| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,342,047 | A→G | 31.3% | intergenic (+66/‑265) | ribAB‑II → / → PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,342,047 | 0 | A | G | 31.3% | 139.4 / 70.0 | 94 | intergenic (+66/‑265) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/27); new base G (19/10); total (56/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGG > NC_002947/4341901‑4342193 | ccgcTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGa < 1:3749431/147‑1 (MQ=255)ccgcTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGa > 2:3749431/1‑147 (MQ=255) cTGAAATACGCGGGGCTGGCGGTCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGAcaccac < 1:2368199/150‑1 (MQ=255) cTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGAcaccac < 1:4758384/150‑1 (MQ=255) gAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCg > 2:4978416/1‑150 (MQ=255) gAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCg < 2:185837/150‑1 (MQ=255) aaTACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGAc < 1:4146922/150‑1 (MQ=255) gcgGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCAtt < 1:2172756/150‑1 (MQ=255) gggCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTcgc < 2:2688199/150‑1 (MQ=255) gggCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTcgc < 1:2857142/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCCCGCATTcgc‑g < 1:3631985/150‑1 (MQ=37) ggCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTcgc‑g < 1:1376718/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCACTTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑gg < 2:4358302/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑gg < 1:3724075/150‑1 (MQ=25) gCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑gg < 2:1426633/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑gg < 1:3536475/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑gg < 2:4099128/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑gg < 1:3536372/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑ggg < 1:973143/150‑1 (MQ=25) gggCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAAc < 1:3635714/150‑1 (MQ=255) gggCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAAc < 2:2136519/150‑1 (MQ=255) ggCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAAcc < 2:3959904/150‑1 (MQ=25) cTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGGTTAACCCCCCAAT‑CG‑‑CG‑GGTGACACCACCCCCCCAATCGC‑GGGTAAAaccc > 2:4571179/1‑149 (MQ=255) tGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTTTACCCGcga < 2:3961197/150‑3 (MQ=255) tGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCCCCAATTCG‑‑GG‑GGGGACAACACCCCCCCCATCGCGGGGTAAAccccgc > 1:3636943/1‑147 (MQ=255) ggtggtggtGCCGAGCACCCCGTGCGACCGGGGGTGGGTTGGCTGAGAACACACAAGCAATTTTTGTCGCGGGGCCCTGTGGGCGC‑GGTTTCCCCGGCTATTGGG‑‑TG‑GGTGACACCACCGACGAATTCGG‑GGTAAAACCCGCTCCTACAg < 2:3925790/147‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTTCCCGCCAATGGG‑‑GG‑GGTGGCACCACCGACGCATTAGC‑GGGTAAAACCGCTCCGACAggg > 2:1232560/1‑150 (MQ=255) gCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGGTTTACCCCCG‑ATGCG‑‑AG‑GGGGGCACCAACCACGCAAAAGC‑GGGTCAAACCCCACCAACACGGccccggg > 2:199312/1‑146 (MQ=255) gCAGAGCATCCCGGTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑gg > 2:89442/1‑123 (MQ=18) gCAGAGCATCCCGGTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑gg < 1:89442/123‑1 (MQ=18) ccGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGGGGCACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCACCGACAGGGCCCGGGGTGCTTTTGTCAGGGCGGAg > 2:3588345/1‑150 (MQ=37) cTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑gg > 2:761864/1‑90 (MQ=255) cTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑gg < 1:761864/90‑1 (MQ=255) gacaaCACACCCGAACTTGATTTCGGGGGCCCCTTTTGGAGG‑GGGTTTCCCCGCGAAGGGG‑‑GG‑GGTGCCACCCCCGACGATTTGGG‑GGTTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGccc < 2:190057/147‑1 (MQ=255) aTTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTAACCCCGAAAGAG‑‑AG‑GGTGAAACCACCCACGCATTCGC‑GGGTAAAACCCCACCAACAGGGCCCCTGGTGGATTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCCGGAGCCCCAAACCGCTTTCCcaaaac > 2:2699114/1‑148 (MQ=19) ggTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGata > 1:5418654/1‑150 (MQ=25) ggTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATcc > 1:2806267/1‑150 (MQ=255) ggTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATcc > 2:3926899/1‑150 (MQ=255) gTTTACCCGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATccc > 1:140123/1‑150 (MQ=25) gTTTACCCGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATacc > 1:3974091/1‑150 (MQ=21) gTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCa > 1:3451849/1‑108 (MQ=255) gTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCa < 2:3451849/108‑1 (MQ=255) tttACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAGTCCCATAATATGATATCCCg > 2:3169737/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAg > 1:565383/1‑150 (MQ=25) aCCCGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAg > 1:565431/1‑150 (MQ=25) cccGCGATTGCG‑‑TG‑GGTGACACCACCGACGCTTTGGG‑GTTTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGa < 1:3588345/150‑1 (MQ=255) cccGCGACTGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACCGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGa > 2:2496703/1‑150 (MQ=255) cccGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGa > 1:4224442/1‑150 (MQ=25) cccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGa > 1:1725614/1‑150 (MQ=255) cccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGa > 2:2496795/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 2:1341186/1‑122 (MQ=21) ccGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 1:1341186/122‑1 (MQ=21) ccGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGata < 1:4624337/140‑1 (MQ=25) ccGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGata > 2:4624337/1‑140 (MQ=25) ccGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 1:4782699/1‑150 (MQ=25) ccGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 2:25202/1‑150 (MQ=25) ccGCGAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATACCGTAGAc > 2:1724384/1‑150 (MQ=25) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 2:3961119/122‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 2:5075315/122‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 1:1202751/1‑122 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 2:1202751/122‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 2:1202551/122‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 1:1202551/1‑122 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 1:3961119/1‑122 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 1:5075315/1‑122 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 1:5201030/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 2:2014869/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 2:3992653/1‑150 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ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 1:1523056/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 2:2844371/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 2:991272/1‑150 (MQ=255) cgcgAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAcc > 2:726084/1‑150 (MQ=25) gcgAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt > 1:3336702/1‑119 (MQ=18) gcgAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt > 1:3336701/1‑119 (MQ=18) gcgAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt < 2:3336701/119‑1 (MQ=18) gcgAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt < 2:3336702/119‑1 (MQ=18) gcgAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTa > 1:4972035/1‑145 (MQ=25) gcgAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTa < 2:4972035/145‑1 (MQ=25) gcgAATGCG‑‑TC‑GGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCt > 1:540276/1‑150 (MQ=25) gcgAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCTGTAGACCt > 2:4688124/1‑150 (MQ=255) gcgAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCt > 2:3784634/1‑150 (MQ=255) gcgAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCt > 1:1964256/1‑150 (MQ=255) gcgAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCt > 2:5345712/1‑150 (MQ=255) gAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTg > 2:4633580/1‑150 (MQ=255) gAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTg > 2:5416776/1‑150 (MQ=255) tGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGt < 2:4149317/150‑1 (MQ=255) g‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 1:438965/112‑1 (MQ=255) g‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 2:438965/1‑112 (MQ=255) gTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAgg > 1:5375539/1‑150 (MQ=255) tGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGa < 1:1780916/140‑1 (MQ=255) tGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGa > 2:1780916/1‑140 (MQ=255) | CCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑AG‑GGTGACACCACCGACGCATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGG > NC_002947/4341901‑4342193 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |