| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,289,816 | G→C | 5.1% | S158R (AGC→AGG) | PP_4660 ← | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,289,816 | 0 | G | C | 5.1% | 659.9 / 18.1 | 196 | S158R (AGC→AGG) | PP_4660 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (81/105); new base C (2/8); total (83/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TGAGCGTGGCGTAGCGGCCAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTGGCGGCGGAACTCGCCAATCCAGGGCA > NC_002947/5289667‑5289964 | tGAGCGTGGCGTAGCGGCCAGTTATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTTCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAgg < 2:4816431/150‑1 (MQ=255)tGAGCGTGGCGTAGCGGCCAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAgg < 2:4796935/150‑1 (MQ=255) tGGCGTAGCGGCCAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTgcgc < 1:5356895/150‑1 (MQ=255) tGGCGTAGCGGCCAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTgcgc < 1:1513935/150‑1 (MQ=255) gCGTAGCGGCCAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTgcgcgc > 2:5136648/1‑150 (MQ=255) gTAGCGGCCAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGt > 1:681861/1‑150 (MQ=255) aGCGGCCAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGc < 2:3808874/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAgg < 2:2962582/150‑1 (MQ=255) cAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTg < 2:441696/150‑1 (MQ=255) cAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTg > 2:3292403/1‑150 (MQ=255) aGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGCCTGCACGCGCGCAGCCTgg < 2:2219243/150‑1 (MQ=255) aGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGCCTGCACGCGCGCAGCCTgg < 1:2087922/150‑1 (MQ=255) aGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGCCTGCACGCGCGCAGCCTgg < 1:3731336/150‑1 (MQ=255) gTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGa < 1:2941255/150‑1 (MQ=255) gTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGa < 2:545450/150‑1 (MQ=255) cttGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTc < 2:3789486/149‑1 (MQ=255) aTTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTc < 2:375067/150‑1 (MQ=255) ttGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCg < 2:2589615/150‑1 (MQ=255) gAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGc < 1:2331773/150‑1 (MQ=255) gCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCa > 2:2476813/1‑150 (MQ=255) gCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCa > 1:4011550/1‑150 (MQ=255) tCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGctct > 1:2138487/1‑150 (MQ=255) aGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTcc < 1:4332125/150‑1 (MQ=255) aGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTcc > 1:147053/1‑150 (MQ=255) aGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGCCTGCACGCGCGCAGCCTg > 2:2255303/1‑133 (MQ=255) ggCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGc < 1:3417661/150‑1 (MQ=255) cTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCgg < 1:2846378/150‑1 (MQ=255) cTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCgg < 1:3946437/150‑1 (MQ=255) tGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGa > 2:66747/1‑150 (MQ=255) aaGCAGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATc > 2:4688241/1‑150 (MQ=255) aGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCg > 1:997834/1‑150 (MQ=255) ccGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGcc < 1:1616589/150‑1 (MQ=255) gCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACAt > 2:898180/1‑150 (MQ=255) aGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCa < 2:3986558/150‑1 (MQ=255) aGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCa < 1:881461/150‑1 (MQ=255) aGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCa > 2:5349257/1‑150 (MQ=255) aGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCa > 1:635641/1‑150 (MQ=255) aGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCa < 1:881316/150‑1 (MQ=255) aGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCa < 1:3476169/150‑1 (MQ=255) aGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGtgc < 1:3026827/150‑1 (MQ=255) aGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGtgc > 1:1322381/1‑150 (MQ=255) gTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGtgct < 2:3004332/150‑1 (MQ=255) gTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGtgct < 2:5062533/150‑1 (MQ=255) gTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGtgct < 2:5207864/150‑1 (MQ=255) ggTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGtgctct < 2:1201280/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGtgctctg > 1:4985683/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGtgctctg < 1:1728099/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCca > 1:4513260/1‑150 (MQ=255) cAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCcag > 1:2255957/1‑150 (MQ=255) gTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCcagcag < 2:3459231/150‑1 (MQ=255) tCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGTAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAgg > 2:3894234/1‑150 (MQ=255) tCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAgg < 2:2436846/150‑1 (MQ=255) ccTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGt < 2:212397/150‑1 (MQ=255) ccTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGt < 1:5144933/150‑1 (MQ=255) ccTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGt < 1:2105547/150‑1 (MQ=255) cTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTc > 2:104902/1‑150 (MQ=255) cTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTc > 1:1539544/1‑150 (MQ=255) tCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCg > 1:136629/1‑150 (MQ=255) cGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCga < 1:4706355/150‑1 (MQ=255) gACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCgat < 2:2871890/150‑1 (MQ=255) gACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCgat < 2:3173644/150‑1 (MQ=255) gACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCgat < 2:4559111/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCgatga > 1:4377652/1‑150 (MQ=255) tGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATc < 1:4766700/150‑1 (MQ=255) ccGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAg < 2:4985683/150‑1 (MQ=255) cGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGTCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAgg < 2:743303/150‑1 (MQ=255) gTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGgt > 2:2291169/1‑150 (MQ=255) gCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGt > 2:369548/1‑118 (MQ=255) gCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGt < 1:369548/118‑1 (MQ=255) cgtgccgtgcTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGgtcgtc < 1:2239226/150‑1 (MQ=255) cgtgccgtgcTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGgtcgtc < 2:2787180/150‑1 (MQ=255) cgtgccgtgcTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGgtcgtc < 1:427958/150‑1 (MQ=255) gtgcTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGtt < 1:252353/150‑1 (MQ=255) gtgcTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGtt < 1:5268218/150‑1 (MQ=255) gtgcTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGtt < 2:4620546/150‑1 (MQ=255) gtgcTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGtt < 1:3310257/150‑1 (MQ=255) ctCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTc < 1:2631759/150‑1 (MQ=255) cAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGCCTGCACGCGCGCAGCCTgggt > 2:1800266/1‑65 (MQ=25) cAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGCCTGCACGCGCGCAGCCTgggt < 1:1800266/67‑3 (MQ=25) cAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTACACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAg > 2:743988/1‑150 (MQ=255) gTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTc > 1:5223483/1‑150 (MQ=255) gTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTc < 1:3386130/150‑1 (MQ=255) tAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCg < 1:1945379/150‑1 (MQ=255) ggACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCt < 2:135940/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTgg < 1:3581068/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTgg < 1:4279158/150‑1 (MQ=255) gCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTAc > 2:2568689/1‑150 (MQ=255) ccAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACt > 1:2749600/1‑150 (MQ=255) cAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTg < 2:309773/150‑1 (MQ=255) ccTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTggcggc < 2:3336311/150‑1 (MQ=255) cTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTGgcggcg > 1:1062465/1‑150 (MQ=255) ggACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTGGCGGCGGAACTCg > 2:1375749/1‑150 (MQ=255) tGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTGGCGGCGGAACTCGCCaa > 2:2020351/1‑150 (MQ=255) tGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTGGCGGCGGAACTCGCCaa > 1:4244916/1‑150 (MQ=255) cAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAg > 2:1011718/1‑92 (MQ=255) cAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAg < 1:1011718/92‑1 (MQ=255) cAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTGGCGGCGGAACTCGCCAATc < 1:1717065/150‑1 (MQ=255) aaCCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTGGCGGCGGAACTCGCCAATcc < 1:1084212/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTGGCGGCGGAACTCGCCAATCCAggg < 2:117362/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTGGCGGCGGAACTCGCCAATCCAg > 1:1008105/1‑148 (MQ=255) | TGAGCGTGGCGTAGCGGCCAGTGATTGAGCGACTCAGGTTGGCTGAAGCCGAGCAGACAGTGGTTGGCCAGGTCCTCGACCTGCCGTGGCGTGCCGTGCTGCTCCAGGTAGGCCGGACTGGCCAGCACCTGCACCGGACTGCAACCCAGGCTGCGCGCGTGCAGGCTGGAGTCGGCCAGCTCTCCGATGCGGATCGCCACATCAGTGCTCTGCTCCAGCAGGTCGATGATCAGGTCGTCGGTGTTGAGCTCCAGTTCGATGCCTGGGTACTGGCGGCGGAACTCGCCAATCCAGGGCA > NC_002947/5289667‑5289964 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |