| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,275,056 | C→G | 8.7% | A278G (GCC→GGC) | PP_2870 → | spermidine/putrescine‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,275,056 | 0 | C | G | 8.7% | 482.2 / 28.4 | 150 | A278G (GCC→GGC) | PP_2870 | spermidine/putrescine‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (67/70); new base G (6/7); total (73/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.33e-01 | |||||||||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CTCCACCTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGGCGCTGGCCATGAACGTGG > NC_002947/3274907‑3275205 | cTCCACCTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGc < 1:3370992/150‑1 (MQ=255)cTCCACCTACAGCGGACGAAGTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGc < 2:2016902/150‑1 (MQ=255) aCCTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAAt > 1:5334156/1‑150 (MQ=255) cTACAGCGGACGAATTGCGGTGGTGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCa > 2:4541482/1‑150 (MQ=255) aCAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGc < 1:1070041/150‑1 (MQ=255) aCAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGc < 1:4308238/150‑1 (MQ=255) cAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGcc < 1:4898637/150‑1 (MQ=255) aGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCg > 2:628453/1‑150 (MQ=255) aGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCg < 1:4239137/150‑1 (MQ=255) aGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCg < 1:3121223/150‑1 (MQ=255) aGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCg > 1:2626764/1‑150 (MQ=255) ggACGAAGTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGAt < 2:4492267/150‑1 (MQ=255) gACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATa < 2:810711/150‑1 (MQ=255) gAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATAccc > 2:174257/1‑150 (MQ=255) gAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATAccc < 2:1717316/150‑1 (MQ=255) tGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGt < 1:269491/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCg > 1:926844/1‑150 (MQ=255) ggcggcGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTa < 2:5188361/150‑1 (MQ=255) gcggcgCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTAt < 2:1919412/150‑1 (MQ=255) ggcgCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTCTTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGCAtgt > 2:1208936/1‑150 (MQ=255) ggcgCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTAtgt > 2:2428522/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTAtgtg < 1:3276261/150‑1 (MQ=255) cgcAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTAGGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTgc < 1:5374319/150‑1 (MQ=255) gcagcaGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTgca < 1:3862865/150‑1 (MQ=255) gcagGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTgcagca < 1:3463914/150‑1 (MQ=255) gggCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGc > 2:3630770/1‑119 (MQ=255) gCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGc < 1:3264765/117‑1 (MQ=255) gCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGc > 2:3264765/1‑117 (MQ=255) gCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTACAGCAGATAc > 2:446485/1‑150 (MQ=255) cAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATAcc > 2:3477943/1‑150 (MQ=255) aGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTgc > 1:4426253/1‑139 (MQ=255) aGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTgc < 2:4426253/139‑1 (MQ=255) gCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCt > 1:549889/1‑150 (MQ=255) gCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCt > 2:2011504/1‑150 (MQ=255) ccGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTa < 2:1577568/131‑1 (MQ=255) ccGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTa > 1:1577568/1‑131 (MQ=255) cGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATg < 1:1323965/150‑1 (MQ=255) cGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGccaac < 2:2800374/150‑1 (MQ=255) cGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGccaac < 2:3194239/150‑1 (MQ=255) cGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGccaac < 2:1472530/150‑1 (MQ=255) cGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGccaac < 2:2385470/150‑1 (MQ=255) gTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGccaacc > 1:4825549/1‑150 (MQ=255) gTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAAt > 1:4635700/1‑150 (MQ=255) tATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATa > 1:2482426/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCa > 2:2418096/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCa > 2:2970947/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGAAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCa > 1:1668109/1‑150 (MQ=255) ccTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGTCTGATTGCCTTTTCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGTTATGTGCAGCAGATACCCTATGTGCCAACCAATACCCaa < 1:2579480/150‑1 (MQ=255) ccTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGc < 1:3510679/150‑1 (MQ=255) tGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCa > 2:4093800/1‑150 (MQ=255) tACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAgg > 2:3684867/1‑150 (MQ=255) tACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAgg > 2:4126725/1‑150 (MQ=255) ggTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCtt < 2:4937287/150‑1 (MQ=255) tATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGa > 2:4828364/1‑150 (MQ=255) ggACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGAccc > 1:4797389/1‑150 (MQ=255) 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tGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTg < 1:2308338/150‑1 (MQ=255) tGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTg < 1:1272554/150‑1 (MQ=255) gggCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTgg < 1:88174/150‑1 (MQ=255) ggCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGc > 1:4625599/1‑150 (MQ=255) gATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGccca > 1:640425/1‑148 (MQ=255) atcaAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTgg < 2:5279099/150‑1 (MQ=255) atcaAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTgg < 1:2988757/150‑1 (MQ=255) atcaAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTgg < 2:2369463/150‑1 (MQ=255) atcaAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTgg < 1:469498/150‑1 (MQ=255) tcaAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTGTGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATgg > 1:1014079/1‑97 (MQ=255) tcaAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTgca > 2:512312/1‑82 (MQ=255) tcaAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTgca < 1:512312/82‑1 (MQ=255) tcaAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCgg < 2:3474717/135‑1 (MQ=255) tcaAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTggg > 2:2549682/1‑150 (MQ=255) tcaAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTggg > 2:4226683/1‑150 (MQ=255) caAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGcc > 1:4183520/1‑57 (MQ=18) caAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGcc < 2:4183520/57‑1 (MQ=18) caAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAGCTGGGt > 1:2034452/1‑150 (MQ=255) aaaGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTa > 1:1773320/1‑150 (MQ=255) aaGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTAc < 1:193062/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACt > 1:420360/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACt > 1:4581852/1‑150 (MQ=255) gcgGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTc < 1:268066/150‑1 (MQ=255) gcgGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTc < 1:377178/150‑1 (MQ=255) ggCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGc < 2:4251290/150‑1 (MQ=255) gCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGcc > 2:4564364/1‑150 (MQ=255) gCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGcc > 2:1462759/1‑150 (MQ=255) cATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCTGCAGATACCCTTTGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCca < 2:4181480/150‑1 (MQ=255) gACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTGTGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTg > 2:636445/1‑120 (MQ=255) gACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAAc > 2:1548230/1‑150 (MQ=255) aGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGc > 2:104718/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAggg < 1:3877359/150‑1 (MQ=255) aaGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAggg < 1:3019445/150‑1 (MQ=255) cGGCTGATTGGCATAGGCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGgcg > 1:4430276/1‑150 (MQ=255) ggCTGATTGGCATAGGCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAAt < 1:2340883/74‑1 (MQ=37) cTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACTGAACCTGCAAGGGGCGCTg < 1:3684867/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCACTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGGCGCTGGcc > 2:334254/1‑150 (MQ=255) ttGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGGCGCTGGCCa < 2:2626764/150‑1 (MQ=255) tGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGGCGCTGGCCAt < 1:748283/150‑1 (MQ=255) tATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGGCGCTGGCCATGacc > 1:4848032/1‑148 (MQ=255) | CTCCACCTACAGCGGACGAATTGCGGTGGCGGCGCAGCAGGGCAGCCCGTTGGCCGTGGTATGGCCTGGCAGCCTGTACGGTATGGACTATTGGGCGATCATCAAAGGCTCGCGGCATGTCGACCAGGCCAAGCGGCTGATTGCCTATGCCAATCAGCCGGATACCCAGGTGCGGTATGTGCAGCAGATACCCTATGGGCCAACCAATACCCAAGCCGCGGCCAGGCTTGACCCGGCGCTGGCCAACTGGGTACCCACTTCGCCACAGAACCTGCAAGGGGCGCTGGCCATGAACGTGG > NC_002947/3274907‑3275205 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |