| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,070,657 | T→G | 8.6% | S125R (AGC→CGC) | mdtC ← | multidrug transporter membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,070,657 | 0 | T | G | 8.6% | 537.6 / 27.3 | 168 | S125R (AGC→CGC) | mdtC | multidrug transporter membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (87/66); new base G (10/5); total (97/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
CTCCCCTACCCCCGACACCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCGTGGTGACGCCG > NC_002947/4070508‑4070805 | cTCCCCTACCCCCGACACCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCAtgct < 1:5072700/150‑1 (MQ=255) tCCCCTACCCCCGACACCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCAtgctg > 1:3020619/1‑150 (MQ=255) cccTACCCCCGACACCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTgcg > 1:2534778/1‑150 (MQ=255) cccccGACACCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGc < 2:880539/150‑1 (MQ=255) cccccGACACCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGc < 2:3882980/150‑1 (MQ=255) ccccGACACCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGcc > 2:620145/1‑150 (MQ=255) ccGACACCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCAc > 1:4312807/1‑150 (MQ=255) gACACCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTg < 2:2023884/150‑1 (MQ=255) cacCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGCTCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTggg < 2:1221992/150‑1 (MQ=255) acCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGTGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGgc > 2:2100493/1‑150 (MQ=255) acCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGgc < 1:5021619/150‑1 (MQ=255) acCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGgc < 2:4655363/150‑1 (MQ=255) ccTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGgca < 2:2931431/150‑1 (MQ=255) cTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGgcag > 1:1865256/1‑150 (MQ=255) cTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGgcag > 1:530402/1‑150 (MQ=255) tGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGgcagc > 1:3630100/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGt > 1:3057555/1‑150 (MQ=255) ggCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGc > 1:523292/1‑150 (MQ=255) ggCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGc > 1:523409/1‑150 (MQ=255) ctctGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCgg < 1:1941159/150‑1 (MQ=255) tctGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCggg > 2:1944064/1‑150 (MQ=255) tgtgAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTa < 1:4757999/150‑1 (MQ=255) tgtgAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTa > 2:1127030/1‑150 (MQ=255) gtgAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAg < 1:1328236/150‑1 (MQ=255) tgAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGc > 1:4523083/1‑150 (MQ=255) tgAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGc < 2:4523083/150‑1 (MQ=255) aaaGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGt > 1:3044094/1‑150 (MQ=255) ggATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGa < 1:3124526/150‑1 (MQ=255) aTGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGT‑GGCATGCGCAGCATGcccaccta > 2:399125/1‑118 (MQ=255) gtCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATcgccgc > 2:1319514/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTg > 1:2690609/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTg < 2:3868940/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGa > 1:1035374/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGaa < 2:1887744/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGaa < 1:1039919/150‑1 (MQ=255) gTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGgcagca < 2:3088950/116‑1 (MQ=255) gTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGgcagca > 1:3088950/1‑116 (MQ=255) aTACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACg > 2:2965124/1‑150 (MQ=255) aTACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACg > 2:2965070/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTg > 2:4021467/1‑150 (MQ=255) gCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGcc > 1:4193167/1‑150 (MQ=255) cTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGAt < 2:412604/150‑1 (MQ=255) cTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGAt < 2:3494378/150‑1 (MQ=255) cTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGAt < 2:1974747/150‑1 (MQ=255) tGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATg < 1:4492063/150‑1 (MQ=255) acaTCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACgg < 1:353787/150‑1 (MQ=255) acaTCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCGCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACgg > 2:1655079/1‑150 (MQ=255) tcgtggtgTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGcc > 2:4158045/8‑150 (MQ=255) tCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGccc > 2:2570202/1‑150 (MQ=255) ccGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGgcagc < 1:3256992/86‑1 (MQ=255) ccGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCa > 2:2019078/1‑150 (MQ=255) cGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGAATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCaa > 1:910873/1‑150 (MQ=255) gAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAAc > 1:1948296/1‑150 (MQ=255) tCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGaa > 2:5274477/1‑111 (MQ=255) tCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGaa < 1:5274477/111‑1 (MQ=255) tCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGACCCAACTCGa > 2:822612/1‑150 (MQ=255) aGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAg < 2:4412488/150‑1 (MQ=255) cAGCACCCTGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGAt < 2:3258583/150‑1 (MQ=255) cAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGAt < 2:2902162/150‑1 (MQ=255) aCCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACt > 1:265486/1‑150 (MQ=255) cATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTAc > 1:482369/1‑150 (MQ=255) cATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTAc > 2:520495/1‑150 (MQ=255) cATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTAc < 2:4178213/150‑1 (MQ=255) cATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTAc > 1:2944628/1‑150 (MQ=255) cATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTAc > 1:849308/1‑150 (MQ=255) aTGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTAcc > 1:3281976/1‑150 (MQ=255) aTGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTAcc > 1:2129148/1‑150 (MQ=255) tGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTAccc < 1:454611/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGaa < 2:2494749/93‑1 (MQ=255) gcgcCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGAc > 1:3787055/1‑139 (MQ=255) gcgcCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGAc < 2:3787055/139‑1 (MQ=255) gcgcCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCg > 2:368552/1‑150 (MQ=255) ccTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAAc > 2:1721873/1‑150 (MQ=255) tGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAAccc < 1:2430802/150‑1 (MQ=255) cGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGtt < 2:2542764/150‑1 (MQ=255) gTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGa > 2:519500/1‑150 (MQ=255) tcttctTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAgctgc > 1:4364134/1‑150 (MQ=255) tcttctTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAgctgc > 2:3252003/1‑150 (MQ=255) tcgtcttGTAGGTGGGCATGCGGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGa < 1:2058740/142‑1 (MQ=255) cttcttGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAgctgct > 1:4160328/1‑150 (MQ=255) tcttGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTgg > 1:4087704/1‑150 (MQ=255) tcttGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTgg < 1:368552/150‑1 (MQ=255) cttGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGt < 2:482369/150‑1 (MQ=255) ttGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTg > 2:101034/1‑150 (MQ=255) tGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCTCCATCGATGTCCCGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGa < 1:4789394/150‑1 (MQ=255) gTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATcgccgcaac < 1:166636/63‑4 (MQ=255) gTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCt < 1:3934418/76‑1 (MQ=255) ccagtggCATGCGCAGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGaa > 2:5394973/6‑103 (MQ=255) ccagtggCATGCGCAGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGaa < 1:5394973/98‑1 (MQ=255) ggTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCgt > 1:4070808/1‑150 (MQ=255) cagtggCATGCGCAGCATGCCGCTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCgt > 1:841344/5‑150 (MQ=255) cagtggCATGCGCAGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCgt > 2:4604100/5‑150 (MQ=255) tggCATGCGCAGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCgtggt > 2:4608467/2‑150 (MQ=255) tggCATGCGCAGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCgtggt > 1:2591005/2‑150 (MQ=255) gggCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCgtggt < 2:530402/150‑1 (MQ=255) gggCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCgtggt < 1:728792/150‑1 (MQ=255) gCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCCGCTGGTGAGCGTGGTGa > 2:4471013/1‑150 (MQ=255) cATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCGTGGTGAc > 1:2520980/1‑150 (MQ=255) cATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCGTGGTGAc > 1:4426703/1‑150 (MQ=255) ctgcGCATGCCACTGGGCAACAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCGTGGTGACGCCg > 1:1564938/1‑150 (MQ=255) | CTCCCCTACCCCCGACACCTGAGCCAGGCTCTGTGAAAGGATGGTGTCGGCCAGGTCATACAGCTGGCCTTTCTGCAACACATCCGAAGTCAGCGACAGCACCATGATCGGCGCCTGCGACGGGTTGATCTTCTTGTAGGTGGGCATGCTGCGCATGCCACTGGGCAGCAGGTTGCGGGTAGCGTTGATCGCCGCTTGAACCTCACGGGCTGCGCCATCGATGTCACGGCCCAACTCGAAGCCGATGACTACCCGTGTCGAACCCTGGTTGGAGCTGCTGGTGAGCGTGGTGACGCCG > NC_002947/4070508‑4070805 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |