Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,017,883 | A→T | 5.3% | intergenic (‑176/+58) | PP_5679 ← / ← PP_4421 | hypothetical protein/aminotransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,017,883 | 0 | A | T | 5.3% | 433.9 / 10.4 | 131 | intergenic (‑176/+58) | PP_5679/PP_4421 | hypothetical protein/aminotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (58/65); new base T (3/4); total (61/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.53e-01 |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GAGATGAATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTCGTGACAAGAGGAG > NC_002947/5017735‑5018032 | gagatgaATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTaaa > 1:3967729/1‑150 (MQ=255) tgaATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTTGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCgg < 2:524530/150‑1 (MQ=255) aaTACGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTTATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTTTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCggg < 2:3048379/150‑1 (MQ=255) aaTAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCggg > 2:5348104/1‑150 (MQ=255) tacgcccgcccCGGTATCCGGCGGGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGTACTGTATCTTACCCGAAAGTAGGTCCTTGTGAACTGTTTACAGCTTCTGGGCTTTTATTGTTTTAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCt < 1:1351790/147‑1 (MQ=255) gCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACAAAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTa > 2:4310412/1‑150 (MQ=255) gCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTTTAGGCGGGCtttt < 1:2051957/150‑3 (MQ=255) ccGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCATTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTaaaa < 2:1987696/150‑1 (MQ=255) cGCCCCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTGCCGGGCCTTGGACAGTATCTGCCCCGAACGTACGGCCTTGTGCCCTGATGACCGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTTTAGGCGGGCttttttt < 2:4377701/150‑6 (MQ=255) aCCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGaa > 2:2186442/1‑150 (MQ=255) aCCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAAAGaa > 2:10780/1‑150 (MQ=255) aCCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGAGGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGaa < 2:1816858/150‑1 (MQ=255) cGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAaga < 1:1019057/150‑1 (MQ=255) gTCTCCGGGGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAATTTACGTCCTTGTTAACTTATGACAGCGTCTTGGCTTTTATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAgg < 2:3869948/150‑1 (MQ=255) gTCTCCGGGGCGGGATTTTACTTGCCGGGCCTTGGACAGTATCGGACCCGAAATTACTTCCTTGTGAACTGTTGACAGCGTCTTGGCTTTTATTTTGATCGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAgg < 1:3052521/150‑1 (MQ=255) gTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAATTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAgg < 1:2729525/150‑1 (MQ=255) gTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAgg < 1:4447117/150‑1 (MQ=255) gTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAgg > 2:4551177/1‑150 (MQ=255) gTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAgg < 2:3869958/150‑1 (MQ=255) gTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAgg > 2:4551200/1‑150 (MQ=255) gcgcGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGACGAGGGTAATTc > 2:4844751/1‑150 (MQ=255) cgcgGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCa < 1:193708/150‑1 (MQ=255) gCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTgg < 1:2035854/150‑1 (MQ=255) ttttACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGca > 1:2927866/1‑150 (MQ=255) ttACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGcatc > 2:5124224/1‑150 (MQ=255) aCTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGcatcat > 1:1885563/1‑150 (MQ=255) tttCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAATCCCGCCAAAAGGCGGGCTTAAAAAGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTg > 1:4123181/1‑150 (MQ=255) tttCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTg < 2:1780330/150‑1 (MQ=255) tttCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTg < 1:698049/150‑1 (MQ=255) ttCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGc < 2:2548168/150‑1 (MQ=255) gggCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAAc > 2:2956772/1‑150 (MQ=255) ccTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTGAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGtg > 2:4101844/1‑149 (MQ=255) cattGGACATTATCTCACCCCAAATTACGTCCTTGTTAAATCATGACAGCTTCTTGGATTTGATTGTGATACCACTAA‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGtt < 1:1776214/148‑1 (MQ=255) ttGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACTTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGa < 1:3349242/150‑1 (MQ=255) ttGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTTTAGGCGGGCtttttt > 1:3781485/1‑107 (MQ=255) ttGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGa < 1:4106347/150‑1 (MQ=255) ttGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGAt < 2:2203663/150‑1 (MQ=255) tGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGAt > 1:3066383/1‑150 (MQ=255) tgACAGTATCTTACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACAAAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGAt < 2:1521926/149‑1 (MQ=255) cAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCt < 1:1062364/150‑1 (MQ=255) gTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCa < 2:1430513/150‑1 (MQ=255) gTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCa < 1:2633740/150‑1 (MQ=255) cTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGAcc > 1:1197752/1‑150 (MQ=255) cTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGAcc < 1:1175560/150‑1 (MQ=255) tGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACTAAGAGGGTAATACAGCTGGCATCATTGCAAAATTTGATGGCTCAGAcat > 2:2732502/1‑148 (MQ=255) gACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACAAAAAAAAAAAAGCCCGCCTTTAGGCGGGCtttt > 2:2305328/1‑95 (MQ=255) gACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTACAAAAAAAAAAAAGCCCGCCTTTAGGCGGGCtttt < 1:2305328/97‑3 (MQ=255) aCCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCt > 2:3027215/1‑116 (MQ=255) aCCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTc < 2:1111261/150‑1 (MQ=255) cccGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCTTATTGGCTTTTATTGTTATAGAACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGTCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCa < 2:318573/150‑1 (MQ=255) cccGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTTATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCa < 2:318591/150‑1 (MQ=255) cGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGc < 1:2947706/150‑1 (MQ=255) aGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCtcat < 2:730633/150‑1 (MQ=255) aCGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAATACCCCCAAAAGGCGGGCTGAAAAAGAAGAGGGGGATTAAGCTGGCAGCATATACAACGATGATGTCTCAGACCTACTGCTCATCaa > 1:644817/1‑150 (MQ=255) ccTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGAc < 2:2999108/150‑1 (MQ=255) cTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑‑AAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCt < 2:3647207/150‑1 (MQ=255) gtgAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTc > 1:1370428/1‑150 (MQ=255) aaCTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCCGCTCATCAAGGACGCTCAGc > 2:3926086/1‑150 (MQ=255) tgatgaCAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGcaca > 1:3312373/1‑150 (MQ=255) aggaCAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTCC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGc < 1:5380017/148‑1 (MQ=255) aCAGCGTCATGGCCTTGATTGTGACAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAACGGCGGGCTTAAAACCAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTc < 2:3034603/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGAt > 2:4958602/1‑107 (MQ=255) cAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGAt < 1:4958602/107‑1 (MQ=255) aGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCgt > 1:1416812/1‑150 (MQ=255) aGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCgt > 1:3980675/1‑150 (MQ=255) gCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCgtgt < 1:1178964/150‑1 (MQ=255) tCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGc > 2:719575/1‑150 (MQ=255) ttGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGa < 2:34632/150‑1 (MQ=255) cTTGGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCt < 2:4648717/150‑1 (MQ=255) ttGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCtga < 1:4551200/150‑1 (MQ=255) ttGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCtga < 1:4551177/150‑1 (MQ=255) tGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCtgat < 1:4844751/150‑1 (MQ=255) tGATTGTGATAGCACTAC‑‑AAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCtgatg > 1:758719/1‑150 (MQ=255) gATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCtcatc > 2:1210085/1‑113 (MQ=255) ttGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCgtg < 1:3737758/135‑1 (MQ=255) ttGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCgtg > 2:3737758/1‑135 (MQ=255) tAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTc < 1:538040/150‑1 (MQ=255) aC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTcc > 1:4706015/1‑150 (MQ=255) aC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTcc > 1:4706479/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaaaaaGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGGAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGAACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTg > 1:3336836/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaaaGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGtt < 1:1033262/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaaGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTc > 1:427724/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaGCCCGCCTAAAGGCGGGCATAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCg < 1:5348104/150‑1 (MQ=255) ttttaaGCCCGCCTTTAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCgg > 1:4976488/5‑150 (MQ=255) aaaaaaGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCgg > 2:3681151/1‑150 (MQ=255) aaaaaGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGt > 2:2142638/1‑150 (MQ=255) aaaaGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTc > 2:1516745/1‑150 (MQ=255) gCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACGTCCTGTTCGGTCGTGa < 2:1671212/150‑1 (MQ=255) cccGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTCGTGAc < 1:3981627/150‑1 (MQ=255) ccGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTgatgat < 2:1284176/122‑1 (MQ=255) ccGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTgatgat > 1:1284176/1‑122 (MQ=255) ccGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTCGTGACa > 1:3207898/1‑150 (MQ=255) cGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTCGTGACaa < 1:4310412/150‑1 (MQ=255) gCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTCGTGACAag > 1:4100548/1‑150 (MQ=255) tAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTCGTGACAAgagg > 1:1459346/1‑150 (MQ=255) aaaGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGcaca > 1:2523199/1‑93 (MQ=255) aaaGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGcaca < 2:2523199/93‑1 (MQ=255) aaaGGCGGGCATAACACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTCGTGACAAgagga < 2:3422290/150‑1 (MQ=255) aaGGCGGGCTTAAAACGAAGATGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACTCTCATCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTCGTGACAAgaggag < 2:1058426/150‑1 (MQ=255) aaGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGCCCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTCGTGACAAgaggag < 2:3101753/150‑1 (MQ=255) | GAGATGAATAAGCCCGCACCGGTCTCCGGCGCGGGCTTTTACTTTCCGGGCCTTGGACAGTATCTGACCCGAAAGTACGTCCTTGTGAACTGATGACAGCGTCTTGGCTTTGATTGTGATAGCACTAC‑AAAAAAAAAAAGCCCGCCTAAAGGCGGGCTTAAAACGAAGAGGGTAATTCAGCTGGCATCATTGCCAACGTTGATGGCTCAGACCTTCAGCTCATCAAGGACGCTCAGCACAGCTTCGTGTGCGATGCTGATGATGCGATCCACTTCCTGTTCGGTCGTGACAAGAGGAG > NC_002947/5017735‑5018032 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |