| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,105,384 | C→T | 9.1% | F202F (TTC→TTT) | PP_2713 → | two‑component system response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,105,384 | 0 | C | T | 9.1% | 441.0 / 25.7 | 153 | F202F (TTC→TTT) | PP_2713 | two‑component system response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (71/68); new base T (7/7); total (78/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
AAAGAGTATGTGCTGTTGCATGAGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCTATAACTACCACGACAGCA > NC_002947/3105235‑3105531 | aaaGAGTATGTGCTGTTGCATGAGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTc > 1:5406191/1‑150 (MQ=255) gTATGTGCTGTTGCATGAGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACgg < 1:3954225/150‑1 (MQ=255) tATGTGCTGTTGCATGAGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGc < 2:1902209/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGCATGAGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGAt > 2:1167764/1‑150 (MQ=255) tGTTGCATGAGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTc < 1:417316/150‑1 (MQ=255) tGTTGCATGAGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTc > 1:1125006/1‑150 (MQ=255) cATGAGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACg > 2:4812202/1‑150 (MQ=255) aTGAGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACgg > 1:3151398/1‑150 (MQ=255) aGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTgc > 1:1249020/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGcgcg < 2:80271/150‑1 (MQ=255) cTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGa < 2:1026105/150‑1 (MQ=255) cacaGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTg < 2:1018253/150‑1 (MQ=255) acaGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTgg < 1:48233/150‑1 (MQ=255) acaGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTgg < 1:41956/150‑1 (MQ=255) acaGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTgg > 1:2342444/1‑150 (MQ=255) acaGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTgg > 2:5291641/1‑150 (MQ=255) gtgCAAGGTATTCACACGTGATCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGATAGCAACACTCTGGAGGTGTACATCTACCATTTGAGCAAGAAGCTGTTCAAAGGCCTGATTCTCACAGTGCGCGGAATTGGCTATCt < 2:306549/148‑1 (MQ=255) gggCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCt > 1:52230/1‑150 (MQ=255) gggCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCt < 1:4017027/150‑1 (MQ=255) ggTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGa < 2:4571265/150‑1 (MQ=255) ggTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGa < 1:4223108/150‑1 (MQ=255) ggTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGa < 2:4948988/150‑1 (MQ=255) gTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAg < 2:4653473/150‑1 (MQ=255) tATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATATGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAgg < 1:293896/150‑1 (MQ=255) aTTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTACAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGt < 2:549010/150‑1 (MQ=255) ttCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTc > 2:3820476/1‑150 (MQ=255) cacaCGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCaa > 2:2654797/1‑150 (MQ=255) acacGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAg < 2:3916580/150‑1 (MQ=255) cacGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTTAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAgg > 2:3921910/1‑150 (MQ=255) cacGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTTAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAgg > 2:2926336/1‑150 (MQ=255) cacGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTTAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAgg > 2:2926307/1‑150 (MQ=255) acGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGc < 2:4159289/150‑1 (MQ=255) aGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGAc < 1:1860072/150‑1 (MQ=255) gcCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTc > 1:487908/1‑150 (MQ=255) cTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTTAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGc > 2:4070900/1‑150 (MQ=255) gACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTTAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGGCGAGGTCATGCCTTGACCTCgacc < 1:83016/150‑4 (MQ=255) aCTCAACTGCTGTATGGCTTGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTc < 1:792022/150‑1 (MQ=255) aCTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTc < 1:2654797/150‑1 (MQ=255) aCTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTc < 1:2466967/150‑1 (MQ=255) aCTCAACTGCGGTAGGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACCCGCGGGAGGCGAACACCCACCAGTTGCGCACGAAGCTGTTCCACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCggcat < 2:1834073/150‑5 (MQ=255) tCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGc > 2:3668024/1‑150 (MQ=255) tCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGc > 1:4649212/1‑150 (MQ=255) aaCTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTTAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGACGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCa < 2:5227623/150‑1 (MQ=255) aaCTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTc > 2:1138326/1‑93 (MQ=255) aaCTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTc < 1:1138326/93‑1 (MQ=255) ctgctgTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCaca < 2:284988/150‑3 (MQ=255) tgctgTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAgcg > 2:2124029/1‑150 (MQ=255) tgctgTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAgcg > 2:3295608/1‑150 (MQ=255) tgctgTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAgcg > 2:841451/1‑150 (MQ=255) gctgTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAgcgc > 2:1548170/1‑150 (MQ=255) tgTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCAc > 2:1547279/1‑150 (MQ=255) gTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACg > 2:5015245/1‑150 (MQ=255) tATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGc > 1:2962541/1‑150 (MQ=255) gCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCtgtg > 2:233432/1‑150 (MQ=255) tGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTgg > 2:4251279/1‑98 (MQ=255) tGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTgg > 2:4251298/1‑98 (MQ=255) tGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTgg < 1:4251298/98‑1 (MQ=255) ggATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGgcgc < 2:529478/150‑1 (MQ=255) gAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGa > 2:420059/1‑150 (MQ=255) agagCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCGGTGCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGACTTGGCTCTCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGCTg > 2:4949543/1‑150 (MQ=255) cttgcagCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCtt > 2:2608161/6‑150 (MQ=255) gagaGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTtgc < 1:149868/150‑1 (MQ=255) agagCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCTTGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTtgct < 1:2165146/150‑1 (MQ=255) acacGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACt < 2:1183787/150‑1 (MQ=255) acGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAAGGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGTATTGGCTATCTGGTCGAGGTCATGGCATGACCTCGATTCGCCAGCGCTCGCTGTGGCGCGTGTTGCTCTTGCTGCTACTCg > 2:2268558/1‑150 (MQ=255) acGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCg < 2:2454766/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGt > 2:1296925/1‑150 (MQ=255) cTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTa < 1:4933004/150‑1 (MQ=255) ggAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTAcc > 1:4561403/1‑150 (MQ=255) gAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCg < 2:4817272/150‑1 (MQ=255) gTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCt < 1:719535/67‑1 (MQ=255) gTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCt < 1:719509/67‑1 (MQ=255) gTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCt > 2:719535/1‑67 (MQ=255) tGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCtt > 2:3157755/1‑150 (MQ=255) gAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTTAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTg > 1:3624915/1‑150 (MQ=255) gAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTg > 2:2856471/1‑150 (MQ=255) aaCATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGc > 2:2665429/1‑150 (MQ=255) aaCATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGc > 2:2665379/1‑150 (MQ=255) cATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTc < 1:1548170/150‑1 (MQ=255) cATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTc < 1:5015245/150‑1 (MQ=255) aTCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTcg > 1:4959226/1‑150 (MQ=255) tCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTcgc > 1:411795/1‑150 (MQ=255) cTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTcgcg > 1:3502305/1‑150 (MQ=255) tACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCgcgc > 2:1443495/1‑150 (MQ=255) tACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCgcgc > 1:1745293/1‑150 (MQ=255) tACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCgcgc > 2:3715450/1‑150 (MQ=255) tcggtGCGCAAGAAGCTGTTTAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGctct < 1:4204213/146‑1 (MQ=255) tcggtGCGCAAGAAGCTGTTTAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGctct < 1:4204277/146‑1 (MQ=255) cATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGctct < 1:3314845/150‑1 (MQ=255) aTTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCta > 1:4092547/1‑150 (MQ=255) aTTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCta > 1:4783431/1‑150 (MQ=255) tttGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCtat < 1:2646502/150‑1 (MQ=255) tttGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCtat < 2:645202/150‑1 (MQ=255) ttGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCtata < 1:1247644/150‑1 (MQ=255) cAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCTATAACTAc < 2:4880256/150‑1 (MQ=255) gaagCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCTATAACTACCAc < 1:131479/150‑1 (MQ=255) aagCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCTATAACTACCACg > 2:3564452/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCTATAACTACCACGAca < 1:3677020/150‑1 (MQ=255) tGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCTATAACTACCACGAcag > 2:1983704/1‑150 (MQ=255) tGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCTATAACTACCACGAcag > 1:1392210/1‑150 (MQ=255) | AAAGAGTATGTGCTGTTGCATGAGTTGCTGGCACAGCCGGGCAAGGTATTCACACGTGAGCGCCTGACTCAACTGCTGTATGGCTGGGATGAAGAGCCGGAGAGCAACACGCTGGAGGTGAACATCTACCATTTGCGCAAGAAGCTGTTCAACGGCCTGATTCGCACGGTGCGCGGAATTGGCTATCTGGTCGAGGTCAAGGCATGACCTCGCTTCGCCAGCGCACGCTGTGGCGCGTGATGCTCTTGCTGCTACTCGGTACCGGCTTGCTCGCGCTCTATAACTACCACGACAGCA > NC_002947/3105235‑3105531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |