| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,291,403 | 0 | C | A | 5.2% | 575.6 / 14.0 | 171 | L1050L (CTG→CTT) | PP_3761 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (87/75); new base A (6/3); total (93/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.12e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TGCTGGCGGATCAGGCGGGTGGCCTCGAAGCCGTCCATCTCCGGCATCATCACGTCCATCAGCACCAGGTCGATATCGTCGTGCTGCTCCAGGCGCTCGATGGCTTCGCGCCCGTTGCGGCCGATTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGACCTTGTGCAGGAAC > NC_002947/4291254‑4291550 | tGCTGGCGGATCAGGCGGGTGGCCTCGAAGCCGTCCATCTCCGGCATCATCACGTCCATCAGCACCAGGTCGATATCGTCGTGCTGCTCCAGGCGCTCGATGGCTTCGCGCCCGTTGCGGCCGATTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTcc < 2:5017773/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGATCAGGCGGGTGGCCTCGAAGCCGTCCATCTCCGGCATCATCACGTCCATCAGCACCAGGTCGATATCGTCGTGCTGCTCCAGGCGCTCGATGGCTTCGCGCCCGTTGCGGCCGATTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCa < 1:278432/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGATCAGGCGGGTGGCCTCGAAGCCGTCCATCTCCGGCATCATCACGTCCATCAGCACCAGGTCGATATCGTCGTGCTGCTCCAGGCGCTCGATGGCTTCGCGCCCGTTGCGGCCGATTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAg > 1:3261212/1‑150 (MQ=255) 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> 2:754960/1‑112 (MQ=255) ccGTTGCGGCCGATTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGAcgt < 1:4099869/150‑1 (MQ=255) gCGGCCGATTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGAcgttcgtt < 2:710350/150‑1 (MQ=255) gCCGATTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGa < 1:3353010/150‑1 (MQ=255) gCCGATTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGa > 1:4880914/1‑150 (MQ=255) gCCGATTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGa < 2:521213/150‑1 (MQ=255) aTTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCTCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGc < 2:4045310/150‑1 (MQ=255) tCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGc > 1:3571356/1‑150 (MQ=255) gACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTGCGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGa > 2:3375413/1‑150 (MQ=255) gACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGa < 1:679518/150‑1 (MQ=255) aCAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGAt < 2:5336283/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCg < 1:252199/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGc > 2:1838863/1‑116 (MQ=255) tGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGa < 1:1025812/150‑1 (MQ=255) cagcgcCCTGGAGCACAAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGa > 1:4911894/3‑150 (MQ=255) cagcgcCCTGGAGCACAAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGa > 2:5444383/3‑150 (MQ=255) ggCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGAc > 2:2401342/1‑150 (MQ=255) gcgcCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGAcc > 1:4481695/1‑150 (MQ=255) gcCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGACCtt > 1:1734697/1‑150 (MQ=255) gcCCTGGAGCACAAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACa < 1:1026670/134‑1 (MQ=255) gcCCTGGAGCACAAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACa > 2:1026670/1‑134 (MQ=255) gtgCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGACCTTGTGCAg < 1:5028914/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGACCTTGTGCAGGaa > 2:600224/1‑150 (MQ=255) tCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGACCTTGTGCAGGAAc > 2:5388765/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTgcgcgc > 1:4303707/1‑91 (MQ=255) | TGCTGGCGGATCAGGCGGGTGGCCTCGAAGCCGTCCATCTCCGGCATCATCACGTCCATCAGCACCAGGTCGATATCGTCGTGCTGCTCCAGGCGCTCGATGGCTTCGCGCCCGTTGCGGCCGATTTCGACAATGGCGCCCTTGTGCTCCAGGGCGCTGGTCAGGGCAAAGATATTACGCACATCGTCGTCCACCAGCAGCACCTTGCGGCCCTCGAACACCTTGTCGCGGCTGCGCGCGGTCTTGAGCATGCGTTGACGTTCGTTGGACAGCTGCGATTCGACCTTGTGCAGGAAC > NC_002947/4291254‑4291550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |