Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 3,824,717 | C→T | 84.4% | M144I (ATG→ATA) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 3,824,717 | 0 | C | T | 84.4% | 398.1 / 53.1 | 162 | M144I (ATG→ATA) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (12/13); new base T (81/55); total (93/69) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.78e-01 |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
GGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGG > NC_002947/3824572‑3824862 | ggCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCa < 1:144932/150‑1 (MQ=255) ggCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGAACACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATCAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCa < 2:4824558/150‑1 (MQ=255) gTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGaa < 1:4953350/150‑1 (MQ=255) tCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCTCAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAg > 1:1017330/1‑150 (MQ=255) tCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAg > 1:1017092/1‑150 (MQ=255) cATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAgg > 2:3441774/1‑150 (MQ=255) tCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGgtg > 1:3363813/1‑150 (MQ=255) accaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTg < 1:3972929/150‑1 (MQ=255) accaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAAc > 2:2778462/1‑150 (MQ=255) ccaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACg > 1:4839213/1‑150 (MQ=255) agaagaACGCCCAGATCACGGCAGGTAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGGACGCt > 2:2012645/1‑150 (MQ=255) agaaCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCgg < 2:963675/150‑1 (MQ=255) gaaCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGc > 2:212257/1‑150 (MQ=255) gCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCgg < 1:961750/150‑1 (MQ=255) gCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCgg < 2:4644124/150‑1 (MQ=255) cccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCggg > 1:5217754/1‑150 (MQ=255) ccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGt > 1:5200711/1‑150 (MQ=255) ccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGt > 1:3275389/1‑150 (MQ=255) ccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGt > 1:3592224/1‑150 (MQ=255) gATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGaa > 2:5391059/1‑150 (MQ=255) gATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGaa < 1:4050189/150‑1 (MQ=255) aTCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAAc < 2:5032481/150‑1 (MQ=255) tCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAAcc > 2:5133096/1‑150 (MQ=255) 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ggcaggcCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGcac < 1:2107105/150‑1 (MQ=255) ggcaggcCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGcac < 1:2107176/150‑1 (MQ=255) caggcCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAg < 2:3068876/150‑1 (MQ=255) caggcCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAg < 2:3068906/150‑1 (MQ=255) aggcCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAAc < 1:4568191/138‑1 (MQ=255) 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ccGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGa > 1:1287883/1‑150 (MQ=255) ccGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGa < 2:3363813/150‑1 (MQ=255) ccGGGGTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGa < 2:479224/150‑1 (MQ=255) gggTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGAcc > 2:1050854/1‑150 (MQ=255) gggTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGAcc < 2:1230600/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |