| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,282,906 | 0 | G | C | 5.6% | 348.6 / 8.0 | 107 | intergenic (+69/+69) | trmA/pcaG | tRNA/tmRNA (uridine(54)‑C5)‑methyltransferase TrmA/protocatechuate 3,4‑dioxygenase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (55/46); new base C (3/3); total (58/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GCATCGAGCGCTGTGCATTGTTTGACCAGTTCCCGTATACCCACCATATGGAGAGTGGGGTTCTGCTGGTTCGGCGCTGATCGTTGTATTGCCGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCGACATTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTCTTCCCATCCACTTC > NC_002947/5282758‑5283052 | gCATCGAGCGCTGTGCATTGTTTGACCAGTTCCCGTATACCCACCATATGGAGAGTGGGGTTCTGCTGGTTCGGCGCTGATCGTTGTATTGCCGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCGACATTGATCGGCGTCgg > 1:2566160/1‑150 (MQ=255) aTCGAGCGCTGTGCATTGTTTGACCAGTTCCCGTATACCCACCATATGGAGAGTGGGGTTCTGCTGGTTCGGCGCTGATCGTTGTATTGCCGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCGACATTGATCGGCGTCGgtg > 2:4495703/1‑150 (MQ=255) aGCGCTGTGCATTGTTTGACCAGTTCCCGTATACCCACCATATGGAGAGTGGGGTTCTGCTGGTTCGGCGCTGATCGTTGTATTGCCGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCGACATTGATCGGCGTCGGTGTACg < 2:2566160/150‑1 (MQ=255) 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ccGCTCCCACATTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATAACAAAGCGGTAc < 2:797777/150‑1 (MQ=255) gCTCCGACATTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGaa > 2:4587241/1‑96 (MQ=255) gCTCCGACATTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGaa < 1:4587241/96‑1 (MQ=255) cGACATTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTc > 2:3704969/1‑150 (MQ=255) cGACATTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTc > 2:114104/1‑150 (MQ=255) aCATTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGc < 1:1871542/125‑1 (MQ=255) aCATTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTACCCCCTGAATGc > 2:1871542/1‑125 (MQ=255) cttggctCGGGGTGGGTTTACGCTGTTCGTGTTTGGCGGGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTCTTc < 1:982228/144‑1 (MQ=255) aTTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTCTTcc > 2:587625/1‑150 (MQ=255) aTTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTCTTcc > 1:1055253/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTCTTCCCATcc > 1:3216473/1‑150 (MQ=255) cGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGc > 1:3236473/1‑63 (MQ=255) cGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGc < 2:3236473/63‑1 (MQ=255) gCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAATAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTCTTCCCATCCACt > 1:4445360/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTCTTCCCATCCACTTc > 1:3052590/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTCTTCCCATCCACTTc > 1:3052130/1‑150 (MQ=255) | GCATCGAGCGCTGTGCATTGTTTGACCAGTTCCCGTATACCCACCATATGGAGAGTGGGGTTCTGCTGGTTCGGCGCTGATCGTTGTATTGCCGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCGACATTGATCGGCGTCGGTGTACGCAGATCGTTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGCAGAGCGGCCCCAAGCTTCACCTCAGAAGTCGAAGAAGACGGTCTCCCCTTCCCCCTGAATGCGGATATCAAAGCGGTACGCCGTCTTCCCATCCACTTC > NC_002947/5282758‑5283052 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |