Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,999,662 | T→G | 5.7% | L128V (TTG→GTG) | PP_3526 → | AraC family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,999,662 | 0 | T | G | 5.7% | 531.4 / 16.4 | 168 | L128V (TTG→GTG) | PP_3526 | AraC family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (81/77); new base G (3/7); total (84/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.29e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.94e-01 |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
CCTGGGGCTGGAACTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGCCAGCTTTACCCTCGACCG > NC_002947/3999514‑3999810 | ccTGGGGCTGGAACTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCtt < 2:3354053/150‑1 (MQ=255) ggCTGGAACTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGggcg < 1:2001281/150‑1 (MQ=255) ggCTGGAACTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGAGCCGCCCAAGGCCATGCCGTGggcg < 1:1509677/150‑1 (MQ=255) gCTGGAACTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCAAGGCCATGCCGTGggcgg < 2:3449808/150‑1 (MQ=255) cTGGAACTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGggcggc < 2:1313197/150‑1 (MQ=255) cTGGAACTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCAAGGCCATGCCGTGggcggc < 2:957764/150‑1 (MQ=255) cTGGAACTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCAAGGCCATGCCGTGggcggc < 1:1821316/150‑1 (MQ=255) tGGAACTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCAAGGCCATGCCGTGggcggcg < 1:1406441/150‑2 (MQ=255) aaCTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTtgt < 1:2225378/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTtgt < 2:3011187/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCAAGGCCATGCCGTGggcggcgcaa < 1:4902606/150‑5 (MQ=255) aaCTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGGACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTtgt < 1:518939/150‑1 (MQ=255) ggtggCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGaa > 2:1016615/1‑150 (MQ=255) gtggCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAAc > 2:4127373/1‑150 (MQ=255) gtggCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAAc < 1:2588111/150‑1 (MQ=255) ggCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACgg > 2:3549555/1‑150 (MQ=255) ggCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACgg > 2:742344/1‑150 (MQ=255) gCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGgc < 1:1045472/150‑1 (MQ=255) 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tCCGCTGCGGCGCTGCAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAACCGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCtt < 2:401222/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTgg > 1:2456531/1‑150 (MQ=255) gCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGc > 2:3834704/1‑150 (MQ=255) cTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGcc > 2:692396/1‑150 (MQ=255) gcTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCgg < 1:3681059/150‑1 (MQ=255) cTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCggg < 1:475344/150‑1 (MQ=255) cTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGGACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGAGTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCggg < 1:3203159/150‑1 (MQ=255) tGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCgggg < 2:1371245/150‑1 (MQ=255) tGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACAACTCAAGTACACGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCTCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACTGCGCCTGGTTCCTTGTCCGTGCCgggg > 1:4461792/1‑150 (MQ=255) aaGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGAGTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTg > 2:4453484/1‑150 (MQ=255) aGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGc < 1:1548439/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTg < 2:2456531/150‑1 (MQ=255) gCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGga < 1:742344/150‑1 (MQ=255) cTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGgac < 1:4834924/150‑1 (MQ=255) tGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGgacg > 1:3959038/1‑150 (MQ=255) agACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGgacga > 1:4325197/2‑150 (MQ=255) ccTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTa > 1:1659826/1‑150 (MQ=255) ctgctgGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTAc > 1:1028903/1‑150 (MQ=255) tgctgGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACg < 2:5166870/150‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACg < 2:1215809/150‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACg < 1:3569552/150‑1 (MQ=255) tggtggTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGtt > 1:1752362/1‑150 (MQ=255) tggtggTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGtt > 1:1752553/1‑150 (MQ=255) gtggtCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTgc < 1:2997236/150‑1 (MQ=255) tggtCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGATCTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCAGGGGTGCTGGACGACTACGGTTgca < 1:3659260/150‑1 (MQ=255) ggtCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTgcag < 1:1189276/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATc > 2:4525258/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATc > 1:636424/1‑150 (MQ=255) cgcggcgGCTTGCGCACACCACGCCACTACCCGGACCTCGATCGCCAGCTCACCGCTTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTAGTGGAACGGCGCCTGGGGCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACAACGGTTGCAGCATc < 2:1511788/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGa < 1:4994153/150‑1 (MQ=255) 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gCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCaca > 2:3914993/1‑148 (MQ=255) gCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCg > 2:2727169/1‑150 (MQ=255) cTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGc > 2:3129311/1‑150 (MQ=255) tAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCa > 1:2694995/1‑150 (MQ=255) aaaCGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCAt < 1:1644531/150‑1 (MQ=255) aaCGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATc > 1:2432557/1‑150 (MQ=255) aaCGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATc > 1:1720623/1‑150 (MQ=255) aCGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAAAGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGAAGCATCCACCCCGAGCAACGTGACAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCa > 2:1444404/1‑150 (MQ=255) gATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCAcc > 1:5096131/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCAcccc < 1:4294765/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCAcccc < 2:2348412/150‑1 (MQ=255) acaagccgccCAAGGCCATGCCGTGGGCGGCTTATGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCAcccc > 1:4564625/5‑150 (MQ=255) cgccgcCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGc > 2:210944/1‑150 (MQ=255) ccgccCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGCCa > 2:3727029/1‑150 (MQ=255) aCGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGCCAGCTTTa > 1:1870328/1‑150 (MQ=255) cGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGCCAGCTTTAc < 1:921192/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGCCAGCTTTACCCTCGa < 1:692396/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGCCAGCTTTACCCTCGa < 1:4836613/150‑1 (MQ=255) gCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGCCAGCTTTACCCTCGAc < 2:663945/150‑1 (MQ=255) ccTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGCCAGCTTTACCCTCGAcc > 2:4712258/1‑150 (MQ=255) ccTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGCCAGCTTTACCCTCGAcc < 2:5396118/150‑1 (MQ=255) | CCTGGGGCTGGAACTGGTGGCCACCGAGCTGTCCGCTGCGGCGCTGAAGGAGCTGGACCTGCTGGTGGTCTGCGGCGGCTTGCGCACACCACTCAAGTACCCGGAACTCGATCGCCTGCTAAACGATTGCGCCGCCCACGGCATGGCCTTGGGCGGCTTGTGGAACGGCGCCTGGTTCCTTGGCCGTGCCGGGGTGCTGGACGACTACGGTTGCAGCATCCACCCCGAGCAACGTGCCAGCCTGTCGGAGCGCAGCCCGCAAACCCGCATCACCCCGGCCAGCTTTACCCTCGACCG > NC_002947/3999514‑3999810 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |