| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 3,646,916 | 0 | A | G | 6.0% | 470.7 / 12.2 | 149 | intergenic (‑46/+20) | PP_3211/PP_3212 | ABC transporter ATP‑binding protein/Rieske 2Fe‑2S family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (74/66); new base G (5/4); total (79/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
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tggtgTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCTATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCtt > 1:4485481/1‑119 (MQ=255) tggtgTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTgcgg > 2:4613920/1‑150 (MQ=255) caacgCCCCGGTGCGCCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGAt < 1:4755520/118‑1 (MQ=255) caacgCCCCGGTGCGCCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCggg > 2:3090698/5‑150 (MQ=255) tATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGgt < 1:2839610/150‑1 (MQ=255) tATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGgt > 1:2953739/1‑150 (MQ=255) tATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGgt > 1:2953847/1‑150 (MQ=255) aacgCCCCGGTGCGCCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCa < 2:3725744/128‑1 (MQ=255) aTGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTgcgg < 2:2019513/144‑1 (MQ=255) aTGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTgcgg > 1:2019513/1‑144 (MQ=255) tGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGgtgt < 2:3069276/150‑1 (MQ=255) 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1:873738/1‑150 (MQ=255) cACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGACACAGGc < 2:5176149/150‑1 (MQ=255) cACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGACACAGGc < 2:58493/150‑1 (MQ=255) | TAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGACACAGGC > NC_002947/3646767‑3647064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |