| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 334,840 | C→A | 5.4% | intergenic (‑153/+135) | PP_0276 ← / ← PP_t73 | Cro/CI family transcriptional regulator/tRNA‑Thr |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 334,840 | 0 | C | A | 5.4% | 654.8 / 17.7 | 197 | intergenic (‑153/+135) | PP_0276/PP_t73 | Cro/CI family transcriptional regulator/tRNA‑Thr |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (88/98); new base A (8/3); total (96/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
TTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGAGCCTTTTTTGATACTGCGTATGGTGCCGGCACCA > NC_002947/334692‑334988 | ttGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTgcg < 1:5262807/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAg < 1:3062341/150‑1 (MQ=255) tCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGcc > 1:4003176/1‑150 (MQ=255) cAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCGCAGCAGccccaa < 2:735875/150‑4 (MQ=255) aGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCg < 1:4854161/150‑1 (MQ=255) gAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGc > 1:2265962/1‑150 (MQ=255) aaTATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAg < 2:2717736/150‑1 (MQ=255) tCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCaa > 2:4238747/1‑150 (MQ=255) tCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCaa > 2:1848306/1‑150 (MQ=255) tAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGc > 2:5339300/1‑150 (MQ=255) tAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGc > 1:3908991/1‑150 (MQ=255) tAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGc > 1:4238020/1‑150 (MQ=255) tAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGc > 1:4613569/1‑150 (MQ=255) tAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGc > 2:4955032/1‑150 (MQ=255) ttGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTc < 2:582908/150‑1 (MQ=255) tGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTcc < 2:1059943/150‑1 (MQ=255) cGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTa < 1:1315783/150‑1 (MQ=255) gATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTac > 2:547119/1‑150 (MQ=255) tttaaTCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTaca < 2:4029708/147‑1 (MQ=255) aTAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTaca > 1:155932/1‑150 (MQ=255) gTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCg > 2:5199956/1‑150 (MQ=255) gtgtGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCgtgg > 1:3182282/1‑150 (MQ=255) ggATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTcc > 1:4338571/1‑132 (MQ=255) aTTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGAtt > 1:4877154/1‑150 (MQ=255) tggttggCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCa < 1:5079063/150‑1 (MQ=255) tggttggCGAGTCAAAGCGATTGTGGTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCGAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCa < 1:17434/150‑1 (MQ=255) ggttggCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAg < 1:964742/150‑1 (MQ=255) ggttggCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAg < 2:3269378/150‑1 (MQ=255) gttggCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAgg < 2:2990476/150‑1 (MQ=255) ttggCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAggg > 2:23564/1‑150 (MQ=255) gAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGGTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTAAACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATcc > 1:4959897/1‑150 (MQ=255) gAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATcc < 1:1445720/150‑1 (MQ=255) gAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATcc > 2:4249920/1‑150 (MQ=255) gAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATcc < 1:1979446/150‑1 (MQ=255) tCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTa > 2:4556337/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTaa < 2:1673848/150‑1 (MQ=255) cAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTaa < 2:5288794/150‑1 (MQ=255) aaaGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCgtggtg > 1:1629480/1‑131 (MQ=255) aaaGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAg > 2:2791514/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAg > 2:507105/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAg > 1:2472358/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAg > 2:4401380/1‑150 (MQ=255) tttGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAggg > 2:4573267/1‑150 (MQ=255) ttGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGAtt < 1:3788281/128‑1 (MQ=255) ttGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGa < 1:1004601/150‑1 (MQ=255) tgtgTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGAt < 1:4556337/150‑1 (MQ=255) ttGGAGCTTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAg < 1:2997946/150‑1 (MQ=255) ttGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAg < 2:226226/150‑1 (MQ=255) ggAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAggg > 1:2771926/1‑150 (MQ=255) agagTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCt < 1:3732064/150‑1 (MQ=255) gtgtCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCggg < 1:2492439/150‑1 (MQ=255) gtgtCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCggg < 1:509119/150‑1 (MQ=255) gtgtCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCggg < 2:3837770/150‑1 (MQ=255) gtCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGAGCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCggggg > 2:2038780/1‑150 (MQ=255) tCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCgggggg > 2:1494680/1‑150 (MQ=255) tCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAAGTGCTTCTGCTTGGGGTTGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCgggggg < 1:3248762/150‑1 (MQ=255) tCTGTTTCTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCgggggg > 1:3472239/1‑150 (MQ=255) gTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGaaa < 2:2862356/150‑1 (MQ=255) tttttGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGaaaa < 1:1981847/150‑1 (MQ=255) gAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACaaaa < 2:3770648/150‑1 (MQ=255) gAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACaaaa < 1:5113460/150‑1 (MQ=255) aGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGATTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGAGTCAGGGCATCCGAAAGGCAGGGATGGAGGGCTGCGGGGGCAAAACaaaaa > 2:4922479/1‑150 (MQ=255) cTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAg < 1:1800164/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAgg < 1:716668/150‑1 (MQ=255) tGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAg < 1:2845532/112‑1 (MQ=255) tGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTAAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCAc > 1:1750041/1‑150 (MQ=255) tGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTAAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCAc > 1:1750174/1‑150 (MQ=255) ggTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCAcc > 1:621652/1‑150 (MQ=255) cAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCgg > 2:333536/1‑150 (MQ=255) agagAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGt > 1:2549873/1‑150 (MQ=255) agagAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGt > 2:4909568/1‑150 (MQ=255) agagAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGt < 1:3619660/150‑1 (MQ=255) gagaATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTg > 2:3332120/1‑150 (MQ=255) agaTTTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGa < 1:4573267/150‑1 (MQ=255) agaATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCTAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGTCATCCGTAAGGCAGGGATTGCGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGa < 1:4922479/150‑1 (MQ=255) agaATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTaa < 1:2076221/97‑1 (MQ=255) agaATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGa > 1:4728195/1‑150 (MQ=255) agaATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGa < 1:2898491/150‑1 (MQ=255) gCTTCTGCTTGGTGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCTCACCGAAAGGTGGGCCttt < 2:5114514/150‑1 (MQ=255) ttCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGAGCCttttt > 2:2364003/1‑150 (MQ=255) tCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCGGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGTGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGAGCCtttttt < 1:2025182/150‑1 (MQ=255) cTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGAGCCTTTTTTg < 1:4434354/150‑1 (MQ=255) gCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGAGAGCCTTTTTTGAt > 2:5368811/1‑150 (MQ=255) ggggTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCTCACCGAAAGGTGGGCCTTTTTTgttttcc < 1:5339300/150‑7 (MQ=38) gggTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGAGCCTTTTTTGATACTGc < 2:3472239/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ctgcGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGt > 1:882565/1‑116 (MQ=255) tgcGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGAGCCTTTTTTGATACTGCGTATGGTGCCGGCAcc > 2:644686/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCACACCTTTCGGTGAGCCTTTTTTGATACTGCGTATGGTGCCGGCACCa < 2:4877154/150‑1 (MQ=255) | TTGCCTCGGCAGAAATATCTAAAATTTGCGATAAATCGTAGTGTGGATTGGTTGGCGAGTCAAAGCGTTTGTGTTGGAGAGTGTGTCTGTTTTTGAGCTGTGCTGGTGATCAGAGAATTGCTTCTGCTTGGGGTGGTTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATCGCAGGCAAGCCAGCTCCTACACCGATCGTGGTGGATTCAGGGCATCCGTAAGGCAGGGATTGAGGGCTGCGGGGGGAAAACAAAAAAGGCCCACCTTTCGGTGAGCCTTTTTTGATACTGCGTATGGTGCCGGCACCA > NC_002947/334692‑334988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |