Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,481,963 | G→C | 7.0% | S407R (AGC→AGG) ‡ | PP_3090 ← | OmpA domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,481,963 | 0 | G | C | 7.0% | 599.5 / 25.0 | 182 | S407R (AGC→AGG) ‡ | PP_3090 | OmpA domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (84/85); new base C (6/7); total (90/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
ACAGCACCAGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTAAGGGTTGGC > NC_002947/3481815‑3482112 | acaGCACCAGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCggctggc > 2:1821512/1‑150 (MQ=255) acaGCACCAGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCggctggc > 2:1269607/1‑150 (MQ=255) aCCAGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCg < 1:3412164/150‑1 (MQ=255) aCCAGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCg < 1:2393570/150‑1 (MQ=255) aCCAGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCg < 2:4427695/150‑1 (MQ=255) aCCAGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCg > 2:2133940/1‑150 (MQ=255) cAGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGACTGATCACTTTGCGGAACAGGCTGGTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGc > 1:4567042/1‑150 (MQ=255) cAGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGc > 1:2379314/1‑150 (MQ=255) aGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCATATGCTGGTCGGGAATGATCTCTTTGCGGAACTGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCAGCCAGCCGGcg < 2:3101518/150‑2 (MQ=255) aGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCa < 1:2183805/150‑1 (MQ=255) aGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCAGCCAGCCGGcg < 1:3658601/150‑2 (MQ=255) aGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCAGCCAGCCGGcg < 1:3658633/150‑2 (MQ=255) gTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGTGCCGGCAGCCAGCCGGcgc < 2:1461518/150‑3 (MQ=255) gTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCAGCCAGCCGGcgc < 2:716967/150‑3 (MQ=255) tGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGGACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGt < 2:3585478/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGt < 1:2425104/150‑1 (MQ=255) cgccAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGcc > 1:482548/1‑150 (MQ=255) gccAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACCGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGACTGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGccc > 1:4591784/1‑150 (MQ=255) gccAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGccc > 1:1582344/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCg > 1:3831480/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTACTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTAc > 2:3427955/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTAcc < 2:5277537/150‑1 (MQ=255) cggcggCGCCCAACCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGGTGGTGTACAGCGCCACCATATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGACGGCTGGCTGCCGGCATTGCCCGTACCtt < 1:1465459/150‑1 (MQ=255) ggcggcGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTc > 2:3642307/1‑150 (MQ=255) gcggcgCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCt > 1:74064/1‑150 (MQ=255) cggcgCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTg > 1:497493/1‑150 (MQ=255) cgcCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCgt < 1:2619661/150‑1 (MQ=255) cgcCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCgt < 2:4180887/150‑1 (MQ=255) gcCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCgtg < 1:3477538/150‑1 (MQ=255) gcCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGATGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCgtg < 2:1232907/150‑1 (MQ=255) cccacccaCCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCgtgt < 2:2678767/150‑1 (MQ=255) cacccaccCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTc < 2:1589397/150‑1 (MQ=255) acccacccGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCg > 2:5024629/1‑150 (MQ=255) cccacccGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGa < 1:877382/150‑1 (MQ=255) ccacccGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAg < 2:2880448/150‑1 (MQ=255) ccacccGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAg > 2:4867889/1‑150 (MQ=255) ccacccGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCAGGTGTACAGAGCCACCAAATGCTGGACGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAg > 2:5348797/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGcgcg > 2:2240278/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGaa < 2:2580170/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGc < 1:4087464/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGc < 1:10173/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTGGCTGGGGTACAGCGCCCCCAACTGCTGGTCGGGACTGATCACTGTGCGGACCAGGCTGTGGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTGCTGCGTGTGCGCGCGCGAcgcg > 2:3746977/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTc < 1:2352423/150‑1 (MQ=255) ccGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAACTGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGc < 2:332892/150‑1 (MQ=255) tggtTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCGGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCg < 2:963771/150‑1 (MQ=255) ggtTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGt < 1:1708410/150‑1 (MQ=255) tGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGc < 2:543518/150‑1 (MQ=255) ggTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGcc > 2:4021354/1‑150 (MQ=255) tACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCg < 1:2007021/123‑1 (MQ=255) aCAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACt > 1:1839169/1‑150 (MQ=255) aGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGa < 2:1856642/150‑1 (MQ=255) caccaAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtc > 2:3457245/1‑150 (MQ=255) caccaAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtc > 1:2531217/1‑150 (MQ=255) caccaAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtc > 2:1628566/1‑150 (MQ=255) accaAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtcg > 1:5135266/1‑150 (MQ=255) accaAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtcg > 2:3142188/1‑150 (MQ=255) caAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtcgtc < 2:476677/150‑1 (MQ=255) caAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtcgtc > 2:5389033/1‑150 (MQ=255) caAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTACCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtcgtc > 2:4655099/1‑150 (MQ=255) aaaTGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtcgtcg > 2:3911587/1‑150 (MQ=255) aaaTGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtcgtcg > 2:781401/1‑150 (MQ=255) aaaTGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtcgtcg > 1:3092066/1‑150 (MQ=255) aaaTGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtcgtcg > 2:3091561/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGc < 1:83617/150‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCt < 1:4679444/150‑1 (MQ=255) ggAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGcgcc < 1:4867889/150‑1 (MQ=255) aaTGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGcgccgc > 2:1097251/1‑150 (MQ=255) gATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGt < 2:2954633/150‑1 (MQ=255) gATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGt > 2:4050289/1‑150 (MQ=255) gATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGt > 1:5120115/1‑150 (MQ=255) gATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTACTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGt > 1:4419937/1‑150 (MQ=255) aTCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTg < 1:91933/150‑1 (MQ=255) tCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGa < 2:5321089/150‑1 (MQ=255) cACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGaa > 2:1154735/1‑150 (MQ=255) aCTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGaaa < 1:5287386/150‑1 (MQ=255) tttGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATa < 1:1069136/150‑1 (MQ=255) tttGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATa > 1:3065554/1‑150 (MQ=255) tttGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATa < 2:4591784/150‑1 (MQ=255) cGGAACAGGCTGTGGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGGACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGGTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGACGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATCGaaa < 1:2717468/150‑1 (MQ=255) gAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAAcc > 2:3032887/1‑150 (MQ=255) aCAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACcgc < 1:5389033/150‑1 (MQ=255) ttGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCAtt < 1:1800653/150‑1 (MQ=255) gatgaACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTc > 2:870277/1‑150 (MQ=255) gatgaACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTc > 2:580035/1‑150 (MQ=255) gatgaACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGGGAACTAGAAACCGCGCAGCATTTc > 2:3494411/1‑150 (MQ=255) gaACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCtcgt > 1:4052123/1‑104 (MQ=255) gaACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGc < 2:497493/150‑1 (MQ=255) aGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTc < 1:4264656/150‑1 (MQ=255) gcactgcCGGCAGCCAGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCt > 1:1257258/6‑150 (MQ=255) cggcgCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTg > 1:466405/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGt > 2:1484841/1‑150 (MQ=255) gcCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTaa < 2:3577738/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTAAgg > 2:1193580/1‑150 (MQ=255) cGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTAAgg < 1:1132317/150‑1 (MQ=255) gctggctgCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTAAGGGt < 2:3151361/150‑1 (MQ=255) gctggctgCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGGTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTAAGGGt < 1:535742/150‑1 (MQ=255) ctggctgCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTAAGGGtt < 2:4441901/150‑1 (MQ=255) tggctgCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTAAGGGTTg < 2:2406663/150‑1 (MQ=255) ggctgCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTAAGGGTTgg < 1:2133940/150‑1 (MQ=255) gctgCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTAAGGGTTGGc < 1:1154735/150‑1 (MQ=255) | ACAGCACCAGTGCCGCCAGGCCGGCGGCGCCCACCCACCCGGCCTTGCGCCGGCGTTCACGGTGGTTGCTGGTGTACAGCGCCACCAAATGCTGGTCGGGAATGATCACTTTGCGGAACAGGCTGTTGATGAACAGCGGCGCCGGCTGGCTGCCGGCAGTGCCCGTACCTTCTGCGTGTTCGAGCGCGAAGCGTTCGGCCACATGCTGGCCGTGGCAGCCCCACTGAGCCTCGTCGGCCTGCAGCGCCGCGGTGAAATAGAAACCGCGCAGCATTTCGGCATTCTGGTAAGGGTTGGC > NC_002947/3481815‑3482112 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |