGGCGCTGGCGTTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCggg < 1:1120904/149‑1 (MQ=255) aggcgcCTCGGCCCGGCGCTGGCGCCGGCGGTTTTGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCggg < 1:1791094/148‑1 (MQ=255) aTGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCTGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCggg < 2:1508001/150‑1 (MQ=255) gcCTCGGCCTGGCGCTGGCGCCGGGGCTTGTGGTGCTGGCGCCCGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCGCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTg < 2:1531771/150‑1 (MQ=255) gcCTCGGCCCGGGGGTGGCGCTGGCGCTTGTGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTg < 1:3393237/150‑1 (MQ=255) gcCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTg < 2:4755646/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTgg > 2:1073810/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCTGGCGCTGGCGCTGGCGGTTGTGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGc < 2:2866428/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGcc > 2:756805/1‑150 (MQ=255) cGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCa < 2:2822821/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGc < 2:3948049/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCTGGCGCTGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCa < 2:3699073/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGt < 1:1337890/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAg < 2:3856044/150‑1 (MQ=255) gcTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGc > 2:1335166/1‑150 (MQ=255) gcTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGc > 2:1335133/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAg > 1:5207718/1‑86 (MQ=255) tGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAg < 2:5207718/86‑1 (MQ=255) tGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCg > 1:4251207/1‑150 (MQ=255) gcAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGAccc > 1:1392754/1‑150 (MQ=255) gcAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGAccc > 1:4141079/1‑150 (MQ=255) | CGCATCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCC > NC_002947/2889368‑2889663 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |