| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,275,050 | C→G | 8.6% | A276G (GCC→GGC) | PP_2870 → | spermidine/putrescine‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,275,050 | 0 | C | G | 8.6% | 485.6 / 28.3 | 151 | A276G (GCC→GGC) | PP_2870 | spermidine/putrescine‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (67/71); new base G (6/7); total (73/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
CATGACCTCCACCTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGGCGCTGGCCAT > NC_002947/3274901‑3275197 | cATGACCTCCACCTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGc < 2:4170160/150‑1 (MQ=255) gACCTCCACCTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTa > 2:748283/1‑150 (MQ=255) gACCTCCACCTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTa > 2:1676869/1‑150 (MQ=255) ccTCCACCTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATg < 2:4871312/150‑1 (MQ=255) cTCCACCTACAGCGGACGAAGTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGc < 2:2016902/150‑1 (MQ=255) ccTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATc < 1:2967449/150‑1 (MQ=255) aCAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGc < 1:1070041/150‑1 (MQ=255) aGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCg > 2:628453/1‑150 (MQ=255) aGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCg < 2:4306419/150‑1 (MQ=255) aGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCg < 1:4239137/150‑1 (MQ=255) aGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCg < 1:3121223/150‑1 (MQ=255) aGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCg > 1:2626764/1‑150 (MQ=255) ggACGAAGTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGAt < 2:4492267/150‑1 (MQ=255) gACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATa < 2:810711/150‑1 (MQ=255) cGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATAcc < 2:1622643/150‑1 (MQ=255) gAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATAccc > 2:174257/1‑150 (MQ=255) aaTTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCa < 1:4690686/150‑1 (MQ=255) tGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGt < 1:269491/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTg > 1:5186469/1‑150 (MQ=255) ggTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCg > 1:926844/1‑150 (MQ=255) ggcggcGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTa < 2:5188361/150‑1 (MQ=255) gcggcgCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTAt < 2:1919412/150‑1 (MQ=255) ggcgCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTCTTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGCAtgt > 2:1208936/1‑150 (MQ=255) ggcgCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTAtgt > 2:2428522/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTAtgtg < 1:3276261/150‑1 (MQ=255) cgcAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTAGGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTgc < 1:5374319/150‑1 (MQ=255) gcagcaGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTgca < 1:3862865/150‑1 (MQ=255) gcagGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTgcagca < 1:3463914/150‑1 (MQ=255) gggCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGc > 2:3630770/1‑119 (MQ=255) gCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGc > 2:3264765/1‑117 (MQ=255) gCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGc < 1:3264823/117‑1 (MQ=255) gCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATAc > 2:5298903/1‑150 (MQ=255) gCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTACAGCAGATAc > 2:446485/1‑150 (MQ=255) cAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATAcc > 2:3477943/1‑150 (MQ=255) 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< 1:1323965/150‑1 (MQ=255) cGTTGTATGGCCTCGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGAACATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGccaac < 2:1472657/150‑1 (MQ=255) cGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGccaac < 2:2800374/150‑1 (MQ=255) cGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGccaac < 2:3194239/150‑1 (MQ=255) cGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGccaac < 2:2385470/150‑1 (MQ=255) cGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGccaac > 1:807981/1‑150 (MQ=255) gTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAAt > 1:4635700/1‑150 (MQ=255) tATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATa > 1:4801252/1‑150 (MQ=255) tATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATa < 2:4504289/150‑1 (MQ=255) tATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATa > 1:2482426/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCa > 2:2970947/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGAAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCa > 1:1668109/1‑150 (MQ=255) ccTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCATGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCaa < 1:1814930/150‑1 (MQ=255) ccTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGTCTGATTGCCTTTTCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGTTATGTGCAGCAGATACCCTATGTGCCAACCAATACCCaa < 1:2579480/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGc > 2:4225829/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGc > 1:459060/1‑150 (MQ=255) 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ttGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCt < 1:2702497/150‑1 (MQ=255) tGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTg < 1:1530485/150‑1 (MQ=255) tGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTg < 1:2308338/150‑1 (MQ=255) tGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTg < 1:1272554/150‑1 (MQ=255) gggCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTgg > 2:685831/1‑150 (MQ=255) 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caAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAGCTGGGt > 1:2034452/1‑150 (MQ=255) aaaGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGc < 1:2407132/119‑1 (MQ=255) aaaGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGc > 2:2407132/1‑119 (MQ=255) aaaGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTa > 1:1773320/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACt > 1:420360/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACt > 1:4581852/1‑150 (MQ=255) gcgGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTc < 1:268066/150‑1 (MQ=255) gcgGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTc < 1:377178/150‑1 (MQ=255) ggCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGc > 1:4877004/1‑150 (MQ=255) gCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGcc > 2:1462759/1‑150 (MQ=255) gCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGcc > 2:4564364/1‑150 (MQ=255) cATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCTGCAGATACCCTTTGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCca < 2:4181480/150‑1 (MQ=255) cGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGaa < 1:3027889/150‑1 (MQ=255) gACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTGTGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTg < 1:636445/120‑1 (MQ=255) gACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAAc > 2:1548230/1‑150 (MQ=255) cAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTg > 2:3462009/1‑150 (MQ=255) aGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGc < 2:5186469/150‑1 (MQ=255) aaGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAggg < 1:3877359/150‑1 (MQ=255) cGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGgcg > 1:4430276/1‑150 (MQ=255) ggCTGATTGGCATAGGCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAAt > 2:2340883/1‑74 (MQ=37) cTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACTGAACCTGCAAGGGGCGCTg < 1:3684867/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCACTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGGCGCTGGcc > 2:334254/1‑150 (MQ=255) ttGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGGCGCTGGCCa < 2:2626764/150‑1 (MQ=255) | CATGACCTCCACCTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGGCGCTGGCCAT > NC_002947/3274901‑3275197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |